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张红宇: 作品数：14 被引量：39H指数：5; 供职机构：上海市肿瘤研究所更多>>; 发文基金：国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会资助项目更多>>; 相关领域：医药卫生生物学更多>>

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尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒: 本发明涉及尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒。本发明公开了2个甲基化敏感基因，它们是LMX1A、VAX1基因。在检测膀胱癌病人手术前留存尿样，上述基因特定CpG位点在随访确定的复发人群中发生高度甲基化。因此，这2...; 余坚王红阳顾健人赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成; 文献传递

ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A基因启动子的甲基化状态可能与3种乳腺癌细胞株对5-FU的敏感性相关被引量：6: 2009年; 目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞宾、5-氟尿嘧啶(5-FU)、双氟去氧胞苷、表阿霉素、丝裂霉素、依立替康和顺铂)的敏感性;同时用甲基化特异性PCR检测23个基因在3种乳腺癌细胞株中的甲基化状态。结果:受试的3种乳腺癌细胞株仅对5-FU的敏感性有明显差异。其中Bcap-37(IC50:317.386μg/mL)对5-FU相对耐药,而ZR-75-30(IC50:6.676μg/mL)和T47D(IC50:73.076μg/mL)对5-FU相对敏感。23个基因中,有6个基因:ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A在敏感和耐药细胞株中的甲基化状态有差异。其中ABCC8、CHFR和BMP3B在5-FU耐药细胞株中呈相对高甲基化状态,而LOX、PRSS21和RASSF1A则在对5-FU敏感的细胞株中呈相对高甲基化状态。结论:本研究所发现的6个基因的甲基化状态可能与乳腺癌细胞株对5-FU化疗敏感性相关,为下一步进行临床评估和机制探讨提供了依据。; 蔡飏孙晋枫黄朝晖余坚何英华戴信兰周小羽徐慧莉顾峻张红宇胡夕春朱景德; 关键词：甲基化特异性聚合酶链反应

用尿沉淀细胞DNA甲基化状态的分析检测膀胱癌被引量：3: 2007年; 目的:确定尿沉淀细胞DNA中的13个肿瘤相关基因启动子的甲基化谱式分析在膀胱癌诊断中的价值。方法:用定性甲基化特异性(methylation specific polymerase chain reaction,MSP)的方法,对92例临床确诊的膀胱癌患者、23例非肿瘤性尿路疾病患者、6例脑外科患者、7例健康志愿者检测了尿沉淀细胞DNA中肿瘤相关基因启动子的甲基化状态。结果:在临床确诊的92例膀胱癌患者中被检测的13个基因的高甲基化状态出现频率显著高于23例非肿瘤性尿路疾病患者,差异有统计学意义(P<0.05)。而6例脑外科患者和7例正常健康人的尿沉淀细胞DNA中,上述基因均为去甲基化状态。若以任一个基因高甲基化为膀胱癌的指征,88.0%(81/92例)的膀胱癌可被检出。结论:MSP法分析尿沉淀细胞DNA中肿瘤相关基因启动子的甲基化状态可有效地检出膀胱癌。; 孟军余坚朱同玉张红宇徐慧莉王韦高宝梅王继纳朱景德; 关键词：膀胱肿瘤尿分析 DNA甲基化甲基化特异性聚合酶链反应

抑制VEGF表达的锤头状核酶系统被引量：3: 2005年; 目的:建立和评估抑制血管内皮生长因子(VEGF)表达的锤头状核酶(hammerhead ribozyrae)技术系统。方法:对VEGF121基因RNA序列进行二级结构分析,选择靶点;设计并构建针对VEGF的分泌肽RNA的可表达锤头状核酶(1-4)载体系统和VEGF-荧光色素酶融合基因报告质粒;通过试管内切割实验等方法评估核酶对于试管内转录得到的VEGF RNA切割特异性和效率; 通过瞬时共转染实验和稳定转染实验评估核酶在细胞内对于VEGF RNA的切割效率。结果:设计和构建了对VEGF RNA二级结构水平上的暴露区(+8,+36和+71位点:核酶1,3和4)和非暴露区(+17位点:核酶2)4个锤头状核酶(1-4)的两套质粒;试管内切割检测表明,针对+8,+36和+71位点的核酶(1,3和4)可以有效地在试管内对VEGF RNA进行特异性切割,使其水平分别降至对照的61.7%,27.6%和44.8%(荧光色素酶活性)或66.3%,27.0%和30.0%(蛋白质水平);将核酶表达质粒与VEGF-LUC模板质粒瞬时共转染入SMMC-7721肝癌细胞,核酶1,3和4 VEGF-LUC水平分别降低到对照的81.4%,56.6%和69.1%;稳定表达针对VEGF 的核酶1,3或4的SMMC-7721细胞株中,内源性VEGF RNA的水平降至对照水平的5%以下。对照未转染的、转染空载体的和转染了核酶2(+17)的SMMC-7721细胞。结论:分别针对VEGF+8,+36和+71位点锤头状核酶可有效地抑制VEGF的RNA水平。; 李晶费琦杨剑峰高宝梅戴信兰张红宇朱景德; 关键词：血管内皮生长因子锤头状核酶抗血管生成

