张堃
- 作品数:2 被引量:2H指数:1
- 供职机构:江南大学理学院更多>>
- 相关领域:医药卫生理学自动化与计算机技术更多>>
- 基于概率转移矩阵的氨基酸连接偏好性研究被引量:2
- 2012年
- 在Markov模型的基础上,提出了状态空间上合并映射的概念,以及合并过程下转移概率的计算方法。在已有氨基酸分类方法的基础上,结合Markov模型的概率转移矩阵,对氨基酸连接的偏好性进行了研究。结果表明:同一家族的蛋白质序列的氨基酸连接具有一定的偏好性,这种偏好性与氨基酸的分类有关,从而进一步说明了分类的科学性,同时这种偏好性对氨基酸序列的预测具有一定的作用。
- 张堃唐旭清
- 蛋白质序列的矩阵图谱表达被引量:1
- 2011年
- 基于经典HP模型,利用蛋白质序列的矩阵图谱表达法(MGR)及数值刻画的思想提出了一种新的蛋白质序列的比对方法,通过观察蛋白质序列的数值刻画图及计算两蛋白质序列之间的欧氏距离d,对木聚糖酶两家族的蛋白质序列进行了相似性分析.发现被划分为同一木聚糖酶家族的蛋白质序列之间的相似性更大,而且蛋白质序列的相似性程度与分子大小、结构和分子进化相关.
- 张堃赵静静唐旭清
- 关键词:木聚糖酶