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刘茜

作品数：4 被引量：1H指数：1
供职机构：西华师范大学化学化工学院更多>>
发文基金：四川省教育厅自然科学科研项目西华师范大学科研启动基金更多>>
相关领域：理学文学更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇中文期刊文章

领域

  • 3篇理学

主题

  • 2篇激酶
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白激酶
  • 1篇动力学
  • 1篇豆蔻
  • 1篇杂环
  • 1篇肉豆蔻
  • 1篇自由能
  • 1篇位点
  • 1篇五元杂环
  • 1篇相互作用
  • 1篇构象
  • 1篇IMATIN...
  • 1篇从头算
  • 1篇苯
  • 1篇ABL

机构

  • 3篇西华师范大学
  • 2篇四川大学华西...

作者

  • 3篇刘茜
  • 3篇杨丽君
  • 2篇杨胜勇
  • 2篇文丰玉
  • 2篇袁文彬

传媒

  • 1篇计算机与应用...
  • 1篇物理化学学报
  • 1篇西华师范大学...

年份

  • 1篇2013
  • 2篇2012
共 4 条 记 录，以下是 1-3
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排序方式：
从头算方法研究五元杂环与苯环相互作用被引量：1
2012年
采用Gaussian03程序用MP2/6-311g(2d,p)方法计算了三组(9个)五元杂芳环与苯环处于4种构型时相互作用能随二聚体各参数变化的情况,在此基础上用正交实验设计方法探索4种构型下环间相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数的最优值。结果表明,4种构型中,含NH基团的杂环均在与苯环处于T-shaped构型时有最大相互作用能,相互作用能的主要影响因素是环间二面角;含S杂环与苯环相互作用能的主要影响因素及二聚体各参数最优值与二聚体构型及五元杂环所含N原子位置有关;而含O杂环与苯环相互作用能的主要影响因素是环间垂直距离,优势构型为二面角为45°时的Tilted构型。
杨丽君刘茜杨胜勇文丰玉
关键词：五元杂环苯相互作用
激酶ABL与肉豆蔻酰位点小分子作用机理的分子动力学模拟及自由能计算
2013年
采用分子动力学方法研究激酶ABL与ATP位点小分子imatinib、P16及变构位点小分子STJ、MS7、MS9、3YY、MYR等的结合,并用GBSA(generalized Born surface area)方法将结合自由能分解到各残基.自山能计算结果表明,小分子STJ、MS7、MS9有利于imatinib与ABL结合;小分子STJ、MS7、MS9与激酶ABL的结合自由能接近,绝对值均大于ABL与3YY、MYR的结合自由能.能量分解表明,ABL残基ILE502、VAL506、LEU510与STJ和MYR的相互作用是αl螺旋处于弯曲状态的重要原因.模拟过程中ABL肉豆蔻酰口袋残基均方根偏差(RMSD)变化值表明,STJ等小分子抑制剂与ABL结合后降低了肉豆蔻酰口袋残基的柔性.
杨丽君刘茜袁文彬杨胜勇
关键词：激酶自由能
动力学方法研究Imatinib与蛋白激酶的结合构象与结合自由能
2012年
对imatinib两种典型复合物晶体结构imatinib-Abl与imatinib-c-Kit进行比对分析,并利用MM/PBSA方法计算imatinib与Abl、c-Kit、c-Src、p38及Syk等激酶的结合自由能.计算结果表明,imatinib与上述激酶结合时,范德华作用对结合自由能有主要贡献;其中,imatinib与激酶c-Kit结合自由能最低;imatinib与非活性构象激酶的结合自由能明显低于与活性构象激酶的结合自由能.
杨丽君刘茜袁文彬文丰玉
关键词：IMATINIB蛋白激酶动力学
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