孙晋枫
- 作品数：11 被引量：14H指数：2
- 供职机构：上海市肿瘤研究所更多>>
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- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- 肝癌中Sall3基因甲基化的研究被引量：1
- 2010年
- 目的:检测Sall3基因在肝癌细胞系和肝癌组织中的甲基化状况及其表达水平。方法:对7株肝癌细胞系、142对肝癌组织和6例正常肝组织进行Sall3基因启动子区域甲基化检测。甲基化研究使用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific polymerase chain reaction,MSP),基因表达水平研究采用实时定量反转录PCR(real-time RT-PCR)。结果:MSP结果显示,7株肝癌细胞株中有6株Sall3基因的启动子区域为纯合甲基化,1株为纯合去甲基化;在6例正常肝组织中Sall3均为纯合去甲基化;在142对肝癌组织标本中,癌旁组织Sall3基因启动子区域甲基化率为18.31%,在癌组织中为64.79%。real-time RT-PCR结果显示,肝癌肿瘤细胞系Sall3mRNA的表达水平明显低于去甲基化的正常肝组织。结论:Sall3基因启动子甲基化在正常肝组织、肝癌组织(和肝癌细胞系)中有明显差异。
- 夏卫倪唯益费琦孙晋枫赵仰星张宏宇顾峻何英华余坚
- 关键词：肝癌甲基化特异性聚合酶链反应
- ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A基因启动子的甲基化状态可能与3种乳腺癌细胞株对5-FU的敏感性相关被引量：6
- 2009年
- 目的:寻找与乳腺癌细胞株间药物敏感性差异相关的基因启动子CpG岛甲基化异常,为DNA甲基化异常作为临床化疗敏感性预测手段提供依据。方法:用MTT法测定3种乳腺癌细胞株(Bcap-37、T47D和ZR-75-30)对9种化疗药物(紫杉醇、紫杉特尔、长春瑞宾、5-氟尿嘧啶(5-FU)、双氟去氧胞苷、表阿霉素、丝裂霉素、依立替康和顺铂)的敏感性;同时用甲基化特异性PCR检测23个基因在3种乳腺癌细胞株中的甲基化状态。结果:受试的3种乳腺癌细胞株仅对5-FU的敏感性有明显差异。其中Bcap-37(IC50:317.386μg/mL)对5-FU相对耐药,而ZR-75-30(IC50:6.676μg/mL)和T47D(IC50:73.076μg/mL)对5-FU相对敏感。23个基因中,有6个基因:ABCC8、CHFR、BMP3B、LOX、PRSS21和RASSF1A在敏感和耐药细胞株中的甲基化状态有差异。其中ABCC8、CHFR和BMP3B在5-FU耐药细胞株中呈相对高甲基化状态,而LOX、PRSS21和RASSF1A则在对5-FU敏感的细胞株中呈相对高甲基化状态。结论:本研究所发现的6个基因的甲基化状态可能与乳腺癌细胞株对5-FU化疗敏感性相关,为下一步进行临床评估和机制探讨提供了依据。
- 蔡飏孙晋枫黄朝晖余坚何英华戴信兰周小羽徐慧莉顾峻张红宇胡夕春朱景德
- 关键词：甲基化特异性聚合酶链反应
- TGF-β1基因rs2241715位点T／T基因型人群患HBV感染相关性疾患的风险更高
- 2008年
- 目的：确立3个在亚洲人群中高频杂合的TGF-β1单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）新位点与HBV感染相关性疾病易感性的关系。方法：采用基因型特异性PCR方法，对129例HBV感染相关性疾病患者（慢性乙型肝炎74例、肝硬化41例、肝癌14例）和41例健康人对照的外周血细胞基因组DNA的TGF-β1基因中，3个在亚洲人群中呈高频率杂合的SNP位点（rs2241715、rs2241716、rs4803455）进行基因分型。结果：正常人的rs2241715基因型及等位基因频率与慢性乙型肝炎、肝硬化和肝癌相比差异有统计学意义（P〈0．05）。rs2241715 T／T基因型的个体患慢性乙肝和肝硬化的相对风险度分别为其他型者的2．974倍（95％CI=1．209—7．314，P=0．018）和3．228倍（95％CI=1．201—8．675，P=0．020）。rs2241716和rs4803455位点的谱式则无上述的相关性。结论：TGF-β1基因的rs2241715 SNP位点T／T基因型可能是慢性乙肝病毒感染相关疾患的易感因素。
- 龚邦东余坚黄朝晖杜德林李仲平李宇舟费琦孙晋枫唐志红朱景德
- 关键词：乙型转化生长因子Β单核苷酸
- 尿液诊断膀胱癌的方法和试剂盒
- 本发明涉及尿液诊断膀胱癌的方法和试剂盒。本发明公开了一组甲基化敏感基因，它们是ECEL1，KCNV1，LMX1A，PROX1，SLC6A20，TAL1，TMEM26，VAX1基因。在膀胱癌病人尿液样品中，上述基因特定Cp...
