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寇秋波
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
辽宁师范大学计算机与信息技术学院
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发文基金:
辽宁省教育厅高等学校科学研究项目
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相关领域:
自动化与计算机技术
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合作作者
韦丽华
辽宁师范大学计算机与信息技术学...
刘锦
辽宁师范大学数学学院
李文举
辽宁师范大学计算机与信息技术学...
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1篇
辽宁师范大学...
年份
2篇
2012
共
2
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基于碱基偏好分析和SVM的植物启动子识别
被引量:2
2012年
植物启动子识别是真核启动子识别中的重要研究领域.针对目前植物启动子识别算法的特异性较低的问题,提出了一种基于GC碱基偏好分析和支持向量机(SVM)的植物启动子识别算法.首先通过对GC含量的分析将DNA序列分类为GC偏好序列和非GC偏好序列,然后进行结构特征和信号特征的提取,最后通过SVM分类器进行启动子识别.SVM分类器由四个SVM子分类器组成,即启动子-3’UTR子分类器,启动子-5’UTR子分类器,启动子-Intergenics子分类器和启动子-CDS子分类器.实验结果表明,该算法比其他算法具有更高的特异性,对植物启动子识别具有积极意义.
李文举
寇秋波
韦丽华
刘锦
关键词:
结构特征
信号特征
分类器
植物启动子识别算法研究
随着人类基因草图的绘制完成,基因组学研究已进入了“功能基因组学”时代.如何在海量的序列数据中确定基因及它们的调控网络已经成为目前最具挑战性的任务。启动子作为控制基因转录起始和转录频率的重要元件,在基因表达调控机制中具有非...
寇秋波
关键词:
植物启动子
结构特征
信号特征
基因组学
支持向量机
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