孙淳
- 作品数：9 被引量：9H指数：2
- 供职机构：复旦大学附属中山医院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 多因素癌症诊断分类模型的建立和应用
- 2010年
- 随着基因组学、蛋白质组学技术的运用,对癌症相关分子标志物的筛选,以及基于多个分子标志物的诊断分类模型,成为近年来研究癌症诊断问题的热门途径。本文介绍了如何从基因芯片和质谱等数据库中筛选有诊断作用的分子标志物,以及构建高敏感性、高特异性诊断分类模型的技术路线;并根据在各类肿瘤中的研究实例,分析各分类算法的特点。
- 孙淳刘银坤
- 关键词：分子标记物生物信息学
- 非转移性和转移性人肝癌血清糖蛋白凝集素亲和谱的比较研究被引量：2
- 2011年
- 目的应用凝集素亲和技术寻找肝癌转移相关特征性血清糖蛋白凝集素亲和谱,并探讨其生物学意义。方法本研究利用含有13种肿瘤相关的凝集素集合芯片技术,比较研究了非转移性和转移性人肝癌血清糖蛋白凝集素亲和谱,同时采用多重凝集素印迹方法验证凝集素芯片结果。计量资料数据采用双样本异方差t检验,进行两两比较。结果研究证明,与非转移人肝癌血清相比,转移性肝癌血清糖蛋白对麦胚凝集素(wheatgerm agglutinin,WGA)、黑接骨木凝集素(sambucus nigra lection,SNA)、红腰豆凝集素(phaseolus vulgariserythroagglutinin,PHAE)和欧曼陀罗凝集素(datura stramonium lectin,DSA)的亲和作用增强(P<0.05)。提示转移性肝癌血清糖蛋白出现了增多的唾液酸(sialic acid,sia)、N-乙酰葡萄糖胺(N-acetyl glucosamine,GlcNAc)、平分型GlcNAc及多天线、偏二天线糖链结构。结论血清糖蛋白聚糖链的变化与肿瘤侵袭和转移密切相关,为临床筛选肝癌侵袭及转移相关的糖标记提供了重要参考。
- 陈巧佩孙淳张舒康晓楠李岩郭坤孙璐秦雪刘银坤
- 关键词：肝癌肿瘤转移聚糖
- 干细胞因子Oct4在肝细胞癌中的转录调控网络分析
- 孙璐孙淳李岩江凯张钦乐刘银坤
- 肝癌发生过程中的血清糖蛋白凝集素亲和谱比较被引量：2
- 2014年
- 目的应用凝集素亲和技术寻找肝癌高危人群进展为肝癌过程中的特征性血清糖蛋白凝集素亲和谱，并探讨其生物学意义。方法对广西肝癌高发区肝癌高危队列定期进行复查随访，将队列中陆续新发的肝癌、肝硬化、肝炎患者分别组成肝癌组、肝硬化组、肝炎组，并匹配正常对照组，应用凝集素芯片技术，比较肝癌组、肝硬化组、肝炎组及正常对照组的血清糖蛋白凝集素亲和谱，并用Westemblot方法对有意义的差异性糖蛋白进行验证。采用独立样本t检验对组间亲和信号强度进行比较。结果在肝癌的发生过程中，血清糖蛋白表现出对橙黄网胞盘菌凝集素、尾穗苋凝集素（ACL）、伴刀豆凝集素（ConA）、小扁豆凝集素（LCA）、桑橙凝集素、槲寄生凝集素、红腰果E型凝集素（PHA—E）、红腰果L型凝集素（PHA—L）、豌豆凝集素（PSA）、蓖麻凝集素（RCA—I）、西泽接骨木凝集素（SNA）、马铃薯凝集素（STL）、槲寄生凝集素（VAL）和麦胚凝集素（WGA）14种凝集素的亲和信号增强（P〈0．05），提示在肝癌的发生过程中，患者血清里可能存在增多的岩藻糖、N-乙酰葡糖胺、N-乙酰半乳糖胺、甘露糖、平分型GlcNAc、末端β1-4链接半乳糖等结构。将肝癌组的亲和信号增强与其他各组比较，除SNA在肝癌组与肝炎组的亲和信号强度差异无统计学意义（P〉0．05）外，其他凝集素的肝癌组与其他组比较，差异均有统计学意义（P值均〈0．05）。结论广西肝癌高危人群从HBsAg阳性、肝炎、肝硬化，直至进展为肝癌的过程中，血清糖蛋白聚糖的变化具有特征性的差异，提示其与肝癌的发生和发展密切相关，为寻找肝癌早期诊断相关的糖标志物提供了重要参考。