尿沉淀细胞DNA的甲基化谱式分析和膀胱癌的诊断被引量：2: 2007年; 目的:寻找并评估通过对尿沉淀细胞DNA甲基化分析检出膀胱癌的基因组合。方法:甲基化特异性PCR(methylation specific polymerase chain reaction,MSP)。结果:对3株膀胱癌细胞系进行的20个基因启动子区域CpG岛甲基化状态分析发现,除BRCA1以外其他基因至少在细胞株的1个等位基因呈高甲基化状态。对40例膀胱癌组和3组非膀胱癌对照组的尿沉淀细胞DNA进行了6个基因甲基化状态分析发现,SALL3在膀胱癌组甲基化率为67.5%(27/40),MT1A为50.0%(20/40),HPP1为50.0%(20/40),MYOD1为37.5%(15/40),BRCA1为32.5%(13/40),TMS1为5.0%(2/40)。这6个基因在3个非膀胱癌对照组,即非肿瘤性泌尿生殖系统疾病患者23例、脑外科患者6例和正常人群7例均呈去甲基化状态,所以可以受试基因中任一个基因呈现高甲基化状态作为膀胱癌的指征,该法检出膀胱癌的敏感性为90.0%(36/40)。结论:对这5个基因在尿沉淀细胞DNA中甲基化状态的检测可望有效地检出膀胱癌。; 冯旭余坚王植柔张红宇徐慧莉王韦高宝梅孟军朱同玉朱景德; 关键词：DNA甲基化聚合酶链反应

肝癌细胞系中肝癌转移相关候选基因启动子区域CpG岛甲基化和表达水平的相关性研究(英文)被引量：7: 2004年; 背景与目的:DNA甲基化被认为是反映细胞内DNA转录状态的重要表观遗传学标记。本研究旨在对启动子区域CpG岛的甲基化与基因转录水平的相关性进行评估。方法:采用甲基化特异性PCR的方法确定7个与肝癌转移相关的候选基因的启动子区域在6个肝细胞系(包括5个肝癌源性的)中的甲基化状态,并通过半定量PCR的方法确定6个基因稳定态的mRNA水平。结果:仅有纯合和杂合去甲基化的基因状态得到发现。RT-PCR分析表明除了OXCT基因在其处于杂合去甲基化状态的HepG2和HCCLM3细胞中不表达,在其他的情况下,7个候选基因均有表达。讨论:本研究中的7个肝癌转移相关基因的甲基化状态仅在细胞系中部分的反映了基因的转录状态,提示其它转录调控机制的存在。; 李建良费琦余坚张红宇王鹏朱景德; 关键词：肝细胞肝癌甲基化甲基化特异性PCR

3株肺癌细胞中9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性被引量：7: 2004年; 目的　对 3株肺癌细胞中 9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性进行评估。方法　通过甲基化特异性多聚酶链反应法 (MSP)结合DNA测序来确定 3株肺腺癌细胞株 (A5 4 9,SH77和SPE A 1)中 9个基因的启动子CpG岛的甲基化状态 :APC ,CDH13,DAPK1,MGMT ,MYOD1,p16 INK4a,p73,RAR β和WT1基因。同时采用半定量RT PCR的方法来量度下列 5个基因的表达 :CDH13,MGMT ,MYOD1,RAR β和WT1基因。结果　在 9个受检基因之中 ,下列 4个基因在三株细胞中均呈同样的甲基化谱式 :仅有去甲基化 :APC和DAPK1,以及兼有甲基化和去甲基化 :p73和p16 INK4a。而其余 5个基因则表现为不同的甲基化模式。尽管 ,这 5个基因的表达谱式大体上符合其启动子CpG岛甲基化的表达静息的原则 ,个别的例外亦是有的。这提示着与DNA甲基化状态无关的机制可能也会参与该基因的表达调控。; 杨振华商祖斌余坚蔡映云张红宇顾峻徐慧莉朱景德; 关键词：肿瘤相关基因启动子甲基化肺癌

一种高通量多样本多靶点单碱基分辨率的甲基化水平检测方法: 本发明涉及一种高通量多样本多靶点单碱基分辨率的甲基化水平检测方法。本发明还提供了适用于进行人基因组CpG甲基化水平测序的BSP引物。本发明的方法适用于微量样品的基因组DNA检测，本发明的方法不仅可实现高通量检测，而且检测...; 余坚高维强赵仰星孙晋枫张红宇顾峻何英华王韦; 文献传递

尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒: 本发明涉及尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒。本发明公开了2个甲基化敏感基因，它们是LMX1A、VAX1基因。在检测膀胱癌病人手术前留存尿样，上述基因特定CpG位点在随访确定的复发人群中发生高度甲基化。因此，这2...; 余坚王红阳顾健人赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成

抗凋亡基因bcl-2启动子CpG岛的高甲基化状态见于28.3%(13/46例)的膀胱癌患者尿沉淀细胞DNA被引量：6: 2006年; 目的:检测上海地区膀胱癌患者尿沉淀细胞中3个肿瘤相关基因启动子CpG岛的甲基化谱式异常频率,继而评估其应用前景。方法:采用甲基化特异性PCR方法分析尿沉淀细胞DNA中DAPK1、bcl2和hTERT3个基因的启动子CpG岛甲基化状态,并通过RTPCR方法评估DAPK1基因在膀胱癌细胞系中的表达状态。结果:对膀胱癌细胞系中DAPK1基因的启动子CpG岛甲基化状态及其表达(mRNA水平上)所做的分析,确立了高甲基化状态与表达静息化之间的相关性。对46例临床确诊的膀胱癌患者和84例非膀胱癌对照(包括前46例术后的36例)的尿沉淀细胞中DNA甲基化的分析发现,仅bcl2基因的高甲基化见之于28.3%(13/46例)的膀胱癌患者,而84例的对照中均为去甲基化状态。结论:在美国膀胱癌患者尿沉淀细胞中频发DNA高甲基化的靶点在上海地区膀胱癌患者人群中频率很低,因此寻找在后者中频发DNA高甲基化的新靶点实属必要。; 顾连平余坚费琦张红宇徐慧莉顾峻朱同玉朱景德; 关键词：基因,BCL-2 CPG岛甲基化特异性聚合酶链反应

张红宇

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