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欧兹宇
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1
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供职机构:
上海交通大学生命科学技术学院
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相关领域:
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合作作者
李敏
复旦大学附属华山医院检验医学科
陈楠
复旦大学附属华山医院检验医学科
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复旦大学附属华山医院检验医学科
蒋晓飞
复旦大学附属华山医院检验医学科
魏取好
复旦大学附属华山医院检验医学科
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肺炎克雷伯临床菌株新基因组岛KpGI-2的鉴定
2009年
目的研究肺炎克雷伯临床耐药菌株新基因组岛KpGI-2的结构和功能。方法采用PCR方法自一株肺炎克雷伯耐药菌株HS04160扩增得到新的插入序列KpGI-2,通过测序以及生物信息学方法分析其序列结构并推测其生物学功能,采用细菌生长试验证实其生物学功能。结果phe55 tRNA基因位点处PCR扩增得到的6.4kb的插入序列KpGI-2,序列分析发现其GC含量为38.03%,明显低于肺炎克雷伯菌株基因组平均的GC含量(57.5%)。KpGI-2中含有163bp的重复序列,可以确定为一个新的基因组岛。KpGI-2携带有5个orf,其中orf5与沙门菌属中的Fic(filamentation induced by cAMP)蛋白具有高度相似性。肺炎克雷伯临床菌株普遍携带有一个高度保守的fic基因以及一个相对保守的fic基因,携带有KpGI-2的临床菌株HS04160丢失了相对保守的fic基因。通过细菌生长试验分析发现orf5以及KpGI-2在cAMP诱导下对细胞生长具有调节作用,KpGI-2的功能可能与细菌生长的调节相关。结论KpGI-2是位于肺炎克雷伯临床菌株基因组岛插入热点phe55 tRNA基因位点上的一个新基因组岛,其携带的基因与细胞生长相关。
陈楠
蒋晓飞
李敏
魏取好
陈晓耘
欧兹宇
吕元
关键词:
肺炎克雷伯菌
细胞生长
FIC
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