- 景瑞胡衡孙淳黄天壬邓伟利基林余家华刘银坤张春燕
- 关键词：芯片分析技术聚糖
- 肝癌转移相关的骨桥蛋白表达及其糖基化的改变被引量：5
- 2011年
- 目的检测骨桥蛋白（OPN）在不同转移潜能肝癌细胞株及肝癌组织中的蛋白表达水平及其糖基化水平，探讨OPN糖基化改变与肝癌转移的相关陛及其意义。方法用免疫组织化学和Westemblot法检测人肝癌组织（非转移组6例、转移组7例）及不同转移潜能人肝癌细胞株（L02、Hep3B、MHCC97L、MHCC97H、HCCLM3、HCCLM6）中OPN蛋白水平l采用免疫沉淀技术纯化肝癌组织中的OPN蛋白，并采用多重凝集素印迹技术检测转移与非转移肝癌组织中OPN糖基化水平差异。数据统计采用t检验和方差分析。结果OPN在不同转移潜能肝癌细胞株的表达差异具有统计学意义（F=5．04，P〈0．01）。在肝癌组织中，转移组OPN蛋白表达水平明显高于非转移组（t=2．447，P〈0．05），相对吸光度值分别为0．69±0．21和0．45±0．14。免疫沉淀技术成功纯化肝癌组织中的OPN蛋白，后续的凝集素印迹结果显示：与非转移组相比，转移组OPN蛋白对凝集素朝鲜槐、红腰果E型、蔓陀罗、刀豆素A的亲和力较低（P值均〈0．05）。结论OPN蛋白表达水平与肝癌转移潜能增强呈正相关；OPN蛋白的α2，3-唾液酸、平分型GlcNAc、多天线、偏二天线的糖链、高甘露糖型N一糖等糖基化水平改变可能与肝癌转移潜能增高有关。
- 孙海艳李岩郭坤康晓楠孙淳王存刘银坤
- 关键词：肿瘤转移糖基化凝集素类骨桥蛋白
- 干细胞因子NANOG、SOX2在肝细胞癌中的表达及其调控肝细胞癌转移的分子机制
- 肝细胞癌(hepatocellular carcinoma，HCC)死亡率高居恶性肿瘤死亡率的第三位。转移是影响肝癌患者预后的主要因素，而揭示其分子机制是从根本上提高临床治疗效果、延长患者寿命的关键。干性相关转录因子NA...
- 孙淳
- 关键词：肝细胞癌分子机制
- 文献传递
- 一种肝癌转移预测定量抗体芯片及试剂盒
- 本发明提供了一种肝癌转移预测定量抗体芯片及试剂盒，所述的定量检测芯片包括基片和点样在基片上的癌症相关蛋白的特异性抗体、阳性对照和阴性对照，其特征在于，所述的癌症相关蛋白为OPN、ICAM、VEGF、MMP9、IL-8和E...
- 郭坤刘银坤康晓楠高冬梅孙淳
- 文献传递
- 肿瘤研究中凝集素糖链分析技术的应用
- 2010年
- 糖组学在后基因组时代日益受到关注，糖蛋白的比较研究已成为肿瘤研究的热点，凝集素相关的糖链富集、分析技术也得到了广泛发展，运用于研究细胞、体液、组织的蛋白质糖链改变。有别于其他糖富集、鉴定技术，凝集素对不同构型的糖有特异性识别能力，可使糖及其缀合物在避免破坏糖链的前提下得到鉴定。
- 陈巧佩孙淳刘银坤秦雪
- 关键词：凝集素肿瘤糖组学
- 一种肝癌转移预测定量抗体芯片及试剂盒
- 本发明提供了一种肝癌转移预测定量抗体芯片及试剂盒，所述的定量检测芯片包括基片和点样在基片上的癌症相关蛋白的特异性抗体、阳性对照和阴性对照，其特征在于，所述的癌症相关蛋白为OPN、ICAM、VEGF、MMP9、IL-8和E...
- 郭坤刘银坤康晓楠高冬梅孙淳
