楼秀芹
- 作品数：20 被引量：62H指数：6
- 供职机构：杭州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：浙江省医药卫生科学研究基金国家自然科学基金城市与区域生态国家重点实验室更多>>
- 相关领域：医药卫生环境科学与工程生物学文化科学更多>>
- 杭州市西湖景区春季空气细菌多样性特征被引量：8
- 2019年
- 选取了杭州市西湖景区4个典型样点,利用高通量测序方法研究了其空气细菌多样性特征。结果表明,在细菌门水平上,各样点优势细菌为变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes),其总相对含量在断桥残雪(MSBB)、柳浪闻莺(OSW)、宝石流霞(PSHFRC)和三潭印月(TPMM)分别为88.31%、86.03%、85.06%和89.28%,且不同样点优势菌群存在一定的差异,OSW和TPMM厚壁菌门分别占9.65%和11.6%,拟杆菌门分别占6.86%和5.55%,MSBB和PSHFRC拟杆菌门分别占7.31%和7.86%,厚壁菌门分别占7.09%和5.32%。在细菌属水平上,各样点优势菌属及含量差异显著,MSBB、TPMM、OSW和PSHFRC相对含量最高的菌属分别为马赛菌属(Massilia)、两面神菌属(Janibacter)、鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)和甲基杆菌属(Methylobacterium),分别占6.22%、6.45%、6.05%和11.5%,各样点相对含量高于2%的细菌属有鞘氨醇单胞菌属、甲基杆菌属、薄层菌属(Hymenobacter)和异常球菌属(Deinococcus),这些菌属是西湖景区各样点共有的优势菌群;通过空气细菌OTU及多样性分析可知,MSBB空气细菌丰富度较高,均匀度较低,而PSHFRC丰富度较低,均匀度较高。杭州西湖景区不同样点空气细菌群落特征差异显著,且其丰富度和均匀度明显不同。
- 楼秀芹郭卫俊姚文冲方治国
- 关键词：生物气溶胶
- 抗体-DNA偶联物的免疫磁珠环介导等温扩增法快速检测副溶血性弧菌的研究
- 刘涛陈健斯国静俞骅楼秀芹张蔚
- "抗体-DNA偶联物的免疫磁珠环介导等温扩增法快速检测副溶血性弧菌的研究"系杭州市科技局社会发展科研专项。该项目旨在建立一种新型的LAMP法"抗体-DNA偶联物的免疫磁珠环介导等温扩增法"从而高灵敏度、高特异度的快速检测...
- 关键词：
- 关键词：副溶血性弧菌
- 大黄素对金黄色葡萄球菌生物膜抑制作用的体外研究被引量：4
- 2020年
- 目的研究大黄素对金黄色葡萄球菌生物膜早期形成及后期成熟的影响。方法以ATCC6538及编号为16-22的金黄色葡萄球菌为受试菌株,用琼脂稀释法测定大黄素的最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC);构建体外生物膜模型,用银染法观察载体表面的生物膜形态,结晶紫染色法和连续稀释法进行膜内活菌计数。结果大黄素对ATCC6538和16-22的MIC分别为32、16μg/ml。形态学观察发现≥4μg/ml的大黄素能有效减少金黄色葡萄球菌的黏附和破坏已成熟的生物膜。结晶紫染色法和连续稀释法的结果表明当大黄素的浓度达到8μg/ml后,75%的ATCC6538和70%的16-22金黄色葡萄球菌生物膜生成被抑制;56%的已成熟生物膜被破坏。结论大黄素在体外可以有效抑制金黄色葡萄球菌生物膜的形成并破坏成熟的生物膜。
- 陈琦楼秀芹刘涛张蔚
- 关键词：金黄色葡萄球菌生物膜大黄素
- 免疫磁珠-环介导等温扩增联用技术快速检测副溶血性弧菌方法的建立被引量：4
- 2017年
