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1A26蛋白中紫杉醇等药物分子活性位点的研究: 第一章是前言，介绍与本论文工作相关的基础知识。在量子力学基础上发展起来的量子化学理论及其相关的计算方法，产生用于量子化学计算的Gaussian程序，把化学推向了一个新的高度，使化学从实验研究阶段迈向理论研究阶段，为化学研...; 邓圣荣; 关键词：量子化学质子转移结合位点分子对接紫杉醇药物分子

HIV-1逆转录酶非核苷类抑制剂MKC分子结合位点的理论研究被引量：1: 2009年; 1RT1蛋白是一个HIV-1逆转录酶核心蛋白,是抑制剂药物分子的作用靶点.非核苷类抑制剂MKC分子是1RT1蛋白中的配体分子.采用量子力学密度泛函理论,B3LYP计算方法,结合6-31G(d,p)基组,逐个计算MKC分子与其周围半径0.7 nm结构范围内的34个氨基酸残基相互作用和结合能,发现在1RT1蛋白中103Lys残基是MKC分子的结合作用位点,结合能值为-46.73 kJ.mol-1.该结合位点的发现将为进一步设计和寻找抗HIV-1逆转录酶抑制剂药物分子提供一些理论基础.; 王宁邓圣荣金毅徐四川何耀莹; 关键词：HIV-1 结合位点 DFT

牛视紫红质蛋白质中视黄醛的活性位点被引量：2: 2009年; 视紫红质蛋白是一个跨膜蛋白,视黄醛(RET)在该蛋白中的活性结合位点涉及到视觉过程机理,与一些眼科疾病病理有关.基于牛视紫红质蛋白1U19的蛋白质晶体结构数据,采用密度泛函理论的B3LYP方法计算RET-Lys296残基与视黄醛分子周围半径为0.6nm的空间范围30个氨基酸残基相互作用和结合能.数值显示1U19蛋白中的残基Glu113、Glu181和Glu122是质子化的RET-Lys296残基的活性结合位点,结合能分别为-333.38、-205.67和-194.56kJ·mol-1.这些氨基酸残基带有一个负电荷,与质子化的RET-Lys296残基发生强烈的离子静电相互作用.另外几个残基Ala292、Cys187、Phe293、Pro291以及Trp265等与质子化RET-Lys296残基也有相互吸引作用.当RET-Lys296残基非质子化,上述相互作用消失,促使视黄醛分子与视蛋白分离.研究发现残基Glu113和Glu181周围各自有一个结晶水分子通过双氢键形式起着稳定作用.; 徐四川邓圣荣马丽英史强葛茂发张兴康; 关键词：视紫红质活性位点密度泛函理论

ADP核糖基转移酶蛋白活性位点的研究: ＜正＞ADP 核糖基转移酶影响肿瘤发生和生命老化。体外和体内研究表明抑制 ADP 核糖基转移酶则可降低 DNA 修复功能,增强放疗和化疗对肿瘤的治疗效果。ADP 核糖基转移酶是一个潜在的治疗癌症靶点。所以,研究 ADP ...; 徐四川王宁邹成亮王琳马丽英邓圣荣经山; 文献传递

CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2反应的溶剂化: 2008年; 气相反应CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2 ，存在一个深达-55．3kJ／mol的势能阱，低温时阻止该反应产生产物NO3^-和Cl2。本文采用B3LYP／6—311＋＋G（d，P）理论方法，研究该化学反应中水分子溶剂化作用，探讨溶剂化过程反应机理。研究结果显示，水分子溶剂化作用使该反应势能阱消失，反应快速产生产物NO3-和Cl2。; 迟绍明王宁方芳邓圣荣马丽英徐四川; 关键词：密度泛函理论溶剂化

H2NCH2C（OH）NH→H2NCH2CONH2质子转移反应从头计算研究: ＜正＞2-氨基乙酰亚胺酸（H2NCH2C（OH）NH）分子是氨基乙腈（H2NCH2CN）Strecker水解反应生成甘氨酸的中间体分子,它的质子转移反应涉及到氨基酸起源的研究。采用量子力学从头计算,MP2计算方法和CCS...; 邓圣荣马丽英王宁单香丽张令霞徐四川; 关键词：质子转移 MP2 PCM; 文献传递

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邓圣荣