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多耐鲍曼不动杆菌分子流行病学分析被引量：5: 2015年; 目的分析云南省第三人民医院鲍曼不动杆菌分离株耐药表型及耐药基因分子流行病学特征。方法2013年6-9月,分离该院不同重症监护室(ICU)院内感染患者鲍曼不动杆菌28株,全自动微生物分析仪分类鉴定及耐药分析。PCR扩增及测序β-内酰胺酶、氟喹诺酮类及氨基糖苷类等抗性基因及IS插入元件及整合子等。结果 78.6%菌株为多药耐药菌,14.3%菌株为广泛耐药菌,7.1%的菌株为泛耐药菌。100%菌株不仅对一代/二代头孢类抗生素耐药,且对三代/四代抗生素CRO、CAZ、FEP及单环β-内酰胺类(ATM)、氟喹诺酮类(CIP、LEV)、氨基糖苷类(AN)及磺胺类(FD)耐药。特别是92.9%菌株对碳青霉烯类抗生素耐药。质粒介导的D类β-内酰胺类抗性基因blaOXA、氟喹诺酮类[aac(6’)-Ib-cr、qnr A及qnr D]及氨基糖苷类(aac A4、aad A1及aac C2)为主要基因型。100%菌株复合携带blaOXA、aac(6’)-Ib-cr及aac A4等抗性基因及整合酶int 1基因。85.7%菌株携带ISCR1。全部菌株为同一脉冲场凝胶电泳(PFGE)克隆群,且多位点序列分型(MLST)优势基因型为ST2。结论云南昆明第三人民医院ICU病房可能存在ST2多耐产碳青霉烯酶A.baumanni院内感染流行,有必要进行进一步流行病学及临床深入调查。防控措施及合理使用抗生素是当地医院当务之急。; 谭红丽程雪琴王勇王勇刘炜刘炜; 关键词：鲍曼不动杆菌多重耐药耐药基因分子流行病学

血清学和分子生物学证实云南省勐海县存在恙虫病流行被引量：1: 2014年; 目的了解云南省勐海县恙虫病流行状况。方法 2011年6 9月,在勐海县采集恙虫病临床诊断和疑似病例急性期和恢复期血液标本,用巢式聚合酶链反应（nPCR）对患者凝血块进行恙虫病东方体（Ot）热休克蛋白（groEL）基因扩增和测序分析。用间接免疫荧光试验（IFA）检测患者血清中Ot-IgG抗体。结果 36例急性期患者凝血块标本经聚合酶链反应扩增,Ot核酸阳性25份,其中14份阳性标本被克隆和测序。同源性和进化分析显示,勐海县14株Ot的groEL区核苷酸同源性为99%～100%,氨基酸同源性均为100%,它们与来自GenBank的BJTZ-OT-O39、AH-GD-OT-S6、UT213、Kato和SH205株之间具有较高的同源性和较近的亲缘关系。17例病例双份血清经IFA检测,其中11例病例的恢复期血清IgG抗体滴度大于急性期血清4倍及以上。根据检测结果,26例病例被诊断为恙虫病（分子诊断15例和血清学诊断11例）。结论首次经血清学及分子生物学证实勐海县存在恙虫病流行。分子流行病学分析表明,勐海县Ot流行株具有稳定的遗传特点和明显的地域特征。; 杨杜鹃张海林苏梅惠王勇程雪琴杨卫红章域震冯云覃谊石山梅殷小栎张丽娟; 关键词：恙虫病巢式聚合酶链反应间接免疫荧光试验

海南省澄迈县斑点热群立克次体分离株多间隔序列分型: 2014年; 目的采用多间隔序列分型(MST)对从海南省澄迈县发热患者及野鼠分离的62株斑点热群立克次体进行分型研究。方法根据文献检索,应用9对成功用于斑点热群立克次体MST分型引物,对实验62株菌进行PCR扩增及测序。校正后序列进行Blast分析。同时,对序列进行Megalign比对分析单核苷酸多态性(SNPs)。将每株细菌成功测序的6段间隔序列按一定顺序拼接并构建进化树。结果使用6对间隔序列引物扩增实验菌株,结果显示每对引物扩增序列均显示较大的变异性,共获得48个变异型,以h3为代表的主要变异型占21.7%(13/60),剩余的47个变异型为独立型,分别占1.6%。进化树分析结果显示48个变异型均归为一簇。同其他参考菌株比较发现,黑龙江立克次体与上述菌株关系密切。SNPs分析发现位点变异主要以T-C转换及A-G转换为主。结论海南地区斑点热群立克次体分离株非编码间隔序列呈高度变异性。MST分型较传统的血清表型分型以及MLST分型更具有鉴别能力,对未来立克次体暴发流行可提供快速有效的流行株追踪。; 程雪琴金玉明老世军黄昌和黄芳贾鹏本张丽娟; 关键词：斑点热群立克次体

