李伟
- 作品数：14 被引量：47H指数：5
- 供职机构：四川省疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项四川省卫生厅科研基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 一种狂犬病病毒检测的序列组合及捕获方法
- 本发明公开了一种狂犬病病毒检测的序列组合及捕获方法，涉及病毒检测领域，包括针对狂犬病病毒基因组全序列设计的91条叠瓦式PCR扩增引物，91条叠瓦式扩增引物序列依次为SEQ ID No.1‑91。本发明通过狂犬病病毒基因组...
- 冯玉亮李伟蒋明凤钟红荣潘明
- 四川省首起登革热本地传播疫情登革病毒全基因组特征及溯源分析被引量：1
- 2022年
- 目的对2019年四川省发生的首起本地传播登革热疫情中检出的登革病毒进行全基因组测序,分析病毒分子生物学特征并探讨其可能的来源。方法对实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测为阳性的本地病例标本提取核酸并扩增全基因组序列和测序,测序后进行同源性、系统进化分析和变异分析。结果通过基因扩增和序列测定获得1株病毒全基因组序列和2株包括E基因的全基因组部分序列,全基因组序列全长10706 bp,编码3393个氨基酸;同源性和系统进化分析显示,本次疫情流行株与2019年我国广州市分离株、2019年广州市分离的柬埔寨输入株、2019年云南省分离株、2017年越南分离株以及2016年新加坡分离株的同源性较高,系统进化属于同一分支;与登革1型原型株相比本次流行株散在分布有589个核苷酸变异和64个氨基酸突变,但影响毒力的主要氨基酸位点没有改变。结论2019年四川省首起登革热本地暴发疫情可能由柬埔寨输入病例引起,其病原体为登革1型病毒基因Ⅰ型;本次四川省流行株的毒力相关基因没有明显改变,但其在某些相关区域发生点突变的生物学意义有待进一步研究。
- 冯玉亮林世华潘明曹一鸥李伟
- 关键词：登革热登革病毒
- 四川省流行性乙型脑炎病毒优势基因型的研究被引量：6
- 2012年
- 目的了解四川省乙脑主要流行区乙脑病毒的分子生物学特性，为防治提供依据。方法对2007-2010年间分离到的13株乙脑病毒进行PreM和E基因区扩增，采用MEGA5生物学软件完成氨基酸序列和病毒进化树分析。结果基因分型显示13株均属于基因I型。13株病毒之间比较，PreM基因核苷酸和氨基酸同源性为97％-100％和98．7％-100％，E基因核苷酸和氨基酸同源性为97．8％～99．9％和99．6％～100％，其同源性极高。13株病毒与2004年四川分离株比较E基因核苷酸同源性在97．7％～99．6％之间，氨基酸同源性在98．6％-100％之间；PreM基因的核苷酸同源性在96．2％-99．1％之间，氨基酸同源性在97．5％-98．7％之间；与疫苗株P3和SA14—14—2比较E基因核苷酸和氨基酸同源性分别为87．6％～88．3％和97％～97．8％；PreM基因核苷酸和氨基酸同源性分别为84．1％～85．8％和93．7％-96．2％。13株病毒E基因的8个氨基酸毒力位点均没有发生改变。结论四川省乙脑病毒已呈现基因I型为优势型别的态势，其PreM和E区核苷酸和氨基酸高度保守，关键的氨基酸毒力位点没有变化，提示目前使用的疫苗对流行株的感染具有保护作用。
- 张佳珂林世华周兴余陈丹林付士红刘学成袁伟曹一鸥王环宇李伟胡梅梁国栋
- 关键词：脑炎病毒基因型种系发生
- 2004-2015年四川省登革热流行特征及防控建议被引量：9
- 2017年
- 目的了解四川省2004-2015年登革热流行特征,为登革热的防控提供科学依据。方法收集四川省2004-2015年登革热疫情资料,用描述性流行病学方法分析流行特征。结果 2004-2015年四川省登革热病例共计报告80例,全部为输入病例。主要集中在成都、南充、绵阳、德阳等市,4个地区发病数的构成比为67.50%。全年均有病例报告,6~10月为报告发病高峰(76.25%)。发病年龄主要集中在25~49岁(81.25%);男女性别比为4∶1;职业以工人、民工和农民3类职业的发病数排前3位(47.50%)。除2014年外病例均是从境外输入。45例病例在境内是处于病毒血症期(69.23%)。病例从入境到采样时间的中位数为6 d。总共有66例病例进行了实验室检测(82.50%)。结论目前四川省登革热防控策略仍然是监测为重点,控制蚊媒密度,提高诊治水平,强化疫情处置,加强部门合作,动员全社会参与。只有这样才能避免出现大规模的暴发或流行,减轻登革热的危害。
