郑渝池
- 作品数：13 被引量：28H指数：3
- 供职机构：中国科学院成都生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 基于线粒体基因序列的角蟾科Megophryidae(Anura)属间系统关系
- 角蟾科Megophryidae(Anura)是原始无尾两栖类(archaeobatrachians)中物种和多样性最丰富的一个科,共10属.丰富的多样性使其能够为生物学的诸多领域(如进化、生物地理、行为生态、功能形态学等...
- 郑渝池
- 关键词：角蟾科系统发育姐妹群
- 文献传递
- 两栖类皮肤石蜡切片样本量探讨——以峨眉髭蟾毛细血管丰富度为例被引量：1
- 2020年
- 石蜡切片是量化两栖动物各种皮肤特征的常用技术,但在两栖动物中缺乏取样标准。血管密度等无法直接度量的特性可能需要较大的样本量,探讨这类特征的取样标准有利于实践工作。本研究对雄性峨眉髭蟾Leptobrachium boringii表皮下毛细血管丰富度进行量化,并通过重抽样分析该特征所需样本量。实验获得2只个体10个部位数据,每个部位模拟29种抽样。结果显示,体型较小个体多数部位需接近20条组织或更高的样本量,体型较大个体多数部位所需样本量接近15条或更高。建议在两栖类皮肤石蜡切片工作中对全部有效切片进行制片,以满足不同特征对样本量的要求。表皮下毛细血管丰富度与所需样本量呈负相关关系,可能缘于高密度部位的血管分布更均匀。如在其他两栖动物类群中亦观察到该相关性,则有助于在量化该特征时合理选取样本量。
- 许双戴强张丕珠郑渝池
- 关键词：石蜡切片两栖动物皮肤毛细血管密度
- 基于亲缘关系的红蛤蚧与黑蛤蚧药效再评估被引量：1
- 2011年
- 目的基于药用亲缘学原理,对红、黑蛤蚧药效情况进行再评估。方法通过Mega软件,采用MP法构建系统发育树,基于系统发育树判断红、黑蛤蚧之间的亲缘关系,并依此探讨红、黑蛤蚧及药效之间的关系。结果红、黑蛤蚧在系统树上相互嵌合在一起,不能各自形成独立分支(单系),来自不同产地的红、黑蛤蚧分别构成了4个独立支系,这与红、黑蛤蚧截然可分的概念相悖。结论红蛤蚧可能具有和黑蛤蚧相似的药效,不同地区的红、黑蛤蚧药效可能存在差异。该研究旨在为红、黑蛤蚧的药效及化学成分研究提供前瞻性的建议,即开展相关研究应基于亲缘关系,分别对不同产地红、黑蛤蚧样品进行分析。
- 顾海丰夏云彭锐郑渝池李力曾晓茂
- 关键词：药效
- 基于16S rRNA序列的角蟾科部分属间系统关系被引量：8
- 2004年
- 采用最大似然法 (ML法 )、最大简约法 (MP法 )、邻接法 (NJ法 )对来自角蟾科Megophryidae (A nura) 8属 17种及外群 2种共 2 5条 4 0 0bp左右的线粒体 16SrRNA序列进行系统发育关系分析。结果表明 ,用于分析的所有角蟾科物种形成两大支 ,第一支包括Megophrys ,Brachytarsophrys和Atympanophrys ,第二支包括Leptobrachium ,Leptolalax ,Scutiger ,Oreolalax和Vibrissaphora。支持将角蟾科划分为两大类群 ,即第一支属于Megophryini族 ,第二支属于Leptobrachiini族。根据分子钟模型初步推测两类群间的分歧时间大致为 14 2～ 18 7百万年前。在Megophryini族中 ,基因树的拓扑结构不支持Atympanophrys建立后的Megophrys为单系 ;而在Lep tobrachiini族中 ,Leptolalax为一有效属 。
- 郑渝池莫邦辉刘志君曾晓茂
- 关键词：拓扑结构系统发育角蟾科物种
- 中国两栖动物系统进化与保护
- 费梁叶昌媛江建平谢锋曾晓茂李成李健王跃招戴强郑渝池王斌陈跃英李胜全刘炯宇吕可
- 1、课题来源与背景：调查清楚中国两栖动物资源的物种多样性及研究其系统进化是认识和理解、管理、科学利用和有效保护两栖动物资源的科学基础。该项目先后得到国家自然科学基金委员会、中国科学院、四川省、中科院成都生物所等的立项资助...
