徐景升
- 作品数:94 被引量:398H指数:12
- 供职机构:福建农林大学更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 甘蔗S-腺苷蛋氨酸脱羧酶基因Sc-SAMDC的克隆和表达分析被引量:18
- 2010年
- 【目的】克隆甘蔗(Saccharum officinarum)S-腺苷蛋氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase,SAMDC)基因,并进行序列特征、原核表达和不同逆境胁迫下表达特性分析。【方法】通过对甘蔗茎全长cDNA文库测序和分析,获得SAMDC基因cDNA全长,命名为Sc-SAMDC,并进行序列分析。随后将编码S-腺苷蛋氨酸脱羧酶的cDNA片段克隆到原核表达载体pET29a(+)中,构建融合表达质粒,转化至Esherichia coli BL21(DE3)中进行表达。最后利用定量PCR技术分析甘蔗幼苗中该基因在不同外源胁迫下的表达特性。【结果】序列分析显示,甘蔗Sc-SAMDC基因(GenBank Accession number:GQ246459)cDNA全长1968bp,存在3个读码框(袖珍读码框tORF、上游读码框uORF和主读码框mORF),mORF长1200bp,编码399个氨基酸的SAMDC酶原,预测分子量为43.6kD,该酶原含有两个高度保守的功能结构域(酶原剪切位点和PEST结构域)。原核表达产物经SDS-PAGE表明,Sc-SAMDC以融合蛋白形式表达,相对分子量约为50kD。定量PCR分析表明,Sc-SAMDC基因在聚乙二醇(PEG)、NaCl、水杨酸(SA)和H2O2外源胁迫下表达特性不同,受PEG和NaCl的诱导,受SA和H2O2的抑制。【结论】本研究成功地克隆了Sc-SAMDC基因并在原核生物中进行了表达研究,分析了该基因的表达特性,为其进一步的生物学功能研究及其应用奠定了基础。
- 刘金仙阙友雄郭晋隆许莉萍徐景升陈如凯
- 关键词:甘蔗原核表达定量PCR
- 一种利用甘蔗花叶病毒P3N-PIPO构建的亚细胞定位试剂盒
- 本发明涉及一种利用甘蔗花叶病毒P3N?PIPO构建的植物亚细胞定位试剂盒,包括4个分别标记绿色、红色、黄色和青色荧光蛋白的胞间连丝定位载体:SCMV?P3N?PIPO?GFP、pSCMV?P3N?PIPO?RFP、pSC...
- 杨永庆程光远彭磊徐倩董萌徐景升翟玉山邓宇晴郑艳茹高世武郭晋隆
- 文献传递
- 利用RNAi阻断病毒胞间移动培育抗花叶病转基因甘蔗的方法
- 本发明涉及一种利用RNAi阻断病毒胞间移动培育抗花叶病转基因甘蔗的方法,包括RNAi载体构建、遗传转化、转基因甘蔗植株的筛选鉴定及对花叶病的抗性鉴定。本发明采用融合PCR技术,克隆了SCMV的P3N‑PIPO的编码序列,...
- 徐景升程光远徐倩董萌彭磊杨永庆邓宇晴高世武郭晋隆许莉萍
- 文献传递
- 利用RNAi沉默翻译起始因子基因培育抗花叶病甘蔗的方法
- 本发明涉及一种利用RNAi沉默翻译起始因子基因培育抗花叶病甘蔗的方法,包括<I>SceIF4E1</I>基因和<I>SceIF4E2</I>基因的克隆、RNAi干扰载体构建、遗传转化、抗花叶病转基因甘蔗材料的培育及抗病性...
- 徐景升杨永庆程光远高世武郭晋隆翟玉山彭磊邓宇晴郑艳茹许莉萍
- 文献传递
- 甘蔗赤腐病菌PCR检测方法
- 本发明涉及一种甘蔗赤腐病菌PCR检测方法,包括基因组DNA的提取、PCR检测体系建立和PCR产物的检测。本发明的甘蔗赤腐病菌PCR检测方法,具有灵敏度高,所需要的DNA用量少的特点;与常规的根据病菌培养后的孢子形态特征鉴...
- 阙友雄许莉萍黄宁徐景升袁照年罗俊
- 文献传递
- 甘蔗亲环蛋白基因的克隆和表达特性分析
- 亲环蛋白是一类广泛存在于生物细胞,且与环孢素A(cyclosporineA,CsA)有高度亲和力的细胞内结合蛋白,其表达和积累受逆境胁迫因素的调节和影响,与植物响应逆境胁迫相关。目前已经从拟南芥、大豆等作物中克隆了亲环蛋...