- 目的建立一种快速且质优价廉的检测副溶血性弧菌的环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)检测方法。方法制备副溶血性弧菌跨膜转录调控蛋白toxR多克隆抗体,鉴定纯化后,进行磁珠包被制成免疫磁珠。利用免疫磁珠分离法和环介导等温扩增联用完成对副溶血性弧菌的检测,扩增产物经SYBR Green I染色肉眼观察和电泳鉴定。将副溶血性弧菌菌液作一系列稀释后,运用LAMP法进行敏感性检测,利用副溶血性弧菌和非副溶血性弧菌来验证LAMP方法的特异性。结果LAMP检测副溶血性弧菌的检测下限为10~5 CFU/ml。副溶血性弧菌出现LAMP特征性扩增反应,非副溶血性弧菌未出现LAMP扩增。结论 LAMP检测方法为快速诊断试剂盒打下实验基础,适合日常监测,可满足快速检测的需要。
- 刘涛俞骅张蔚楼秀芹斯国静
- 关键词：副溶血性弧菌环介导等温扩增免疫磁珠
- 杭州地区相同分子型别的单核细胞增生李斯特菌临床和食品分离株基因组分析被引量：2
- 2019年
- 目的 研究杭州地区分子型别相同的临床和食品来源单核细胞增生李斯特菌在基因组水平的分子差异及进化关系。方法 利用高通量基因组测序和生物信息学分析方法对脉冲场凝胶电泳(Pulse-field gel electrophoresis,PFGE)型别一致的1株临床来源和6株食品来源的ST8型菌株进行基因组共线性、ncRNAs分布和毒力基因携带分析。联合NCBI Assembly数据库中ST8型菌株基因组,构建基于全基因组SNPs位点的进化树,进行溯源分析。结果 杭州地区临床和食品来源的菌株基因组共线性一致。菌株在毒力基因 lmo 0036和 lmo 2396的序列和 rli48, rli62和rliG 分子,质粒pLmA144的分布存在差异。基因组SNPs进化树显示ST8型菌株呈现高度同源。食品分离株中12-004与临床株12-103的进化上最接近,只有16个SNPs差异。结论 杭州市场近年肉类食品中存在遗传进化高度相似的一群ST8型单核细胞增生李斯特菌。杭州单核细胞增生李斯特菌临床分离株感染可能来自这群菌株。
- 俞骅董华丽汪皓秋楼秀芹刘涛张蔚王旭初潘劲草
- 关键词：单核细胞增生李斯特菌毒力基因非编码RNA
- 食品中阪崎肠杆菌多重PCR检测方法的建立被引量：7
- 2014年
- 目的建立并优化食品中阪崎肠杆菌检测的多重PCR方法。方法以阪崎肠杆菌ITS序列,16s rDNA和ompA基因为靶基因,选择3对引物,建立并优化多重PCR反应体系;验证其特异性、灵敏度和抗干扰能力;并在实际样品中进行阪崎肠杆菌的检测,检测结果与现行国家标准方法进行比较。结果该多重PCR反应体系具有良好的特异性、灵敏度和较强的抗干扰能力。人工污染奶粉样品的模拟实验表明,增菌后该多重PCR反应体系可以检出1 CFU/100 g奶粉的阪崎肠杆菌。108份不同种类的实际样品中共检出阪崎肠杆菌10份,检出率为9.26%,检测结果与采用现行国家标准方法测定具有良好的一致性。结论本研究所建立的多重PCR方法特异好、灵敏较高、结果准确,可用于食品中阪崎肠杆菌的日常检测。
- 楼秀芹斯国静戚建江刘涛俞骅
- 关键词：阪崎肠杆菌多重PCR食源性致病菌
- 杭州地区临床和食品来源德尔卑沙门菌耐药特征与基因组分析被引量：1
- 2023年
- 目的了解杭州地区临床和食品来源德尔卑沙门菌的耐药特征,并进行溯源分析。方法对2015—2020年杭州地区分离的60株德尔卑沙门菌进行药敏分析、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型和全基因组测序,并下载公共数据库基因组进行比较;利用测序数据对菌株进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)和耐药基因扫描,并构建基于单核苷酸多态性(SNP)位点的系统发育树。