- 余坚王红阳顾健人杨胜利赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成
- 文献传递
- 一种高通量多样本多靶点单碱基分辨率的甲基化水平检测方法
- 本发明涉及一种高通量多样本多靶点单碱基分辨率的甲基化水平检测方法。本发明还提供了适用于进行人基因组CpG甲基化水平测序的BSP引物。本发明的方法适用于微量样品的基因组DNA检测，本发明的方法不仅可实现高通量检测，而且检测...
- 余坚高维强赵仰星孙晋枫张红宇顾峻何英华王韦
- 文献传递
- 尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒
- 本发明涉及尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒。本发明公开了2个甲基化敏感基因，它们是LMX1A、VAX1基因。在检测膀胱癌病人手术前留存尿样，上述基因特定CpG位点在随访确定的复发人群中发生高度甲基化。因此，这2...
- 余坚王红阳顾健人赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成
- hedgehog信号通路的负调控基因在早期非小细胞肺癌中的甲基化状态及其意义被引量：2
- 2013年
- 目的:研究hedgehog信号通路的负调控基因生长停顿特异蛋白1(growth arrest specific1,GAS1)、人类hedgehog相互作用蛋白(human hedgehog interacting protein,HHIP)和patched1(PTCH1)在早期非小细胞肺癌(NSCLC)中的甲基化状态并初步探讨此3个基因对早期NSCLC的诊断价值。方法:收集Ⅰ期NSCLC患者85例(NSCLC组)并以同期住院的23例非肿瘤性肺部疾病患者作为对照组。采用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation-specific polymerase chain reaction,MSP)检测GAS1、HHIP和PTCH1在5个NSCLC细胞株A549、NCI-H1299、NCI-H460、LTEP-a-2、SPC-A-1中的甲基化状态及其在NSCLC组患者的肺癌组织中、对照组的肺部病变组织中的甲基化状态;分析3个基因诊断Ⅰ期NSCLC的敏感性和特异性。结果:hedgehog信号通路的3个负调控基因除在NCI-H1299中均呈去甲基化状态外,在其他4个肺癌细胞株中均有1～2个基因呈甲基化状态。GAS1、HHIP和PTCH1在NSCLC组的甲基化率高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。GAS1用于临床Ⅰ期NSCLC诊断时敏感性和特异性分别为69.41%、69.57%;HHIP分别为49.41%、82.61%;PTCH1则分别为34.12%、100.0%。结论:PTCH1、HHIP和GAS1在Ⅰ期NSCLC中存在显著的异常甲基化,提示hedgehog的异常激活可能参与了NSCLC的发生和发展。对3个基因在早期NSCLC患者血浆游离DNA中甲基化状态的进一步研究可望为NSCLC的早期诊断提供新的肿瘤分子学标志物。
- 耿峻峰孙晋枫林强顾峻赵仰星王韦张红宇何英华余坚
- 关键词：非小细胞肺癌HEDGEHOG信号通路甲基化
- DNA甲基化在膀胱癌诊断和乳腺癌5-Fu化疗敏感性预期中的价值评估
- DNA甲基化是研究最为深入的非DNA排序依赖的表观遗传学机制,决定着高等生物发育中细胞分化过程中基因转录的记忆。其异常可导致包括肿瘤在内的疾病的发生。分析临床样品中肿瘤细胞的DNA甲基化谱式可望改善肿瘤诊断和预后的临床实...
- 孙晋枫
- 关键词：DNA甲基化膀胱癌乳腺癌化疗敏感性
- 尿液诊断膀胱癌的方法和试剂盒
- 本发明涉及尿液诊断膀胱癌的方法和试剂盒。本发明公开了一组甲基化敏感基因，它们是ECEL1，KCNV1，LMX1A，PROX1，SLC6A20，TAL1，TMEM26，VAX1基因。在膀胱癌病人尿液样品中，上述基因特定Cp...
- 余坚王红阳顾健人杨胜利赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成
- 尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒
- 本发明涉及尿液诊断膀胱癌患者复发危险性的方法和试剂盒。本发明公开了2个甲基化敏感基因，它们是LMX1A、VAX1基因。在检测膀胱癌病人手术前留存尿样，上述基因特定CpG位点在随访确定的复发人群中发生高度甲基化。因此，这2...
- 余坚王红阳顾健人赵仰星孙晋枫张红宇顾峻王韦何英华郭士成
- 文献传递