- 阙友雄刘金仙郭晋隆许莉萍徐景升张木清陈如凯
- 关键词:甘蔗定量PCR技术克隆表达
- 文献传递
- 甘蔗几丁质酶基因的电子克隆与生物信息学分析被引量:19
- 2011年
- 用电子克隆方法获得甘蔗几丁质酶基因SCCHI1,采用生物信息学方法,对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明:SCCHI1基因全长1236bp,包含一个完整的990bp的ORF,编码329个氨基酸。SCCHI1基因属于糖苷水解酶19家族,含有N-端信号肽、交连区、催化区,与高粱等其它植物的几丁质酶基因具有高度的相似性。为SCCHI1基因的分子克隆、功能鉴定和应用提供参考。
- 苏亚春李国印阙友雄郭晋隆徐景升许莉萍
- 关键词:甘蔗几丁质酶基因电子克隆生物信息学
- 甘蔗黄叶病毒外壳蛋白基因克隆及其实时荧光RT-PCR检测
- 甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)引起的甘蔗黄叶病是一种新的全球性病毒病害.本文以YLSCPFl和YLSCPR591为引物,采用RT-PCR方法克隆了甘蔗黄叶病毒福建分离物...
- 高三基杨帆陈平华王恒波徐景升陈如凯
- 关键词:甘蔗外壳蛋白克隆技术
- 文献传递
- 甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达被引量:1
- 2016年
- 生长素结合蛋白(auxin binding protein,ABP)在生长素信号转导、植物生长发育调控等方面发挥重要作用。该研究利用RT-PCR方法从甘蔗品种Badila中克隆得到了1个ABP基因,序列分析显示该基因的开放读码框(ORF)长度为615bp,编码204个氨基酸。多序列比对和系统进化树分析表明它与高粱(Sorghum bicolor)和玉米(Zea mays)的ABP4蛋白的亲缘关系最近,因此将该基因命名为ScABP4。将其构建到原核表达载体pGEX-6P-1中,成功表达出一个分子量约为22.5kD的蛋白。亚细胞定位结果显示ScABP4主要定位于细胞质网状结构和细胞膜;生物信息学分析显示ScABP4是一个带有信号肽的分泌蛋白,说明ScABP4蛋白可能储存在内质网中并在质膜上执行其生物学功能。荧光定量PCR分析结果表明,ScABP4基因在甘蔗的芽、根、茎、叶中均有表达,其中在芽中相对表达量最高。生长素和黑暗处理下ScABP4基因的表达上调,说明ScABP4基因可能参与甘蔗对生长素的响应及与光信号通路的互作。此外,ABA、JA、SA、CuCl2胁迫能够诱导ScABP4基因的表达,CdCl_2胁迫可抑制ScABP4的表达。由此推测,ScABP4基因可能参与甘蔗对病害、干旱、渗透、重金属等胁迫的应答过程。该研究结果为探讨甘蔗生长素结合蛋白基因的功能提供了实验证据。
- 邓宇晴翟玉山彭磊董萌徐倩程光远林彦铨徐景升
- 关键词:甘蔗生长素结合蛋白同源克隆
- 甘蔗黄叶病毒外壳蛋白基因克隆及其实时荧光RT-PCR检测被引量:4
- 2011年
- 甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)引起的甘蔗黄叶病是一种新的全球性病毒病害。本文以YLSCPF1和YLSCPR591为引物,采用RT-PCR方法克隆了甘蔗黄叶病毒福建分离物(CHN-FJ1)外壳蛋白(CP)基因,编码196个氨基酸。分析不同地理来源的SCYLV病毒分离物cp基因核苷酸及其推导编码的氨基酸序列,同源性达95%以上。根据cp基因的保守序列,设计1对特异性引物和TaqMan探针,建立了SCYLV的TaqMan实时荧光RT-PCR方法。结果表明,检测下限为初始质粒模板DNA 1 000拷贝/μL(约3.61 fg/μL),比常规PCR方法的灵敏度提高100倍。检测甘蔗花叶病毒、宿根矮化病菌和黑穗病菌,没有典型的扩增曲线和无Ct值。应用实时荧光RT-PCR、常规RT-PCR和组织印迹免疫杂交(TBIA)对田间甘蔗叶片样品进行检测,阳性检出率分别为100%、61.5%和69.2%,表明该方法比常规RT-PCR和TBIA具有更高的灵敏度,适合于对SCYLV的检测。
- 高三基杨帆陈平华王恒波徐景升陈如凯
- 关键词:甘蔗黄叶病毒外壳蛋白实时荧光RT-PCR