纵丹
- 作品数：43 被引量：84H指数：6
- 供职机构：西南林业大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家林业公益性行业科研专项云南省教育厅科学研究基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生建筑科学更多>>
- 西南地区古杨树遗传多样性的SSR分析被引量：8
- 2018年
- 采用SSR分子标记技术,对采集于中国西南地区的7种15个群体共226株杨树古树的遗传多样性进行分析,以揭示杨树古树的遗传变异水平及其遗传关系,为该区域杨树古树资源的合理保护与利用提供依据。结果显示:(1)7对SSR引物组合共扩增出80个多态性位点;以有效等位基因数为标准,7种杨树之间的遗传多样性水平依次为:西南杨>昌都杨>康定杨>藏川杨>乡城杨>川杨>德钦杨;杨树种内群体间的遗传多样性依次表现为:乡城杨的稻城群体>乡城群体>雅江群体,西南杨的理塘群体>乡城群体>稻城群体,德钦杨的香格里拉群体>德钦群体,昌都杨的芒康群体>贡觉群体>昌都群体,藏川杨的德钦群体>芒康群体。(2)乡城杨和西南杨群体内近交系数(F_(is))分别为-0.024 6和-0.253 5,藏川杨、德钦杨和昌都杨的Fis分别为0.205 4、0.240 1和0.029 2;乡城杨、西南杨、藏川杨、德钦杨和昌都杨群体间的遗传分化系数(F_(st))分别为0.156 1、0.253 5、0.128 8、0.182 0和0.177 3;除西南杨群体间基因流N_m小于1外,乡城杨、藏川杨、德钦杨和昌都杨群体间的基因流N_m均大于1。(3)7种杨树古树的遗传相似系数介于0.089 0~0.691 0,平均为0.402 0;UPGMA及Bayesian聚类结果均显示,7个树种可以分为3个大组,即川杨与康定杨聚为一组,乡城杨与西南杨聚为一组,藏川杨、德钦杨和昌都杨聚为第3组;5种杨树古树的群体UPGMA聚类结果显示,除西南杨的理塘群体与乡城杨聚为一组外,各杨树古树种与群体间的聚类关系较为紧密。研究表明,西南地区杨树古树具有较为丰富的遗传多样性,且其遗传变异主要均存在于群体内不同个体之间,任何个体的丧失均会导致杨树古树遗传多样性的降低或丧失,故需要加强对该区域现存古树资源的保护。
- 纵丹周安佩张垚李旦段丽华何承忠
- 关键词：SSR标记
- 滇杨优树遗传多样性的AFLP分析被引量：10
- 2014年
- 以收集于云南和四川的52株滇杨优树为试验材料,并以1株大叶杨、1株北京杨和2株黑杨做类外对照,采用AFLP分子标记技术进行基因组DNA水平检测。结果表明,筛选出的8对EcoRⅠ+3/MseⅠ+3引物组合对52株滇杨优树共扩增出264条带,其中多态性条带174条,多态带百分率为64.52%,检测到有效等位基因数(Ne)为1.184,基因多样度(H)为0.121,Shannon信息指数为0.201,平均遗传相似系数为0.877;对56份杨树样本共扩增出325条带,其中多态性条带共247条,多态带百分率为75.21%,检测出有效等位基因数(Ne)为1.185,基因多样度(H)为0.122,Shannon信息指数为0.209,平均遗传相似系数为0.876。UPGMA聚类分析结果显示,除滇杨优树QXB007与QXJ030外,其余杨树分析样本均能够被鉴别。基于采集地和遗传相似系数的模糊聚类分析表明,52株滇杨优树除开远采集地外,丽江采集地样本与其他采集地样本之间均有交集,说明丽江可能是滇杨的分布中心和起源中心。该研究结果为滇杨人工选择育种、遗传改良、种质资源收集与保存等提供了理论依据。
- 纵丹员涛周安佩刘东玉郑元段安安何承忠
- 关键词：AFLP遗传相似系数UPGMA聚类分析
- 杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物及其应用
- 本发明公开了一组从基因组总DNA中特异性地扩增获得杨树叶绿体全基因组的PCR引物。该PCR引物共有33对，其扩增片段范围为4.0 kb–8.0 kb，扩增产物可直接用于第三代Pacbio测序，且不同扩增片段之间具有100...
