廖小林
- 作品数:5 被引量:111H指数:3
- 供职机构:中国科学院水生生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金中国科学院知识创新工程重要方向项目国际科技合作与交流专项项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 长江流域几种重要鱼类的分子标记筛选开发及群体遗传分析
- 长江是中国最长的河流,居世界第三位。长江流域鱼类繁多,超过360种(亚种),其中特有鱼类约180种(亚种),是中国鱼类资源最丰富的地区。由于过度捕捞、水污染及大型水利工程的修建等原因,近20年来长江渔业资源有较大衰退,一...
- 廖小林
- 关键词:长江流域鱼类分子标记遗传育种
- 长江江豚微卫星DNA分离的初步研究被引量:10
- 2008年
- 为了开发物种特异性微卫星标记,本文采用一种改良的快速微卫星分离法(FIASCO)从长江江豚(Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis)的基因组中筛选得到72条微卫星DNA序列。根据重复单元的排列特点,完美型、非完美型及复合型序列所占的比例分别为58.3%、22.2%和19.5%。选择其中30条序列设计PCR扩增引物,并用12个随机选择的长江江豚样品进行多态性筛选。初步结果表明其中14对引物的扩增产物稳定并且具有多态性;在每个座位上获得2-13个等位基因,平均等位基因数为5.87个;14个微卫星座位的平均观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.560和0.709。本研究获得了长江江豚的第一批物种特异性微卫星座位及其扩增引物,这些微卫星标记将在后续的保护遗传学研究中发挥重要作用。
- 郑劲松廖小林童金苟王丁
- 关键词:FIASCO微卫星DNA多态性
- 利用微卫星分析长江水系草鱼遗传多样性
- 微卫星是进行群体遗传和遗传图谱等研究的极好分子标记。草鱼是我国最重要的经济鱼类之一,但是该种中没有克隆微卫星的报道。我们利用已经公开发表的一批鲤鱼微卫星引物在草鱼中进行异种PCR扩增尝试,结果发现有5对引物(6个座位)能...
- 廖小林俞小牧谭德清童金苟
- 关键词:微卫星草鱼遗传多态性
- 文献传递
- 鲤EST-SSR标记的开发及跨种扩增研究
- 本研究主要运用生物信息学方法,结合适当的分子生物学和遗传学实验验证, 进行筛选开发鲤EST数据库中的微卫星标记(EST-SSR)以及在近缘种类中的扩增研究。在1万余条鲤EST中序列中,共发现SSR 555个(5.5%),...
- 王丹廖小林俞小牧程磊王春艳游翠红童金苟
- 文献传递
- 长江水系草鱼遗传多样性的微卫星DNA分析被引量:85
- 2005年
- 利用已发表的鲤微卫星引物在草鱼中进行PCR扩增 ,结果有 5对引物 (6个座位 )能成功扩增并且有较高多态性 ,等位基因数在 3— 7个之间。这些异种扩增的草鱼微卫星符合孟德尔遗传规律。测序证明草鱼中的微卫星核心重复序列部分与鲤中的原始核心序列相似 ,也有一些变化。随后用这 6个多态微卫星座位研究了来自长江水系的四个草鱼群体的遗传结构 ,结果显示每个群体的平均等位基因数在 3 8与 4 8之间 ,平均观测杂合度 (Ho)在0 4 0 0 0与 0 5 74 1之间 ,平均期望杂合度 (HE)在 0 4 773与 0 6 4 89之间 ,有多个座位在不同的群体中偏离哈代 -温伯格平衡。遗传距离分析表明四川群体与洞庭湖群体遗传距离最远 ,而嘉鱼群体与鄱阳湖群体遗传距离较近。分子变异分析 (AMOVA)表明 ,群体内遗传变异与群体间遗传变异分别占总遗传变异的 95 6 0 %与 4 4 0 % ,固定系数 (FST)为 0 0 4 4 ,这表明长江水系草鱼目前的群体分化很微弱。
- 廖小林俞小牧谭德清童金苟
- 关键词:草鱼杂合度微卫星座位鱼群等位基因