- 关键词：
- 关键词：两栖动物系统进化动物生态学保护生物学
- 棘腹蛙线粒体局部重复序列非排序聚类
- 2018年
- 动物线粒体基因组发生局部串联复制后,涉及区域具有多基因拷贝、假基因化、大量插入缺失的特点,难以排序和构建基因树。而不依赖排序的聚类方法理论上可用来归纳和展示这类序列的差异,但未见相关评估和运用。本研究选取棘腹蛙Quasipaa boulengeri 19号个体,以3类常用的基于特定长度(k)子序列集的非排序算法,依次设k值为4、6、8……20,对其轻链复制起点邻近复制区域583~695 bp的序列进行聚类。构建相同个体线粒体1 518 bp蛋白编码序列最大似然树为参照,计算和考查两者间拓扑结构距离和差异。所评估的28种算法中,半数可在主要为8的特定k值下产生和最大似然树拓扑结构相差仅2个节点(11.8%)的聚类树,部分算法在不同k值下均表现不佳,较小的k值(4)适合解析差异程度相对较高的序列间关系。这些结果例证了动物线粒体重复序列非排序聚类的可行性,其中的算法、k值理想组合可能适合类似系统。建议对其他类型的复制重排系统进行类似评估。
- 曹跃夏云郑渝池
- 关键词：棘腹蛙线粒体DNA聚类
- 四川泗耳自然保护区及邻近地区两栖爬行动物初步调查被引量：3
- 2003年
- 20 0 2年 9月 4～ 16日对四川省平武县泗耳自然保护区及邻近地区的两栖爬行动物进行了调查。共发现 16种 ,隶属 12属 7科。动物地理区系组成分析表明该地以东洋界西南区成分为主 ,同时周围各动物地理区的某些物种在这里交汇。建议适当扩大该保护区的面积 ,使其包括一些较低海拔的生境 。
- 郑渝池刘志君李成牛喜塔刘少英冉江洪曾晓茂王跃招
- 关键词：爬行动物区系组成两栖动物
- 两栖动物线粒体基因组tRNA基因重复、丢失及其影响被引量：2
- 2010年
- 在脊椎动物线粒体基因组中,偶有tRNA基因重复或丢失事件发生,这些事件因与相应氨基酸转运密切关联而凸显重要.两栖类中,这些重复或丢失相对多样,可为相关研究提供良好素材.为了解这些事件对氨基酸对应的密码子使用偏好是否产生影响,本文引入统计方法,检测10种两栖类mtDNA蛋白编码基因相对的同义密码子使用度(RSCU),并特别设计将发生tRNA基因重复或丢失物种与其近缘群进行对比分析.结果显示,tRNA基因的重复对密码子使用偏好没有显著的影响,推测可能与突变积累的时限和mtDNA紧凑性有关.另外,tRNA基因丢失也未使相应氨基酸密码子使用偏好产生明显的改变.推测在两栖类中,"tRNA转入"和"tRNA反密码子摆动位点的超级摆动"可能是tRNA基因丢失的补偿方式.
- 夏云彭锐郑渝池曾晓茂
- 关键词：两栖类线粒体基因组
- 棘腹蛙(Quasipaa boulengeri)易位和非易位种群5SrDNA及端粒序列(TTAGGG)_n的荧光原位杂交比较分析被引量：1
- 2013年
- 棘腹蛙广泛分布于四川盆地周边及毗邻的低山区.我们前期的研究显示,在棘腹蛙中存在5种由易位引起的核型,这些核型随机分布在不同的种群中.5S rDNA和端粒序列(TTAGGG)n是染色体鉴定和演化研究的良好标记.本研究采用荧光原位杂交的方法,对棘腹蛙的14个种群进行了分析,目的在于了解易位和非易位种群间在这两种序列上是否存在差异.7个易位种群中,5S rDNA杂交信号位于所有核型1号染色体长臂近着丝粒区.7个非易位种群中,除1号染色体上的信号外,在BZ和BFX两个种群的5号染色体的长臂末端也检测到了微弱的信号,推测1号染色体上的5S rDNA位点可能代表祖先状态,而5号染色体上的位点则代表衍生状态.在大部分种群中,1号同源染色体间或是姐妹染色单体间的5S rDNA信号强度有差异.7个易位种群中,端粒序列位于所有染色体的末端,相互易位的1和6号染色体上未见内端粒序列(ITSs).6个核型正常的种群中,除端部端粒信号外,BF和KKS种群的部分个体的3号染色体长臂有微弱的ITSs信号,推测棘腹蛙中发生易位的种群较具ITSs的种群分化更早.在某些种群中,部分大染色体上的端部端粒信号较小染色体上弱.
- 卿立燕夏云郑渝池曾晓茂
- 关键词：棘腹蛙RDNA
- 一种改进的齿突蟾动物肌肉线粒体DNA提取方法被引量：3
- 2004年
- 以1号冷冻保存(-20℃)的齿突蟾标本为材料,建立一种动物肌肉线粒体DNA的快捷提取方法.取10 g冷冻保存的肌肉组织,在研钵中剪碎,液氮研磨成粉;然后加SE缓冲液混匀,转入10 mL离心管静置10 min;上清液转入2 mL的Eppendorf管,1 000×g离心10 min,取上清液,再12 000×g离心15 min,沉淀即为线粒体;最后用SDS碱裂解法分离得到mtDNA.
- 莫邦辉袁水全郑渝池郭骁才曾晓茂
- 关键词：线粒体DNAMTDNA
