吴晓建
- 作品数：4 被引量：14H指数：2
- 供职机构：天津大学化工学院制药工程系更多>>
- 发文基金：天津市自然科学基金国家杰出青年科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生化学工程自动化与计算机技术更多>>
- 生物信息学应用于代谢物组学研究的进展被引量：10
- 2005年
- 如何利用代谢物组的海量数据和信息,与其他领域整合并重构完整的生化网络,建立预测细胞表型、优化生化过程和评价药物安全性的崭新方法是生物信息学需要解决的重要问题.本文综述了代谢物组数据分析中应用的主要生物信息学方法及关键问题,列举了各种方法在植物、微生物及哺乳动物体系的重要应用.最后对代谢物组学的前景进行展望.
- 吴晓建李晶刘昌孝元英进
- 关键词：系统生物学代谢物组学生物信息学模式识别
- 代谢物组学信息挖掘的WT-HCA方法被引量：2
- 2007年
- 针对现有的代谢物组学信息挖掘方法存在的问题,尝试将小波分析(wavelet analysis)与无导式模式识别手段等级聚类分析(hierarchical clustering analysis,HCA)相结合,整合小波分析在频域去噪及信息提取的能力和等级聚类分析客观性强的特点,建立了小波变换-等级聚类分析(wavelet transform-hierarchical clusteringanalysis,WT-HCA)方法。以文献拟南芥代谢物组数据为例,考察了所建立方法提取代谢物组信息的能力。结果表明,WT-HCA方法可以有效地提取代谢物组信息。在系统默认距离定义方案下,WT-HCA方法能将亲本两类样品完全分开,而HCA方法基本不能将样品区分开;在另一种距离定义方案(样品间距离为欧氏距离,类间距离为离差平方和距离)下,WT-HCA方法将4类样品中的3类完全正确归类,总的分类正确率达到了93.75%,显著高于HCA所得到的84.375%的总体分类正确率。
- 夏金梅吴晓建元英进
- 关键词：代谢物组学模式识别小波变换
- 代谢组学用于外源物安全性评价研究进展被引量：2
- 2006年
- 目的介绍代谢组学在安全性评价中的研究进展。方法总结代谢组学特点及主要技术,并介绍其在环境、食品和药物等外源物安全性评价方面的应用。结果代谢组学在安全性评价应用过程中不但正确预测了样本类别,同时成功的识别了可能的生物标志物。结论随着高分辨、高通量现代分析技术的进一步发展和生物信息学方法的不断改进,代谢组学必然带来了一场安全性评价的革命,同时也为中药的安全性评价提供了新的科学理论和方法学指导。
- 宋琳吴晓建刘昌孝元英进
- 关键词：代谢组学安全性评价食品药物
- 小波变换—模式识别挖掘代谢物组学信息的研究
- 如何从利用海量的波谱数据挖掘出重要的信息是代谢物组学研究需要解决的重大问题.本文以4种基因型的拟南芥样本为例,C010和C24是亲本基因型,Co10×C24和C24×Co10是两个杂交基因型.通过比较主成分分析、等级聚类...
- 吴晓建
- 关键词：代谢物组学小波变换模式识别神经网络
- 文献传递