- 何承忠纵丹周安佩李旦段丽华张壵邹辛联
- 文献传递
- 地理隔离对西南藏区山杨居群遗传结构影响的SRAP分析被引量：5
- 2015年
- 采用SRAP分子标记技术,对分布于我国西南3个藏族地区山杨9个居群130个个体进行了遗传结构分析。结果表明,筛选出的7对引物组合共检测到多态性条带(AP)99条,多态性条带百分比(PPB)为59.28%。采用POPGENE软件分析,山杨9个居群平均多态位点百分率(PPB)为33.80%,Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)分别为0.130 9和0.213 7,较东北地区山杨具有偏低的遗传多样性。遗传分化系数Gst=0.325 5,表明遗传变异主要存在于居群内个体间。地理距离与遗传距离之间具有弱相关关系(r=0.349,P=94.5%),山脉阻隔效应是导致西南藏族地区山杨居群间遗传分化的主要因素。UPGMA聚类表明,甘孜地区4个居群与迪庆地区的维西居群具有较近的亲缘关系,迪庆地区的德钦、香格里拉居群和昌都地区2个居群的遗传相似度较高。基于西南藏族地区山杨遗传结构分析,建议实施就地保护的同时,建立山杨种质资源库,促进不同居群间的基因交流。
- 何承忠李佳蔓员涛纵丹周安佩欧光龙尹五元
- 关键词：山杨SRAP标记地理隔离
- 光质对滇杨叶片结构及光能利用特性的影响
- 2022年
- 【目的】研究滇杨叶片光谱参数、叶片组织结构以及光合CO_(2)响应曲线对光质的响应,为深入揭示滇杨对高海拔分布区的适应性提供研究基础,也为不同光强条件下滇杨设施育苗的棚膜选择提供理论依据。【方法】设置蓝色、绿色和白色3种颜色的薄膜处理,观测分析透过薄膜的光质以及不同光质下滇杨当年生扦插苗叶片的光谱参数、叶片组织结构参数、光合—光响应(P_(n)-PAR)与光合—CO_(2)响应(P_(n)-CO_(2))的差异。【结果】在不同颜色薄膜处理下,叶片的光谱特征参数与叶片厚度、海绵组织厚度和维管束厚度显著负相关,与上、下表皮厚度、组织结构紧实度和栅海比显著正相关。滇杨在蓝色薄膜和绿色薄膜处理下对高CO_(2)浓度环境的适应能力均较强。蓝色薄膜可促进滇杨对强光的利用能力,增加叶片的栅栏组织厚度、组织结构紧实度和栅海比,更有利于叶片气孔开放进行气体交换;绿色薄膜可促进滇杨对弱光的利用能力,表现出更高的潜在光合作用能力。【结论】蓝膜处理可显著提高滇杨扦插苗对强光的适应能力,绿膜处理可显著提高滇杨扦插苗对弱光的适应能力。
- 王静敏杨青青胡治旭李嘉其纵丹何承忠
- 关键词：光质滇杨光能利用效率
- UGPase与USPase编码基因在滇杨正、倒扦插苗中的组织特异性表达
- 2022年
- 细胞壁对植物生长发育发挥着重要调控作用,而UDPG是植物细胞壁合成的主要前体物质,主要来源于UGPase和USPase催化葡萄糖-1-P和UTP生成。利用生物信息学软件和在线网站对滇杨PyUGPase-A、PyUGPase-B和PyUSPase基因编码蛋白进行预测和分析,同时以1年生滇杨正、倒扦插苗为材料,测量其主枝长度和主枝粗度,并对3个目标基因在茎尖、嫩叶、成熟叶、茎和根中表达量进行RT-qPCR分析,探究PyUGPase和PyUSPase基因在滇杨正、倒扦插苗中的组织特异性表达规律,从而为揭示PyUGPase和PyUSPase基因调控细胞壁合成进而调控滇杨生长的机制提供依据。结果表明:PyUGPase-A、PyUGPase-B和PyUSPase基因全长和编码的氨基酸分别为1410 bp和469个氨基酸、1410 bp和469个氨基酸、1875 bp和624个氨基酸;3个蛋白均不存在信号肽和跨膜结构域,且均定位于细胞质内的一种亲水稳定性蛋白酶;PyUGPase和PyUSPase基因编码的氨基酸序列和其他植物UGPase和USPase基因编码的氨基酸序列相似性达85%以上。倒扦插苗的主枝长度和粗度均低于正扦插苗,但差异不显著。PyUGPase-A和PyUGPase-B基因在2种类型扦插苗的成熟叶中表达量相对较高,但在倒扦插苗的嫩叶中上调表达;而PyUSPase基因在正、倒扦插苗的根中表达量较高,且在5个组织中均呈现下调表达。
- 姜辅瑞纵丹吴治洋张晓琳余进德何承忠
- 关键词：滇杨扦插苗
- 杨树叶绿体全基因组PCR扩增引物及其应用
- 本发明公开了一组从基因组总DNA中特异性地扩增获得杨树叶绿体全基因组的PCR引物。该PCR引物共有33对，其扩增片段范围为4.0 kb–8.0 kb，扩增产物可直接用于第三代Pacbio测序，且不同扩增片段之间具有100...
