王书峰
- 作品数：19 被引量：54H指数：3
- 供职机构：第三军医大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划重庆市研究生教育优质课程项目更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学电子电信更多>>
- 整合法预测HBV相关抗原的HLA-A* 0201限制性结合肽被引量：2
- 2009年
- 目的预测HBV的相关抗原HBsAg、HBcAg、DNA polymerase新的HLA-A*0201限制性结合肽。方法选取SYFPEITHI、BIMAS、SVMHC、IEDB、EpiJen预测工具以及整合法预测抗原对应蛋白序列P03146,P03138,P03156的HLA-A*0201限制性结合肽,并与现有表位数据库中的结合肽比较。结果整合法与单个预测算法相比提高了预测的灵敏度和特异性,对3种抗原的预测准确性均有提高,MR(misclassification rate)值分别降为1.14%、3.41%、1.46%;利用此方法发现3种抗原尚未得到实验验证的HLA-A*0201结合肽,分别为,HBcAg:ELMTLATWV(64-72)、LMTLATWVGV(65-74);HBsAg:LMT-LATWVGV(246-254)、IIFLFILLL(244-252)、FLFILLLCLI(246-255)、SLYSILSPFL(367-375)以及LLCLIFLLVL(251-260);DNA polymerase:SLFTAVTNFL(513-522)、GLLGFAAPFT(554-563);在HBsAg蛋白序列中发现了31个氨基酸的免疫热点区域FIIFLFILLLCLIFLLVLLDYQGMLPVCPLI(243-273)。结论整合法比单个预测算法性能更好,能够更准确地预测抗原的HLA限制性结合肽,采用该方法所发现的9条可能表位和1个免疫热点区域为后续HBV新表位的鉴定及其功能研究提供了有价值的线索。
- 王书峰尚小云巩沅鑫吴玉章
- 关键词：MHC整合法结合肽
- 免疫表位数据库的现状及新型表位数据库的构思
- 随着计算机技术以及网络技术的发展,面对免疫学实验数据的指数性增长,免疫信息学已经发展为一门重要的交叉学科,有关免疫学信息数据库的建立成为其中一个重要的研究方向。表位是抗原被免疫系统特异识别的位点,是获得性免疫的基础。抗原...
- 王书峰
- 文献传递
- 医科院校本科生导师制实施过程中出现的问题及思考被引量：10
- 2016年
- 本科生导师制是目前我国高校普遍实施的一种旨在提高大学生人才素质的本科生教育管理制度,医科院校实施本科生导师制对培养医学本科生科研创新能力具有积极作用。该文就医科院校本科生导师制实施过程中出现的问题进行思考并提出相应的实施建议。充分发挥本科生导师制在创新人才培养中的积极作用需要进一步加强其制度建设并完善评价体系;实施过程中要兼顾医科院校本科生基础科研及临床科研创新能力的培养,并合理利用本科生导师制与其他创新活动的互补作用,全面培养本科生自主创新能力。
- 王书峰刘东刘威吴玉章
- 关键词：导师制自主创新
- 胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位改造肽配体及其获得方法和应用
- 本发明公开了胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位改造肽配体(APL)及其获得方法和应用，该APL的氨基酸序列为HLCGPFLVEA，是将天然表位mInsB<Sub>5-14</Sub>的第6位组氨酸替换为苯丙氨...
