高林
- 作品数:4 被引量:11H指数:3
- 供职机构:上海师范大学生命与环境科学学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会基础研究重点项目更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程更多>>
- 高效菲降解菌降解特性与蛋白组学研究被引量:3
- 2008年
- 研究了各种条件下高效菲降解菌ZX16对菲的降解特性,并借助一维与二维蛋白质组学分析技术,比对了菲诱导前后ZX16蛋白表达差异.结果表明,该菌株利用菲生长的最适温度为35℃,最适pH为7.5,可以耐受并降解2500mgL-1菲,不能利用邻苯二甲酸,但可利用水杨酸和邻苯二酚.菌株细胞蛋白SDS-PAGE结果显示,菌株在菲诱导12h后,出现两条Mr为19×103和27×103的新增蛋白条带,从二维电泳图谱的相应分子量位置上发现3个新增表达蛋白,质谱分析与生物信息学检索结果表明,2个点分别为芳香族加氧酶小亚基,1个点为顺式氯苯二氢二醇脱氢酶.
- 高林肖明郭鲁申陆贻通赵渝
- 关键词:多环芳烃降解特性蛋白质组学
- 芳烃污染胁迫下产碱假单胞菌的蛋白质表达被引量:1
- 2006年
- 微生物降解是环境中芳烃类污染物处理的重要手段与方法,研究降解菌暴露在污染物下蛋白差异表达的情况,可以揭示微生物利用有机物做为碳源与能源的途径与方法.本项目以蛋白质二维电泳研究结果为基础,对产碱假单胞菌在污染物胁迫下表达的蛋白质点进行N端测序分析,对诱导性的同工酶进行了克隆与测序分析.结果显示,产碱假单胞菌在污染物胁迫下能表达与细菌的趋化性密切相关的蛋白,在研究的菌株中存在同工不同源的酶系统.
- 赵渝郭鲁申高林陆贻通徐亚同
- 关键词:芳香烃生物降解蛋白质组学
- 高效菲降解菌的分离鉴定及细胞表面结构研究被引量:5
- 2008年
- 从东北老工业基地长期受石油与重金属污染的土壤中,分离获得了一株以菲为唯一碳源的高效降解菌株ZX16,通过形态、生理生化和分子生物学鉴定为溶芳烃鞘氨醇单胞菌(Sphin- gomonas aromaticivorans).菌株降解菲的特性研究结果表明,ZX16可耐受2 500 mg/L的菲,对1500 mg/L的菲在72h内降解率为98.2%.不同的重金属离子对菌株的降解效能影响大小依次为Cu^(2+)>Cd^(2+)>Zn^(2+)>Pb^(2+).菌株在中性条件下生长良好,原子力显微镜观察结果表明,菌株在复合污染物胁迫下细菌体积和形态有显著变化,细胞表面结构也从粗糙趋向光滑.
- 赵渝高林徐亚同郭鲁申陆贻通
- 关键词:降解复合污染原子力显微镜
- 反向PCR法克隆芳香烃龙胆酸降解途径中诱导型龙胆酸1,2-加双氧酶基因被引量:3
- 2007年
- 龙胆酸1,2-加双氧酶(GDO)是芳香烃龙胆酸途径的一个关键酶.产碱假单胞菌P25X具有保守性与诱导性各一组GDO同工酶,突变株SNZ28的保守型龙胆酸1,2加双氧酶基因(GDOⅠ)被链霉素/奇霉素抗性基因打断,但在含有龙胆酸盐的基本培养基上,仍能明显观察到GDO的活性.由龙胆酸诱导生长的SNZ28全蛋白二维电泳结果分析,获得了一个与Ralstoniasp.U2的GDO酶有极高同源性的蛋白点.根据对该蛋白点的N端和Q-Tof测序的结果,设计了一对简并引物,克隆了诱导型GDO酶的片段,通过对此片段的分析,设计了逆向PCR引物,利用Southern blot杂交,确定了合适的限制性内切酶(SalⅠ和SphⅠ),以单一酶切的P25X基因组DNA自联后的产物为模板,进行反向PCR.测序表明,获得了一段1047bp与Ralstoniasp.U2.的龙胆酸1,2-加双氧酶具有极高同源性的序列.研究结果揭示了SNZ28中存在诱导型GDO酶.本文中也对不同来源的GDO酶进行了比较研究,其结果为进一步对生物降解基因的进化研究打下了基础.
- 赵渝郭鲁申徐亚同陆贻通高林
- 关键词:芳香烃