- 曹一鸥刘学成周兴余李伟张佳珂
- 关键词：登革热
- 四川省Nam Dinh病毒的首次分离鉴定被引量：1
- 2022年
- 目的对2015年从四川省西部的甘孜藏族自治州蚊虫中分离到的病毒株SC1502、SC1510进行鉴定并分析其基因特征。方法通过细胞培养的方法对蚊虫标本进行病毒分离,利用Nam Dinh病毒(Nam Dinh virus,NDiV)特异性引物进行逆转录聚合酶链反应(reverse transcription PCR,RT-PCR)鉴定,同时扩增分离株的开放阅读框、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerase,RdRp)、解旋酶超家族1(superfamily 1 helicase,HEL1)、刺突蛋白(spike protein,S蛋白)基因序列并测序,然后利用Mega Align软件对核苷酸序列和推测的氨基酸序列进行比对分析,利用Mega 7软件绘制系统进化树。结果SC1502、SC1510病毒株能够引起C6/36细胞发生病变,但不能引起BHK-21细胞的病变。同源性分析结果显示,2株四川新分离株与NDiV的RdRp、HEL1、S蛋白的核苷酸和氨基酸同源性最高,分别超过99.4%和97.5%。系统进化分析结果表明,2株四川新分离株与NDiV亲缘关系最近,处于同一进化分支。结论SC1502与SC1510为NDiV,该研究结果丰富了四川省的虫媒病毒病原谱数据库,对相关地区的不明原因疫情分析和调查提供了参考依据。
- 李伟张佳珂林世华周兴余冯玉亮
- 关键词：S基因系统进化树
- 四川省东南部地区蚊、蠓及相关虫媒病毒调查研究被引量：4
- 2018年
- 目的了解四川省的蚊、蠓以及相关虫媒病毒种类及分布。方法在自然界使用灯诱法采集吸血昆虫标本，形态学分类后分装，液氮保存备用。蚊虫、蠓虫研磨上清液接种BHK-21细胞和C6/36细胞进行病毒分离和病毒基因检测。使用BioEdit 7.0.5.3、MEGA 6.0等软件对病毒序列进行分子生物学特征分析。结果2016－2017年在四川省东南部3个县的7个自然村共采集到3属4种蚊虫17 019只，蠓虫12 700只。三带喙库蚊占蚊虫采集总数的79.4%（13 519/17 019），其次为骚扰阿蚊（11.1%，1 897/17 019），致倦库蚊占采集蚊虫标本总数的5.5%（930/17 019）；中华按蚊最少（4.0%，673/17 019）。蚊虫标本接种组织细胞后，在合江县采集的三带喙库蚊标本获得3株可以稳定传代的病毒分离株，经分子生物学实验鉴定为基因Ⅰ型流行性乙型脑炎（乙脑）病毒，在合江县采集的7批蚊虫中检测到乙脑病毒基因阳性。蠓虫标本接种细胞后未获得病毒分离物，在合江县采集的4批蠓虫标本经分子生物学检测，显示阿卡斑病毒基因阳性。结论三带喙库蚊是四川省东南部3县的优势蚊种，四川省东南部存在经蚊虫传播的乙脑病毒及以蠓虫为媒介的阿卡斑病毒。
- 宋颂付士红周兴余张佳珂李伟刘丽珺李劲松汪健林于李晓龙何英雷雯雯王环宇王斌鲁晓睛梁国栋
- 关键词：流行性乙型脑炎病毒
- 四川省2008-2018年流行性乙型脑炎流行特征及ARIMA模型应用被引量：14
- 2019年
- 目的描述四川省2008-2018年流行乙型脑炎(Japanese encephalitis,JE)流行病特征,分析其变化规律,并构建自回归移动平均(autoregressive integrated moving average,ARIMA)模型探讨该模型在预测JE发病趋势中的应用。方法采用描述流行病学分析2008-2018年四川省JE流行概况,利用2008年1月-2017年12月四川省JE分月监测资料拟合ARIMA模型,并应用2018年1-12月报告发病数进行模型检验。结果四川省2008-2018年JE疫情呈下降趋势,全省疫情主要集中于川东和川南,发病高峰为每年7-9月,儿童为高危人群,但近年来青少年及成人发病有上升趋势。ARIMA(1,0,0)(2,1,0)12能较好拟合JE发病时间序列趋势。结论构建ARIMA模型可用于四川省JE疫情报告发病数的短期预测。
