陈雅琼
- 作品数：20 被引量：132H指数：7
- 供职机构：中国农业科学院烟草研究所更多>>
- 发文基金：国家高技术研究发展计划国家烟草专卖局基金青岛市科技发展计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程更多>>
- 绒毛状烟草基因组中SSR位点的信息分析被引量：3
- 2011年
- 通过SSRFINDER软件搜索绒毛状烟草基因组DNA,设置条件是重复单元长度2~5 bp,重复次数10～60,共找到6 441个SSR位点,涉及5 227个Scaffold,SSR序列总长为303 963 bp,约占全基因组的0.12‰,即绒毛状烟草基因组中平均每400 kb会出现一个SSR位点。在所有SSR位点中,二、三碱基重复基元分别占总数的45.2%和49.6%,重复单元的重复次数10～20之间的SSR位点占总数的74.6%。
- 王卫锋晁江涛龚达平王鲁李凤霞陈雅琼孙玉合
- 关键词：简单重复序列基元
- 湖北省烟草黑胫病菌生理小种研究初报被引量：11
- 2011年
- 在湖北省襄樊、恩施等主要烟区采集烟草黑胫病病株样本111个,分离纯化出30个烟草黑胫病菌株。采用游动孢子悬浮液注射接种鉴别寄主和TTZ(2,3,5-氯化三苯基四氮唑)颜色反应两种方法鉴定其生理小种类型。结果表明,供试的30个菌株在TTZ培养基中的反应皆为红色,有24个菌株在鉴别寄主反应中对L8和NC1071有较强致病力,而对N.nesophila无致病力,应为1号生理小种,占供试菌系的80%,为湖北省优势生理小种;其他6个菌株中有4个菌株对NC1071有较强致病力,但对L8致病力较弱,有1个菌株对L8和NC1071致病力较弱;1个菌株对NC1071致病力较弱,但对L8有较强致病力;6个菌株对N.nesophila无致病力,是否为2号生理小种还是其他致病型,尚待进一步研究确定。
- 李锡坤孔凡玉李锡宏王静张成省冯超陈雅琼刘璇苏振刚李佰乐
- 关键词：烟草黑胫病菌生理小种
- 马铃薯基因组编码区域SSR位点的分布、特征和所编码蛋白功能分析
- 2015年
- 在不同物种中,微卫星(simple sequence repeats,SSR)序列的数目、类型及其分布情况有很大差异。本研究利用Perl语言开发用于探寻编码区SSR位点的程序,并用SSRHunter软件验证,来分析马铃薯基因组编码区中SSR位点的分布情况。结果显示:在马铃薯的56 218条编码区序列中,检索到2 920条共含有3 512个SSR位点的序列,其中2 519条序列只含有一个SSR位点(占86%);含三核苷酸、六核苷酸重复单元的SSR数目最多,分别为2 358和1 075个,两者占总数的98%,其他类型的重复单元出现次数较少;构成微卫星序列的不同重复单元有603个;六个核苷酸的重复单元重复次数一般最少为三个,三核苷酸GAA重复单元重复次数最高,为193次。在自然选择规律下,编码区中SSR序列长度趋向于密码子的整数倍。运用Pfam数据库对含有SSR的编码序列进行功能分类,其中最多的是RPW8抗性蛋白功能。可利用SSR序列的特异性,筛选马铃薯不同物种的相关编码序列。
- 孙亭亭王大伟陈乐王卫峰龚达平陈雅琼孙玉合
- 关键词：马铃薯SSR简单重复序列基因编码区
- 基于SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术的我国烟草审(认)定品种遗传多样性研究
- 烟草(Tobacco)作为一种重要的经济作物,经过自然条件和人工选择培养,以及不断地从国外引进,在我国已形成了丰富多彩的品种资源。从1986年开始对烟草品种实行审(认)定制度以来,到2010年为止,我国全国烟草品种审定委...
