郭东
- 作品数：2 被引量：4H指数：1
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- CD44和CD44v6在大肠癌的表达及其意义被引量：4
- 2010年
- 目的探讨CD44和CD44v6在大肠癌(colorectal carcinoma,CRC)中的表达与其侵袭转移的关系。方法采用免疫组化SABC法检测CD44和CD44v6蛋白在102例大肠正常黏膜、14例腺瘤和102例CRC中的表达。结果CD44和CD44v6蛋白在正常黏膜的低表达和癌组织的高表达差异有显著性(P<0.01);随着分化程度的降低,Dukes分期的增加,其表达逐渐增高;淋巴结转移和远处器官转移组中的表达均高于未转移组,且差异有显著性(P<0.05)。结论CD44和CD44v6可以作为预测CRC侵袭转移潜能的生物学指标。
- 徐胜美马红梅郭东
- 关键词：大肠癌CD44CD44V6免疫组化
- hsa-miR-30b靶基因预测及其相关生物信息学分析
- 2015年
- 目的通过生物信息学分析预测hsa-mi R-30b靶基因和功能,为深入研究hsa-mi R-30b的生物学功能和调控机制提供理论指导。方法利用Pub Med检索mi R-30b相关文章,通过mi RBase在线工具分析mi R-30b序列和基因组特征。应用mi RWalk综合数据库对hsa-mi R-30b靶基因进行预测,对靶基因集合应用Cytoscape及其插件Bingo进行功能富集分析,应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析。mi RBase、Pub Med、mi RWalk数据库通过输入hsa-mi R-30b或mi R-30b名称进行检索,Cytoscape及其插件Bingo和DAVID数据库则输入hsa-mi R-30b靶基因进行分析。结果 mi R-30b序列在多物种间具有一定的保守性。mi RWalk综合数据库预测靶基因交集共125个。hsa-mi R-30b靶基因主要富集于生长发育、细胞迁移、细胞周期、胰腺细胞分化、转录调控、神经系统发育等(P<0.01);KEGG生物通路主要富集于Notch信号通路及年轻起病成人型糖尿病、致心律失常性右心室心肌病、小细胞肺癌和前列腺癌疾病通路(P<0.05)。结论 hsa-mi R-30b预测的靶基因集合富集于多个生物学过程及疾病通路,与肺癌、前列腺癌等多种肿瘤密切相关,为hsa-mi R-30b在肿瘤方向的后续研究奠定基础。
- 刘曙光马红梅王新根李静郭东徐胜美
- 关键词：靶基因信号通路生物信息学
