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刘锦
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
辽宁师范大学
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发文基金:
辽宁省教育厅高等学校科学研究项目
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相关领域:
自动化与计算机技术
生物学
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合作作者
韦丽华
辽宁师范大学计算机与信息技术学...
寇秋波
辽宁师范大学计算机与信息技术学...
李文举
辽宁师范大学计算机与信息技术学...
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辽宁师范大学...
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1篇
2013
1篇
2012
共
2
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基于特征融合的植物启动子识别算法研究
基因序列识别作为生物信息学中一个重要的研究领域,主要应用计算机仿真技术模拟实验进行判别。启动子作为基因序列的重要调控元件,主要调节转录和翻译。因此,启动子识别是基因序列识别中的一个重要研究内容,具有十分重要的理论研究意义...
刘锦
关键词:
结构特征
TATA-BOX
SVM分类器
粗糙集
文献传递
基于碱基偏好分析和SVM的植物启动子识别
被引量:2
2012年
植物启动子识别是真核启动子识别中的重要研究领域.针对目前植物启动子识别算法的特异性较低的问题,提出了一种基于GC碱基偏好分析和支持向量机(SVM)的植物启动子识别算法.首先通过对GC含量的分析将DNA序列分类为GC偏好序列和非GC偏好序列,然后进行结构特征和信号特征的提取,最后通过SVM分类器进行启动子识别.SVM分类器由四个SVM子分类器组成,即启动子-3’UTR子分类器,启动子-5’UTR子分类器,启动子-Intergenics子分类器和启动子-CDS子分类器.实验结果表明,该算法比其他算法具有更高的特异性,对植物启动子识别具有积极意义.
李文举
寇秋波
韦丽华
刘锦
关键词:
结构特征
信号特征
分类器
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