王效睦
- 作品数：8 被引量：27H指数：4
- 供职机构：山东省农业科学院更多>>
- 发文基金：山东省自然科学基金山东省农业良种产业化开发项目山东省农业良种工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学经济管理生物学文化科学更多>>
- 山东省主要栽培苹果基因组重测序及SNP芯片位点挖掘
- 2021年
- 为促进苹果品种快速鉴定、种质资源评价及选择利用,本研究对山东省31个栽培苹果开展了重测序及SNP位点挖掘研究。样品DNA提取自叶片,并按照Illumina操作手册制备双端文库。经由Hiseq 4000平台对31个苹果基因组进行重测序,共产生了363 Gb的高质量序列,平均每样品12.5 Gb,这代表了苹果基因组大约15.9倍覆盖度。充分满足重测序分析及SNP位点挖掘的需要。错配率比较试验发现随着错配率逐渐升高,比对率逐渐升高至饱和。其中总比对率、成对数据比对率及单端数据比对率与错配率呈现显著相关(P<0.000 1),均符合一元四阶方程(回归系数R^(2)>0.99)。随着错配率提高,比对严谨度降低;基因组覆盖度逐渐升高,杂合位点准确度逐渐提高。采用两种算法所得到的位点,根据‘染色体+位点信息’作为特征值取交集,得到高可靠的单碱基SNP位点数据集:共检测到374 404个变异,平均每隔1 896个位点能够检测到一个变异,桑格验证试验准确度高达98.1%。SNP的功能注释分析结果显示在全部373 763个位点中有143 269个(38.27%)位于基因间区,25 047个(6.7%)位于基因编码区,179 426个(47.92%)位于基因上游-下游的2 kb区域。在所有编码区SNP里,有13 422个是非同义变异位点,11 625个是同义变异位点。两种SNP比率为1.15∶1。进一步利用过滤的4DTV位点,采用邻接算法构建的聚类分析结果符合山东省栽培苹果分类的趋势。
- 段乃彬马玉敏王昆王效睦谢坤白静杨永义蒲艳艳宫永超
- 关键词：栽培苹果基因组
- 开展实物信息服务 促进农业科研成果转化被引量：1
- 1997年
- 高春新赵文祥张颖王效睦黎香兰
- 关键词：信息服务农业科研成果大白菜杂交种信息产业化育种单位
- 山东省农业信息技术研究与“十五”发展设想被引量：5
- 2001年
- 朱建华万全亭王效睦
- 关键词：农业信息技术农业信息网络
- 我国设施农业生产可持续发展问题的探讨
- 设施农业是中国农业生存与发展的条件,目前我国设施农业的发展达到了一定水平,本文叙述了我国设施农业的现状,提出了设施农业生产的问题,分析了造成这种现状的原因,展望了我国设施农业的发展趋势及其应采取的对策。
- 黎香兰赵文祥王效睦孔庆富
- 关键词：设施农业可持续发展
- 文献传递
- 大蒜有性胚培养首次成功被引量：7
- 2004年
- 徐培文崔德才杨崇良曲士松刘冰江王效睦
- 关键词：癌细胞胃内大蒜胚培养生草蒜头
- 浅析网络时代图书馆馆员的素质
- 2001年
- 在我国随着信息高速公路的建设和INTERNET的开通 ,图书馆面临着前所未有的严峻挑战和重大冲击 ,图书馆馆员也又一次面临着知识、观念的更新和提高。馆员素质必须上一个新台阶 ,接受新知识 ,掌握新技术。本文叙述了网络时代图书馆将发生的根本性变化 ,提出了对馆员素质的要求。分析了我国图书馆馆员素质方面存在的问题 。
- 赵文祥黎香兰王效睦孔庆富
- 关键词：网络时代图书馆馆员
- 萝卜叶绿体及线粒体基因组测序与组装被引量：9
- 2015年
- 为从分子水平上探讨萝卜雄性不育机理及育性恢复关系,本研究对4个萝卜雄性不育系及1个雄性不育保持系材料进行了线粒体及叶绿体的基因组测序、组装。测序采用PE90策略,获得Cleandata 1.2 G。通过数据过滤、计算测序深度及Kmer频度分析,确定了组装的mer值及覆盖度参数。我们先用Cleandata组装叶绿体基因组,再用过滤的数据组装线粒体基因组,最后利用Sanger测序填补Gap得到各基因组全长。结果表明参试样品萝卜叶绿体基因组长度在153 352~153 445 bp之间,线粒体基因组长度在239 696~258 853 bp之间,均包括1个LSC,1个SSC及1对反向重复序列。基因注释结果表明叶绿体基因组编码了87个蛋白基因、20个t RNA基因及4个r RNA基因,线粒体基因组则编码了82个蛋白基因,17个t RNA基因及3个r RNA基因。
- 段乃彬王俊峰白静谢坤王效睦
- 关键词：萝卜线粒体叶绿体基因组
- 我国信息服务创新的现状及发展对策被引量：5
- 2001年
- 我国信息服务已发展到一定水平 ,新形势下信息服务需要提高和创新。本文概述了信息服务创新的意义、内容 ;分析了我国信息服务的现状及发展方向 ;
- 黎香兰赵文祥王效睦孔庆富
- 关键词：信息服务信息服务产业
