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多巴胺D3R蛋白同源模建及其应用: 2012年; 以分辨率为2.2的牛视紫红质蛋白的晶体结构为模板,采用同源模建方法,建立D3R模蛋白。对接D3R模蛋白与刺桐属配体分子,在对接的D3R蛋白的结合腔中选定一个以药物分子为质心,以半径为6的空间范围,计算此空间范围内的所有氨基酸残基与配体分子的作用能量,即残基/配体的结合能或排斥能,据此得到配体分子与受体蛋白的活性结合位点。; 马丽英徐四川; 关键词：同源模建分子对接

牛视紫红质蛋白质中视黄醛的活性位点被引量：3: 2009年; 视紫红质蛋白是一个跨膜蛋白,视黄醛(RET)在该蛋白中的活性结合位点涉及到视觉过程机理,与一些眼科疾病病理有关.基于牛视紫红质蛋白1U19的蛋白质晶体结构数据,采用密度泛函理论的B3LYP方法计算RET-Lys296残基与视黄醛分子周围半径为0.6nm的空间范围30个氨基酸残基相互作用和结合能.数值显示1U19蛋白中的残基Glu113、Glu181和Glu122是质子化的RET-Lys296残基的活性结合位点,结合能分别为-333.38、-205.67和-194.56kJ·mol-1.这些氨基酸残基带有一个负电荷,与质子化的RET-Lys296残基发生强烈的离子静电相互作用.另外几个残基Ala292、Cys187、Phe293、Pro291以及Trp265等与质子化RET-Lys296残基也有相互吸引作用.当RET-Lys296残基非质子化,上述相互作用消失,促使视黄醛分子与视蛋白分离.研究发现残基Glu113和Glu181周围各自有一个结晶水分子通过双氢键形式起着稳定作用.; 徐四川邓圣荣马丽英史强葛茂发张兴康; 关键词：视紫红质活性位点密度泛函理论

星际媒介H_2NCH_2CN与H_2O反应中的H_2O分子偶合质子转移机理和氢隧道效应(英文)被引量：1: 2009年; H2NCH2CN+H2O→H2NCH2C(OH)NH是一个重要的反应,涉及到星际媒介中甘氨酸的形成,与早期地球上的氨基酸起源有关.如果没有考虑氢隧道效应,在MP2/6-311+G(d,p)级别上计算反应能垒是254.7kJ·mol-1,在星际媒介中该气相反应很难进行.在星际媒介冰颗粒表面上,水分子催化反应增强了该化学反应的活性.H2NCH2CN与(H2O)3反应中的两个水分子作为催化剂降低活化能77.5kJ·mol-1和活化自由能70.9kJ·mol-1,并且通过氢键桥协同传递质子.量子氢隧道对于该反应进行至关紧要,采用小弯曲隧道(SCT)近似和正则变分过渡态理论(CVT)方法研究.温度50K时,速率常数kSCT/CVT为1.86×10-23cm3·molecule-1·s-1,表明在星际媒介中通过质子隧道机理该反应容易进行.研究结果与地球上的氨基酸起源于地球本身物质的观点相一致.; 徐四川马丽英卞富永史强葛茂发张兴康; 关键词：质子转移

ADP核糖基转移酶蛋白活性位点的研究: ＜正＞ADP 核糖基转移酶影响肿瘤发生和生命老化。体外和体内研究表明抑制 ADP 核糖基转移酶则可降低 DNA 修复功能,增强放疗和化疗对肿瘤的治疗效果。ADP 核糖基转移酶是一个潜在的治疗癌症靶点。所以,研究 ADP ...; 徐四川王宁邹成亮王琳马丽英邓圣荣经山; 文献传递

多巴胺第三受体蛋白模建及其应用研究: 本论文有三章。第一章氨基乙腈(H2NCH2CN)是Strecker合成甘氨酸分子的中间分子，它与水分子反应涉及氨基酸起源的研究。本文采用量子力学从头计算，MP2计算方法和CCSD(T)计算方法，结合6-311+G(d，p...; 马丽英; 关键词：同源模建分子对接

NO3^-＋Cl2→ClONO2＋Cl^-反应势能面和势能阱被引量：2: 2008年; 采用密度泛函理论B3LYP方法和6-311+G(d)基组,计算构建离子-分子气相反应NO3-+Cl2→ClONO2+Cl-的三维势能面.三维反应势能面证明该反应没有过渡态和势能垒,但是存在一个深达-55.0kJ/mol的势能阱(以氯气分子和硝酸根离子相隔无穷远为参量).在势能阱底部,有个化合物(O2NOClCl)-称为势阱化合物,依赖于势能阱而稳定存在.理论红外光谱预测低温红外光谱能检测该势阱化合物.低温条件下,该反应由热力学控制,反应产物是势阱化合物(O2NOClCl)-.当温度升高,该反应由动力学控制,势阱化合物(O2NOClCl)-不稳定,发生分解反应,重新生成NO3-和Cl2.研究结果可用来解释低温时ClONO2与Cl-气相反应不能产生Cl2的原因.; 迟绍明王宁马丽英方芳田国才李国宝徐四川; 关键词：势能面化学动力学

H2NCH2C（OH）NH→H2NCH2CONH2质子转移反应从头计算研究: ＜正＞2-氨基乙酰亚胺酸（H2NCH2C（OH）NH）分子是氨基乙腈（H2NCH2CN）Strecker水解反应生成甘氨酸的中间体分子,它的质子转移反应涉及到氨基酸起源的研究。采用量子力学从头计算,MP2计算方法和CCS...; 邓圣荣马丽英王宁单香丽张令霞徐四川; 关键词：质子转移 MP2 PCM; 文献传递

冬虫夏草多糖开发应用研究: 苏任马耀辉曹家麒邓岚张永平马丽英陈爱群魏容城张玲祺施南华; 《虫草菌开发应用研究》项目研究开发了虫草系列产品，深受用户欢迎，有较好的知名度。《冬虫夏草菌多糖开发应用研究》完成了菌种的鉴定和安全性评价，虫草多糖理化物质研究，多糖组成和结构分析，建立了多糖测定方法和产品质量企业标准。...; 关键词：; 关键词：冬虫夏草菌多糖

CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2反应的溶剂化: 2008年; 气相反应CIONO2＋Cl^-→NO3^-＋Cl2 ，存在一个深达-55．3kJ／mol的势能阱，低温时阻止该反应产生产物NO3^-和Cl2。本文采用B3LYP／6—311＋＋G（d，P）理论方法，研究该化学反应中水分子溶剂化作用，探讨溶剂化过程反应机理。研究结果显示，水分子溶剂化作用使该反应势能阱消失，反应快速产生产物NO3-和Cl2。; 迟绍明王宁方芳邓圣荣马丽英徐四川; 关键词：密度泛函理论溶剂化

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马丽英