- 何承忠纵丹周安佩李旦段丽华张壵邹辛联
- 文献传递
- 基于叶绿体片段序列的杨属系统发育关系分析被引量：6
- 2015年
- 以旱柳为外类群,对杨属5个派32个种及杂种63份个体叶绿体DNA(cpDNA)的rbc L-a、psb I-psb K、psb A-trn H、trn L-F序列片段进行系统发育分析。结果表明,4个片段联合后的序列长为2·416 bp,G+C含量为34.1%,含32个信息位点数。最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建的系统进化树的树形一致,白杨派和大叶杨派能各自聚类为单独分支,而青杨派树种被聚分为2组,显示出多系起源的特征。其中,三脉青杨、青杨、大青杨、辽杨为第1组,位于系统树的基部,与胡杨形成姐妹种关系,其余青杨派树种为第2组,与大叶杨亲缘关系较近。黑杨派中的钻天杨和北京杨与同派其他树种差异明显,但与白杨派树种具有同源性,MP和ML的支持率分别为95%和91%,其余黑杨派树种高度同源,以100%的MP和ML支持率呈姐妹群。该研究结果为杨属树种的起源与系统进化关系提供了分子水平的证据。
- 员涛李佳蔓周安佩颜璐茜纵丹李旦何承忠
- 关键词：杨属叶绿体DNA片段序列系统发育
- 不同处理措施对滇杨根萌苗形成与生长的影响被引量：2
- 2014年
- 为建立高效稳定的滇杨返幼复壮根萌苗培育技术体系,以滇杨根段为材料,研究种根长度、切口涂封方式和埋根方式对根萌苗形成及其生长的影响。结果表明:种根长度对根萌苗数量和种根生根数量影响极显著,根萌苗数量和种根生根数量随种根长度的增加而增加,苗高和苗粗随种根长度的增加而降低;切口涂封方式对苗高和苗粗生长有极显著影响,以两端均不涂封的效果最佳;埋根方式对根萌苗数量、种根生根数量、苗高和苗粗的影响均不显著,但斜埋对根萌苗数量、苗高和苗粗的作用效果略优于平埋。
- 刘东玉周安佩纵丹赵雁鸣赵月明何承忠
- 关键词：滇杨无性繁殖根插
- AFLP引物组合数对准确分析马缨杜鹃遗传多样性的影响被引量：4
- 2016年
- 利用5、7、9、11和13对AFLP引物组合对4个居群马缨杜鹃遗传多样性进行分析,探讨不同引物组合数量对其遗传多样性参数指标的影响。结果表明:随着引物组合数量的增加,紫溪山居群遗传多样性的各参数指标变化趋势一致,5对引物组合检测结果略高于其他引物组合数,但差异不显著,其余3个居群的变化规律不明显;不同引物组合数量对居群间遗传距离无显著影响,UPGMA聚类结果完全相同。由此可见,选用5对引物组合对马缨杜鹃进行遗传多样性分析就能够提供较为准确的结果。
- 沈德周纵丹周安佩颜璐茜李旦何承忠
- 关键词：马缨杜鹃AFLP标记引物