结果杭州地区德尔卑沙门菌临床株和食品株对28种药物的耐药率差异均无统计学意义,多重耐药率为76.7%(46/60);所有菌株均检出氨基糖苷乙酰转移酶基因aac(6′)-Iaa和磷霉素耐药基因fosA7;60株德尔卑沙门菌共分为46种PFGE带型、53种cgMLST(HC2)型别,除1株为ST3220型外,其余均为ST40型;基于439株德尔卑沙门菌(包括60株杭州菌株和379株公共数据库菌株)SNP位点构建的系统发育树显示:部分杭州菌株与东南亚菌株进化距离较近,提示可能存在跨境传播,食品株主要来自猪肉和水产类;其他杭州菌株与北京、广州、湖北、重庆等省市的菌株距离较近,提示可能存在跨省传播,食品株主要来自猪肉、牛肉和鸡肉。结论杭州地区德尔卑沙门菌的流行主要由ST40型引起,其多重耐药现象普遍,推测其临床感染与猪牛肉、鸡肉和水产类的消费密切相关,与东南亚地区和境内其他省市可能存在跨地传播。
- 郑之北俞骅陈琦郑伟楼秀芹刘小东汪皓秋潘劲草
- 关键词：德尔卑沙门菌多重耐药全基因组测序
- 杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别研究被引量：8
- 2017年
- 目的研究杭州地区单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes)食品分离株的分子分型情况,了解当地流行株的型别特征。方法用脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分型(MLST)的方法对单核细胞增生李斯特菌进行分子分型。PFGE结果进行聚类分析,并绘制MLST数据的最小生成树。结果 6个血清型组成的133株杭州食品分离株共获得19个MLST型别,并发现1个新的ST型ST767。ST9和ST121是数量最多的型别。用AscI和ApaI酶切分别获得33和45个PFGE带型。结论杭州地区单核细胞增生李斯特菌食品分离株分子型别分布广泛,大部分菌株是可引起人李斯特菌病的Lineage I和Lineage II菌株。食品中单核细胞增生李斯特菌的污染比较严重,应加强监测与管理以防食源性疾病的发生。
- 俞骅潘劲草汪皓秋斯国静刘涛楼秀芹张蔚严杰
- 关键词：单核细胞增生李斯特菌多位点序列分型脉冲场凝胶电泳
- 免疫磁珠环介导等温扩增法快速检测副溶血性弧菌的方法
- 本发明提供一种免疫磁珠环介导等温扩增法快速检测副溶血性弧菌的方法：以副溶血性弧菌为模板，克隆Vp种特异性toxR<Sub>28‑534</Sub>基因，原核表达并纯化；制备针对toxR<Sub>28‑534</Sub>蛋...
- 刘涛陈健斯国静俞骅楼秀芹张蔚
- 文献传递
- 2017-2021年杭州市临床和食品来源伦敦沙门菌耐药与基因组特征
- 2023年
- 目的分析2017—2021年杭州市临床和食品来源伦敦沙门菌的耐药与基因组特征。方法对2017—2021年杭州市分离的91株伦敦沙门菌进行药敏分析、PFGE分型和全基因组测序;利用测序数据对菌株进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)和耐药基因识别,并与公共数据库菌株比较进行系统发育分析。结果临床株和食品株对18种药物的耐药率差异均无统计学意义(均P>0.05),其多重耐药率为75.8%(69/91),以同时耐7类药物的菌株居多,发现1株对多黏菌素E耐药且检出mcr-1.1基因的耐8类药物菌株;50.5%(46/91)的菌株对阿奇霉素耐药且检出mph(A)基因;91株伦敦沙门菌均为ST155型,分为44种PFGE带型和82种cgMLST型别;系统发育分析显示,大部分杭州菌株(83/91)自行聚集成簇,簇内混杂少量来自欧洲和北美洲的人分离株以及湖北、深圳等省市的猪肉分离株;少数杭州菌株(8/91)与分离自东南亚、欧洲、北美洲的菌株进化距离较近;与临床株距离较近的主要是猪肉分离株。结论杭州市伦敦沙门菌的感染主要由ST155型菌株引起,以本地传播为主,同时与东南亚、欧洲、北美洲以及国内其他省市可能存在跨地传播;临床和食品来源菌株间耐药差异无显著意义,多重耐药现象较为普遍;其临床感染可能与猪肉消费密切相关。
- 郑之北俞骅郑伟陈琦楼秀芹刘小东汪皓秋潘劲草
- 关键词：沙门菌多重耐药全基因组测序耐药监测