- 王莉舒驰王书峰陈晓玲吴玉章
- 幽门螺杆菌黏附素HpaA重组蛋白的表达、纯化及晶体生长被引量：3
- 2015年
- 目的构建幽门螺杆菌黏附素Hpa A的原核表达载体,并用纯化的重组Hpa A蛋白进行晶体培养,为其三维结构解析、基于结构的Hpa A抗原表位分析和黏附拮抗剂研究奠定基础。方法用生物信息学方法分析Hpa A蛋白序列二级结构并预测跨膜区,利用PCR技术扩增幽门螺杆菌标准株NCTC 26695编码Hpa A蛋白的hp0797基因非跨膜区片段,构建重组质粒并p ET22b(+)-r Hpa A,在大肠杆菌BL21(DE3)中IPTG诱导表达重组蛋白,经Ni离子亲和层析、阴离子交换层析、凝胶过滤层析纯化蛋白并分析其聚集状态。用Hampton Research结晶试剂盒搜索结晶条件,并系统优化,在上海同步辐射光源进行衍射实验。结果成功构建了重组质粒p ET22b(+)-r Hpa A,并在大肠杆菌BL21(DE3)中可溶性表达;重组Hpa A蛋白在溶液中以二聚体形式存在,SDS-PAGE分析单体相对分子质量约24 000,HPLC分析纯度达95%;培养出晶形较好的重组Hpa A蛋白单晶,大小约70μm×30μm×20μm,衍射分辨率2.03魡。结论利用经典的蛋白质表达、纯化技术和晶体培养技术,获得了衍射能力较强的重组Hpa A蛋白单晶,为其三维结构解析和基于结构的幽门螺杆菌疫苗研究提供了重要基础。
- 郭玲章金勇刘东马博王书峰倪兵李海波刘威吴玉章
- 关键词：幽门螺杆菌HPA纯化晶体生长
- 胰岛素A链拮抗性HLA-A*0201限制性CTL表位或其改造肽的设计和鉴定被引量：1
- 2016年
- 目的设计并鉴定胰岛素A链拮抗性HLA-A*0201限制性CTL表位mInsA_(2-10)或其APLs,为T1D防治的临床转化基础研究提供良好的实验依据。方法腹腔注射可溶性肽mInsA_(2-10)与无关对照肽,通过血糖监测判断肽mInsA_(2-10)是否有T1D的防治作用;通过Insight II和Discover软件获得mInsA_(2-10)和其APLs的分子动力学模拟参数,选择候选的APLs,再通过检测它们的相对亲和力及各候选APLs体外抑制mInsA_(2-10)自身反应性CD8+T细胞的增殖情况,初步鉴定具有拮抗作用的APLs,再系统性给予人源化NOD小鼠拮抗性APLs,考察其是否有T1D的防治作用。结果比较分析mInsA_(2-10)和其APLs的分子动力学模拟参数的差异,选择出4种候选的APLs;体外实验鉴定出APLs mInsA_(2-10)DQ4和mInsA_(2-10)DC6与HLA-A*0201分子的相对亲和力比其它2个候选的APLs相对更高;与天然肽组相比,这2个APLs能显著地抑制mInsA_(2-10)自身反应性的CD8+T细胞的增殖;系统性给予人源化NOD小鼠这2个拮抗性APLs,仅mInsA_(2-10)DQ4具有显著的T1D保护作用。结论 mInsA_(2-10)DQ4和mInsA_(2-10)DC6是具有拮抗作用的APLs,而在人源化NOD小鼠的在体研究中发现仅mInsA_(2-10)DQ4具有显著的T1D保护作用,下一步将探讨mInsA_(2-10)DQ4防治T1D的免疫学机制,这为T1D防治的临床转化基础研究提供良好的实验依据。
- 张梦军舒驰王书峰陈禹彤陈晓玲曹文轩冯志强王莉
- 关键词：I型糖尿病
- HLA-Ⅰ类分子超型特异性表位预测及设计工具的研究
- 在细胞免疫中,主要组织相容性复合物(Major histocompatibility complex, MHC)结合抗原多肽并将其提呈至细胞表面从而被T细胞受体(T-cell receptor, TCR)识别。与MHC分...
- 王书峰
- 关键词：HLA表位预测ELISPOT
- 文献传递
- 深化医学免疫学实验教学改革的探讨被引量：27
- 2015年
- 医学免疫学是一门重要的基础医学课程，作为生命科学的前沿学科，与基础医学以及临床医学的各个学科相互交叉和渗透，是沟通基础医学和临床医学的重要桥梁。同时，免疫学作为一门实验学科，其知识更新迅速，且理论知识密切联系实际应用。因此，医学免疫学教学不仅要培养学生对免疫学理论的认知能力，更重要的是培养学生严谨的逻辑思维能力及独立的实践操作能力。这就要求我们教学过程中不仅要重视理论教学，同时要加强实践教学［1］，即免疫学实验教学。医学免疫学实验通过实验教学环节，巩固学生对免疫学知识的理解和掌握程度，同时培养学生严谨的科学态度以及分析问题和解决问题的能力。实验教学的质量直接影响学生对免疫学基本理论的认知能力和实践应用能力。
- 王书峰郭玲张志仁吴玉章
- 关键词：医学免疫学教学实验教学改革基础医学课程实践操作能力逻辑思维能力
- 胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位改造肽配体及其获得方法和应用
- 本发明公开了胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位改造肽配体(APL)及其获得方法和应用，该APL的氨基酸序列为HLCGPFLVEA，是将天然表位mInsB<Sub>5-14</Sub>的第6位组氨酸替换为苯丙氨...
- 王莉舒驰王书峰陈晓玲吴玉章
- 文献传递
- 抗轮状病毒药物作用靶标及其构建方法和应用方法
- 本发明公开了抗轮状病毒药物作用靶标，为轮状病毒VP6蛋白与人亲环素A相互作用的复合物三维结构模型，其中VP6蛋白的功能区为第52至第100位和第343至第392位氨基酸，活性位点包括Asn 53、Ala 348、Val ...
- 李晋涛吴玉章何海洋王书峰
