刘远佳 作品数:29 被引量:21 H指数:3 供职机构: 华南农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省重大科技项目 更多>> 相关领域: 农业科学 医药卫生 生物学 更多>>
猫锡兰钩虫rDNA ITS1的扩增及分子鉴定 被引量:3 2013年 为了对从猫粪便样品中分离的钩虫虫卵进行种类鉴定,本研究提取该虫卵基因组DNA,根据核糖体内转录间区1(ITS1)的保守序列设计钩虫属引物,通过PCR扩增、克隆、测序、相关软件分析,建立系统进化树,从分子水平对其进行种类鉴定。结果表明扩增出404 bp DNA片段,测序结果显示该片段包括309 bp ITS1和95 bp的5.8S rDNA,与NCBI中登录的序列进行比对以及采用Clustal X和MEGA5.1软件分析确定该钩虫为锡兰钩虫。这是我国首次建立钩虫的分子鉴定方法,也是40年来再次发现猫源锡兰钩虫,为锡兰钩虫分子生物学和分子流行病学研究奠定了基础。 刘远佳 郑国超 刘田 任邵娜 李雅文 孟祥龙 Loutou H M 李国清关键词:RDNA 猫钩虫虫卵PCR检测方法的建立及初步应用 立一种特异、敏感的PCR方法对猫粪便中的钩虫虫卵进行检测.根据刘远佳等设计的钩虫属ITSl+5.8rDNA片段保守引物,建立PCR检测方法,对反应条件进行优化,并进行了特异性和敏感性试验;采用该方法对临床40份猫粪进行了... 胡伟 刘远佳 郑国超 谭立娉 罗琴 李国清关键词:分子流行病学 用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS71、引物及其应用 本发明公开一种用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS71、T<Sub>m</Sub>‑shift引物及其应用。该SNP分子标记ITS71位于SEQ ID NO:1所示的第71位碱基C或T,此处碱基为C的为锡兰... 李国清 傅叶琪 王明威 潘伟达 石先利 胡伟 刘远佳文献传递 猫源贾第虫16S rRNA与β-贾第素基因双位点的基因型鉴定 被引量:2 2012年 为了对流浪猫粪便中分离的贾第虫滋养体进行基因型鉴定,提取虫体基因组DNA,以16SrRNA和β-贾第素基因为遗传标记,通过PCR扩增、克隆、测序、NCBI比对以及相关软件分析,建立系统进化树,确定了其基因型。结果显示,成功扩增出291bp的16SrRNA和511bp的β-贾第素基因片段,测定了2个基因片段的序列,并经NCBI比对以及DNAStar中MegAlign软件分析确定该株贾第虫为十二指肠贾第虫F型。本研究首次对我国猫源贾第虫进行了基因型鉴定,为猫源贾第虫分子生物学和分子流行病学研究奠定了基础。 刘远佳 张萍 李结 郭建超 孟祥龙 LOUTOU H M 李国清关键词:基因型 16SRRNA基因 一种RAA荧光法检测鸡传染性贫血病毒的引物探针组、试剂盒及其应用 本发明提供了一种RAA荧光法检测鸡传染性贫血病毒的引物探针组、试剂盒及其应用,属于生物检测技术领域。本发明提供的RAA荧光法检测鸡传染性贫血病毒的引物探针组中,正向引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,反向引物的... 张新珩 谢青梅 巫秀红 刘远佳 陈峰 吴志强 严专强 刘佳佳用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS197、引物及其应用 本发明公开一种用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS197、T<Sub>m</Sub>‑shift引物及其应用。该SNP分子标记ITS197位于SEQ ID NO:1所示的第197位碱基A或G,此处碱基为A的... 李国清 王明威 傅叶琪 潘伟达 石先利 胡伟 刘远佳文献传递 用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS71、引物及其应用 本发明公开一种用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS71、T<Sub>m</Sub>‑shift引物及其应用。该SNP分子标记ITS71位于SEQ ID NO:1所示的第71位碱基C或T,此处碱基为C的为锡兰... 李国清 傅叶琪 王明威 潘伟达 石先利 胡伟 刘远佳广东省鸡传染性贫血病毒编码区基因的克隆与分子进化分析 被引量:2 2014年 为了解鸡传染性贫血病毒(chickenanemiavirus,CAV)广东分离株变异情况,通过PCR方-法克隆了于2012年分离到的10株cAV的编码区序列,并对其进行了测序及分子进化分析。结果显示,广东CAV分离株编码区全长1823bp,含有3个互相重叠的开放阅读框(ORF)。序列分析表明,广东省CAV分离株与GenBank上已发表的其他36株cAV比较,VP1核苷酸的同源性在94.1%~99.2%之间,推导出的氨基酸的同源性在95.3%~99.3%之间;VP2的核苷酸同源性在98.2%~100%之间,推导出的氨基酸的同源性在95.9%~99.5%之间;VP3的核苷酸同源性在97.8%~100%之间,推导出的氨基酸的同源性在95.1%~99.2%之间;VPl蛋白共有17个位点发生了变异,VP2蛋白共有11个位点发生了变异,VP3蛋白共有6个位点发生了变异。分子进化分析显示,10株CAV广东分离株主要位于两个分支,其中9株CAV分离株与GenBank上已发表的35株CAV处于一个大分支,而GI)IN一12与分离株KC414026处于另外一个小分支,由此得出其中9株广东CAV分离株是目前主要的流行毒株。 张新珩 刘远佳 吴波良 陈峰 孙宝丽 马静云 毕英佐 谢青梅关键词:CAV 编码区 分子进化分析 用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS197、引物及其应用 本发明公开一种用于检测犬源锡兰钩虫和犬钩虫的SNP分子标记ITS197、T<Sub>m</Sub>‑shift引物及其应用。该SNP分子标记ITS197位于SEQ ID NO:1所示的第197位碱基A或G,此处碱基为A的... 李国清 王明威 傅叶琪 潘伟达 石先利 胡伟 刘远佳猫钩虫PCR检测方法的建立及初步应用 2014年 为建立一种特异、敏感的检测猫钩虫的方法,根据钩虫内转录间隔区(ITS)部分序列的保守引物AF和AR,建立PCR检测方法,对反应条件进行优化,并进行特异性和敏感性试验;采用该方法对112份流浪猫粪便进行临床检测。结果显示,建立的PCR方法能特异性扩增猫钩虫相应的基因片段,其长度为404bp,与猫弓首蛔虫、犬复孔绦虫、狐毛尾线虫的虫卵的基因组DNA以及蓝氏贾第虫包囊、猫等孢球虫卵囊基因组DNA无交叉反应;最低能检测到1.07fg的钩虫基因组DNA。通过临床样品检测,该方法比碘液染色镜检的检出率提高了9%,其敏感度、特异度、阳性预测值和阴性预测值均为100%。结果表明,该PCR方法具有敏感、特异的特点,适用于钩虫的临床检测和钩虫病的分子流行病学调查。 胡伟 刘远佳 郑国超 谭立娉 罗琴 李国清关键词:钩虫 PCR