- 陈雅琼
- 关键词：烟草审定品种SSR标记毛细管电泳
- 烟草叶片蛋白质组双向电泳实验体系的建立被引量：3
- 2012年
- 选用干旱敏感型栽培烟草品种中烟100旺长后期的叶片和感黑胫病栽培烟草品种小黄金1025苗期的叶片作为实验材料,总蛋白质提取分别采用稍加改进的TCA/丙酮法和由蛋白质分级提取、酚抽提及丙酮洗涤相结合的方法。对中烟100旺长后期烟草叶片采用的总蛋白质TCA/丙酮提取方法进行了优化、对其使用的IPG胶条pH范围做了初步筛选,并在此研究基础上,对采用第二种提取方法获得的小黄金1025苗期烟草叶片总蛋白质样品进行了不同上样量对双向电泳结果影响的比较实验。初步建立起适合烟草叶片蛋白质组研究的双向电泳实验体系。
- 王绍美罗成刚刘贯山冯全福苏振刚陈雅琼蒋彩虹孙玉合
- 关键词：烟草叶片蛋白质组双向电泳
- 茄子microRNAs与其靶基因的生物信息学预测被引量：6
- 2011年
- microRNAs(miRNAs)是一类在真核生物中发现的长度为21 nt左右、非编码、内源性的单链小分子RNA,通过与靶基因的互补发挥转录后水平的负调控作用。目前,已在许多物种中报道了miRNAs的存在,然而还未见关于茄子miRNAs的报道。根据miRNAs在植物中的高度保守性及其前体的二级结构特征,文章通过同源预测的方法,将已知植物的miRNAs与茄子EST数据库比对,经过一系列的筛选,最终预测到12个家族的16条茄子miRNAs,其中包括3个miRNA家族的正义/反义miRNAs,而miR390和miR399家族的正义/反义miRNAs属于第一次发现。文章还通过在线软件psRNATarget预测到15条茄子miRNAs的71个靶基因,这些靶基因主要编码与茄子生长发育、新陈代谢以及胁迫响应等过程相关的蛋白。
- 张磊晁江涛崔萌萌陈雅琼宗鹏孙玉合
- 关键词：茄子靶基因生物信息学EST
- 普通烟草种质资源的SSR标记与指纹图谱分析被引量：25
- 2011年
- 利用SSR标记构建了烟草核心种质中80份普通烟草种质的指纹图谱。从286对SSR引物中筛选出8对多态性较好的引物,对这些烟草种质进行分析,共检测到85个多态性位点。研究表明,这8对多态性SSR引物可以将80份烟草种质完全区分开,每份种质都有各自独特的指纹图谱,表明SSR标记完全适用于普通烟草种质鉴定和指纹图谱构建工作。
- 徐军刘艳华任民牟建民张兴伟陈雅琼王志德
- 关键词：烟草SSR指纹图谱构建
- 烟草腋芽发育相关基因的克隆与功能分析
- 植物分枝发育在植物形态建成中具有十分重要的地位。研究表明，植物的分枝发育过程受遗传因素和环境条件等的共同影响。对植物侧枝发育有显著调控作用的基因大部分属于GRAS、TCP或R2R3-MYB基因家族，这三个基因家族均编码植...
- 陈雅琼
- 关键词：烟草腋芽克隆技术功能分析
- 一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法和材料
- 本发明提供了一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法，所述方法包括以下步骤：S1、将转基因烟草进行播种、育苗和移栽，并进行打顶；所述转基因烟草的基因组中插入有外源核酸；所述外源核酸包括化学诱导型启动子和致死基因；S2、在打顶后...
- 吕婧代常波陈雅琼丁安明高晓明孙玉合
- 一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法和材料
- 本发明提供了一种烟草打顶后抑制其侧枝生长的方法，所述方法包括以下步骤：S1、将转基因烟草进行播种、育苗和移栽，并进行打顶；所述转基因烟草的基因组中插入有外源核酸；所述外源核酸包括化学诱导型启动子和致死基因；S2、在打顶后...
- 吕婧代常波陈雅琼丁安明高晓明孙玉合
- 文献传递