铜绿假单胞菌耐药基因分子流行病学调查被引量：3: 2014年; 目的了解云南省昆明某医院临床铜绿假单胞菌分离株耐药特征及耐药基因分子流行病学特征,为临床治疗与控制院内感染提供依据。方法 2013年6 9月共收集全院不同病区感染患者28株铜绿假单胞菌。微生物自动分析仪鉴定菌株及耐药分析。PCR扩增及序列分析β-内酰胺酶bla基因、氟喹诺酮类及氨基糖苷类耐药基因及IS插入元件及整合子。脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分析菌株间遗传变异关系。结果全部菌株呈现多重耐药且存在有广泛耐药性(extensively drug-resistant,XDR)及泛耐药性(pendrug-resistant,PDR)菌。100%(28/28)菌株对一代/二代及大部分三代/四代头孢霉素、磺胺类及叶酸代谢途径抑制剂耐药。85.7%(24/28)菌株对碳青霉烯类抗生素美罗培南(MEM)、亚胺培南(IMP)耐药,50.0%(14/28)菌株对厄他培南(ETP)耐药。92.9%(26/28)菌株同时携带β-内酰胺酶基因、氟喹诺酮类及氨基糖苷类耐药基因,且菌株间基因谱存在较大不同。blaFOX/qnr B/aac A4为主要耐药基因谱(21.4%,6/28)。57.1%(16/28)菌株携带int1整合酶基因,21.4%(6/28)菌株携带ISCR1插入元件,35.7%(10/28)菌株携带ISEcp1插入元件。PFGE显示14株菌株分为8个克隆群。结论本研究铜绿假单胞菌分离株存在较高耐药率,多种耐药基因存在不同克隆菌株中,提示耐药基因在菌株间及不同菌种间存在快速传播风险。; 谭红丽王勇王勇程雪琴刘炜刘炜; 关键词：铜绿假单胞菌多重耐药耐药基因分子流行病学

中国嗜吞噬细胞无形体分离株多间隔序列分型分析被引量：1: 2014年; 目的：对我国嗜吞噬细胞无形体分离株进行多间隔序列分型（MST）分型。方法根据GenBank收录的4株无形体全基因组序列，利用Mauve 2.3.1软件行种内基因组比对，选择具有变异间隔区进行引物设计，通过引物特异性及扩增效率等预实验筛选引物，并对实验菌株进行PCR扩增，分析单核苷酸多态性（SNPs）。将每株菌间隔序列拼接后进行分型分析并构建进化树，分析不同地区、不同动物种类来源菌株遗传变异关系。结果共筛选出22对引物，用于我国11株无形体分离株MST分型，SNPs分析显示，碱基转换发生率最高（60.2%，251/417），其中A-G转换居首（18.9%，79/417），颠换占23.0%（96/417），插入及缺失发生率占16.7%（70/417）。11株菌22条间隔序列拼接后（约11047 bp）均为独立变异型。进化分析发现山东省莱州地区重症患者分离株（LZ-H1、H2、H3、H4、H5）及当地长角血蜱分离株LZ-T1与美国Webster株及HZ株聚为一簇，而北京分离株BJ-H1与新疆分离株XJ-H1和XJ-H3聚为一类。莱州地区另一蜱分离株LZ-T2与新疆另外一人源分离株聚为一类，与莱州重症患者分离株遗传关系密切。结论我国无形体分离株间隔序列存在明显的遗传多态性，MST分型技术可用于无形体疫情暴发时的快速诊断和疫情追踪。; 程雪琴张丽娟

云南某医院多耐药E.coli和K.pneumoniae分子流行病学分析: 2014年; 目的分析云南某医院E.coli和K.pneumonia菌耐药基因分子流行病学特征。方法全自动微生物分析仪分类鉴定菌株及抗生素敏感试验。扩增并序列分析耐药基因。MLST及PFGE分析菌株遗传变异关系。结果共收集23株E.coli菌和9株K.pneumonia菌,除了1株XDR K.pneumoniae,其余均为MDR菌。全部菌株对一代、二代头孢霉素,甚至三代头孢霉素CRO耐药。绝大多数菌株对氟化奎林酮类、氨基苷类及磺胺类抗生素耐药。39.1%和69.6%E.coli携带blaTEM和blaCTX基因,而44.4%和100.0%K.pneumoniae检测到blaTEM和blaCTX基因。bla TEM均为TEM-1基因型。CTX-M-55及CTX-M-15为该地区优势基因型。所有K.pneumonia菌株携带blaSHV基因,SHV-11为优势型。87.5%E.coli和77.8%K.pneumoniae菌株携带ISEcp1。91.3%E.coli和77.8%K.pneumoniae携带int1。44.4%K.pneumoniae携带ISCR1基因。PFGE及MLST研究显示菌株存在明显的遗传多态性。结论云南该医院多重耐药E.coli和K.pneumonia菌呈高度流行,耐药基因在不同菌株及菌种间快速传播。; 谭红丽王勇王勇程雪琴张丽娟; 关键词：多重耐药分子流行病学

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程雪琴

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