宋宇琴
- 作品数：16 被引量：17H指数：3
- 供职机构：内蒙古农业大学食品科学与工程学院乳品生物技术与工程教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：轻工技术与工程生物学农业科学医药卫生更多>>
- 德氏乳杆菌保加利亚亚种遗传多样性和种群结构的MLST分析
- 德氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)是乳杆菌属中最重要的一个种,德氏乳杆菌保加利亚亚种(L.delbrueckii spp.bulgaricus)、德氏亚种(spp.delbrueckii)、...
- 孙志宏宋宇琴张和平
- 关键词：德氏乳杆菌保加利亚亚种种群结构
- 肠膜明串株菌及其近缘种部分管家基因的系统发育分析
- 肠膜明串珠菌是隶属于明串珠菌属的乳酸菌菌种,具有抗氧化、高产酸和拮抗致病菌等能力。本文利用管家基因dnaA、rpoB作为分子标记对分离自传统乳制品中的8株Leuconostoc mesenteroides（Leu.mes...
- 冯淑贞徐海燕宋宇琴孙志宏张和平
- 关键词：肠膜明串珠菌系统发育分析DNAARPOB
- 文献传递
- 中国少数民族地区自然发酵乳中乳酸乳球菌多位点序列分型研究
- 本试验为了探究乳酸乳球菌的遗传多样性和菌株间的亲缘关系,对来自中国六个省九个地区的自然发酵乳中的197株乳酸乳球菌进行多位点序列分型研究。研究中选取dnaA,pyrG,rpoB,groEL,recA,clpX,carB,...
- 徐海燕孙志宏刘文俊于洁宋宇琴张和平
- 关键词：乳酸乳球菌
- 柠檬明串珠菌及相近种部分持家基因的系统发育分析被引量：2
- 2013年
- 【目的】利用16S rRNA、dnaA、murC和pyrG基因分子标记研究Leuconostoc citreum(Leu.citreum)及相近种间的种系发育关系,并比较这些基因序列对Leu.citreum及相近种的区分能力。【方法】以分离自酸面团中的7株Leu.citreum为研究对象,以dnaA、murC和pyrG基因片段为标记,通过PCR扩增、测序,结合已公布的近缘种及亚种相应序列,计算遗传距离,构建系统发育树,并与16S rRNA基因进行比较。【结果】研究发现Leu.citreum及相近种间的dnaA、murC和pyrG基因构建的系统发育树拓扑结构与16S rRNA基因基本一致,区别在于相似性的不同,其分别为75.5%-97.2%、50.2%-99.7%、65.0%-99.8%和98.5%-100%。【结论】在Leu.citreum及相近种间的种系发育关系中,dnaA、murC和pyrG基因与16S rRNA基因系统进化关系都具有很好的一致性,但这三个持家基因的遗传距离显著高于16S rRNA基因。因此,采用dnaA、murC和pyrG基因可以用于Leu.citreum及相近种的分类鉴定。
- 吕嫱陈明徐海燕宋宇琴孙志宏丹彤孙天松
- 关键词：系统发育分析16SRRNA基因
- 基于多位点序列分型分析干酪乳杆菌基因多样性
- 干酪乳杆菌是乳杆菌属中革兰氏阳性、兼性厌氧的一个种,通常存在于生乳或发酵乳制品、人和动物的肠道、生殖系统以及新鲜蔬菜或发酵蔬菜制品中。为了更好地了解干酪乳杆菌的进化和系统发育关系,本研究以分离自不同地区的酸粥(46株)、...
- 孙志宏宋宇琴张和平
- 关键词：干酪乳杆菌
- 基于比较基因组学技术分析罗伊氏乳杆菌的适应性进化
- 罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri,L.reuteri)是一种革兰氏阳性的专性异型发酵菌,可广泛定植于人和动物等脊椎动物的肠道中.曾有研究表明分离自老鼠、猪和人类肠道的L.reuteri在不同宿主的...
- 孙志宏宋宇琴张和平
- 关键词：比较基因组学基因组分析罗伊氏乳杆菌适应性
- 德氏乳杆菌保加利亚亚种遗传多样性和种群结构的MLST分析免疫原性死亡的作用研究
- 徳氏乳杆菌(Lactobacillus delbrueckii)是乳杆菌属中最重要的一个种,德氏乳杆菌保加利亚亚种(L.delbrueckii spp.bulgaricus)、德氏亚种(spp.delbrueckii)、...