- 刘丽珺刘宇周兴余张佳珂李伟漆琪
- 关键词：流行性乙型脑炎ARIMA模型
- 四川省2007-2014年急性弛缓性麻痹病例中埃可病毒6型的基因特征分析
- 2016年
- 目的 描述四川省急性弛缓性麻痹（acute flaccid paralysis,AFP）病例中埃可病毒6型（echovirus 6,E6）的基因特征.方法 对四川省2007-2014年AFP病例中分离到的11株E6进行全VP1区逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增和核酸序列测定,进行序列比对和构建进化树.结果 从2889份AFP病例的粪便标本中分离出11株E6病毒.经测序鉴定为C2基因亚型10株,C4基因亚型1株.来源病例的临床诊断分别为：肠道病毒感染6例,周围神经炎l例,格林巴利综合征2例,肌炎2例.C4亚型与10株C2亚型VP1区核酸序列同源性为83.9％-85.2％,氨基酸同源性为96.5％-97.2％;10株C2亚型VP1区核酸序列同源性为94.0％-100.0％,氨基酸同源性为98.9％-100％.结论 2007-2014年四川地区AFP病例中分离到的E6为C2和C4基因亚型,其中以C2基因亚型为主.
- 陈娜马小珍童文彬李伟余倩
- 关键词：急性迟缓性麻痹基因型进化分析
- 2011—2017年四川省狂犬病病毒N、G基因序列测定与分析
- 2019年
- 目的了解四川省2011—2017年间狂犬病病毒(rabies virus,RABV)株的分子特征以及流行株与疫苗株在核酸、氨基酸和蛋白修饰水平上的差异.方法对采集于2011—2017年间的23份RABV抗原阳性犬脑组织标本,通过RT-PCR以特异性引物扩增病毒核蛋白(nucleoprotein,N)基因和糖蛋白(glycoprotein,G)基因并测序,通过生物信息学软件分别对N基因和G基因进行基因特征分析.结果对23株RABV(简称四川株)N、G基因测序获得的全序列遗传进化关系分析表明,四川株均为rabies virus种,可分为3个进化分支且具有明显的地域特征,部分四川株与我国东部和北方流行毒株共循环.四川株间N基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.4%~100%和99.6%~100%,与参考株N基因的核苷酸和氨基酸同源性分别为72.1%~99.8%和81.6%~100%.四川株与疫苗株相比在抗原位点、细胞表位以及信号肽序列上有一定差异,但主要抗原性、组织嗜性和毒力没有改变.结论四川株间无明显差异,均为rabies virus种.四川株与疫苗株病毒糖蛋白的氨基酸序列存在不同程度的差异,但毒力未发生改变.
- 冯玉亮李伟林世华周兴余张佳珂
- 关键词：狂犬病病毒核蛋白糖蛋白进化分析
- 四川省首株盖塔病毒SC1210的鉴定被引量：6
- 2017年
- 目的 对四川省从蚊虫分离到的病毒SC1210进行鉴定并分析其基因组特征.方法 利用披膜病毒科甲病毒属特异性引物进行RT-PCR鉴定,并采用二代测序平台Ion Torrent PGM进行基因组全序列测定,然后利用Mega Align软件对测定的核苷酸和推测的氨基酸序列进行比较分析,利用Mega 6软件绘制系统发生树.结果 SC1210为盖塔病毒（Getah virus,GETV）,该株病毒基因组全长11 690nt,与国内外其他分离株的核苷酸同源性为99.2％-99.7％,氨基酸同源性为96.5％-99.4％.衣壳蛋白全长为804nt,编码268个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.9％-99.2％,氨基酸同源性97％-99.6％.E2基因全长1 266 nt,编码422个氨基酸,与其他株的核苷酸同源性为94.6％-99.6,氨基酸同源性为97.1％-99.5％.3＇UTR全长402 nt,具有GETV病毒独特的3个完整的重复序列元件和19 nt的保守序列.结论 四川省分离到的首株GETV SC1210与云南分离株YN0540亲缘关系较近,而与马来西亚原始株MM2021亲缘关系较远.
- 李伟潘明周兴余林世华刘学成付士红陈丹林曹一欧梁国栋张佳珂
- 关键词：盖塔病毒衣壳蛋白基因核苷酸序列