- 宋宇琴孙志宏张和平
- 关键词：德氏乳杆菌保加利亚亚种种群结构
- 肠膜明串株菌及其近缘种部分管家基因的系统发育分析
- 肠膜明串珠菌是隶属于明串珠菌属的乳酸菌菌种,具有抗氧化、高产酸和拮抗致病菌等能力.本文利用管家基因dnaA、rpoB 作为分子标记对分离自传统乳制品中的8株Leuconostoc mesenteroides(Leu.me...
- 冯淑贞徐海燕宋宇琴孙志宏张和平
- 关键词：肠膜明串珠菌系统发育分析基因DNAARPOB
- 粪肠、屎肠球菌及相近种部分持家基因的系统发育分析被引量：3
- 2014年
- 【目的】利用16S rRNA、clpX和recA基因分子标记研究Enterococcus faecalis、Enterococcus faecium及相近种间的种系发育关系,并比较这些基因序列对E.faecalis、E.faecium及相近种的区分能力。【方法】以分离自传统乳制品中的9株E.faecium和1株E.durans分离株为研究对象,以clpX和recA基因片段为标记,通过PCR扩增、测序,结合已公布的近缘种相应序列构建系统发育树并与16S rRNA基因进行比较。【结果】在基于clpX和recA基因的进化树中,10株试验菌株与E.faecalis始终处于同一分支。与该物种这两个基因的平均相似性为99.6%和98.6%,与另一分支的Faecium-group(E.durans和E.faecium)的平均相似性仅为61.5%和33.5%。相近种E.durans和E.hirae间这两个基因的差异性为20.3%和39.0%;在基于16S rRNA基因的进化树中,试验菌株与Faecium-group(E.lactis、E.faecium、E.durans、E.hirae)处于同一分支。与这些成员间该基因的相似性大于99.6%,与E.faecalis基因的平均相似性可达98.4%。相近种间该基因相似性无明显差异。【结论】按照10株试验菌株clpX和recA基因的分析结果可将由传统生理生化和16S rRNA基因序列鉴定的9株E.faecium和1株E.durans归类为E.faecalis,clpX和recA基因可用于部分相近种的分类鉴定。
- 张文羿吕嫱徐海燕宋宇琴孙志宏张和平孙天松
- 关键词：粪肠球菌屎肠球菌系统发育分析RRNA基因
- 抗生素和高脂饮食对大鼠肠道乳杆菌多样性的影响被引量：2
- 2014年
- 【目的】对正常、高脂、抗生素处理大鼠肠道内乳杆菌进行定性和定量分析,比较不同处理组大鼠肠道乳杆菌的多样性。【方法】应用纯培养和非培养技术(16S r RNA基因序列分析、变性梯度凝胶电泳、实时荧光定量PCR)对大鼠肠道乳杆菌进行分离鉴定和多样性分析。【结果】16S r RNA基因序列同源性分析结果显示,正常组大鼠肠道内分离出的乳杆菌包括约氏乳杆菌(Lactobacillus johnsonii)、鼠乳杆菌(Lactobacillus murinus)、嗜酸乳杆菌(Lactobacillus acidophilus)、罗伊氏乳杆菌(Lactobacillus reuteri)、植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum)、肠道乳杆菌(Lactobacillus intestinals)、动物乳杆菌(Lactobacillus animalis)和阴道乳杆菌(Lactobacillus vaginalis);但L.animalis在高脂处理组大鼠肠道内未分离到,L.intestinals和L.vaginalis在抗生素处理组大鼠中未分离到。DGGE结果显示3个组别大鼠肠道中乳杆菌构成差异明显,同一组内样品间相似性较高;相较于正常组和高脂组,抗生素组的丰度较差;且正常组大鼠肠道内乳杆菌的多样性高于高脂组和抗生素组。q-PCR结果显示正常组大鼠肠道乳杆菌的数量明显高于高脂组和抗生素组,高脂组的数量也明显高于抗生素组,且3个组别之间存在显著差异(P<0.01)。【结论】高脂饮食及抗生素的使用会减少肠道内乳杆菌多样性。
- 白娜张家超郑艺乔健敏宋宇琴黄卫强霍冬雪侯强川张和平
- 关键词：多样性变性梯度凝胶电泳实时荧光定量PCR
