白静
- 作品数：6 被引量：9H指数：1
- 供职机构：山东省农业科学院更多>>
- 发文基金：山东省农业良种产业化开发项目山东省自然科学基金山东省农业良种工程项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 山东省主要栽培苹果基因组重测序及SNP芯片位点挖掘
- 2021年
- 为促进苹果品种快速鉴定、种质资源评价及选择利用,本研究对山东省31个栽培苹果开展了重测序及SNP位点挖掘研究。样品DNA提取自叶片,并按照Illumina操作手册制备双端文库。经由Hiseq 4000平台对31个苹果基因组进行重测序,共产生了363 Gb的高质量序列,平均每样品12.5 Gb,这代表了苹果基因组大约15.9倍覆盖度。充分满足重测序分析及SNP位点挖掘的需要。错配率比较试验发现随着错配率逐渐升高,比对率逐渐升高至饱和。其中总比对率、成对数据比对率及单端数据比对率与错配率呈现显著相关(P<0.000 1),均符合一元四阶方程(回归系数R^(2)>0.99)。随着错配率提高,比对严谨度降低;基因组覆盖度逐渐升高,杂合位点准确度逐渐提高。采用两种算法所得到的位点,根据‘染色体+位点信息’作为特征值取交集,得到高可靠的单碱基SNP位点数据集:共检测到374 404个变异,平均每隔1 896个位点能够检测到一个变异,桑格验证试验准确度高达98.1%。SNP的功能注释分析结果显示在全部373 763个位点中有143 269个(38.27%)位于基因间区,25 047个(6.7%)位于基因编码区,179 426个(47.92%)位于基因上游-下游的2 kb区域。在所有编码区SNP里,有13 422个是非同义变异位点,11 625个是同义变异位点。两种SNP比率为1.15∶1。进一步利用过滤的4DTV位点,采用邻接算法构建的聚类分析结果符合山东省栽培苹果分类的趋势。
- 段乃彬马玉敏王昆王效睦谢坤白静杨永义蒲艳艳宫永超
- 关键词：栽培苹果基因组
- 豌豆苗定量收割器
- 本发明公开了一种豌豆苗定量收割器，涉及豌豆苗收割技术领域，解决人工收割方式无法定量收割的问题。包括收割器底板和定量组件，所述收割器底板用于与栽种豌豆苗的种植盘上表面贴合，所述收割器底板的一端具有切割刀片，所述收割器底板的...
- 白静李润芳李冠谢坤马玉敏李娜娜
- 山东茄子地方品种果实性状及品质分析
- 2024年
- 对山东省第三次全国农作物种质资源普查与收集行动征集的24份茄子地方种质资源开展果实性状和品质性状综合评价,结果表明,各品种果实性状的变异系数在8.02%~57.67%,种质资源空间差异较大,其中果形的变异系数最大,为57.67%。通过主成分分析,前3个主成分的特征值均大于1,分别为2.1638、1.5641、1.0127,累计方差贡献率达79.01%,并建立品质评价模型:F=0.360637F1+0.260679F2+0.168784F3,能综合茄子数量性状的大部分信息。24份茄子种质资源经聚类分析分成三大类群,其中第Ⅲ类群包含品种1218、1219、P280,综合评分较高,位居前3,在茄子品种选育实践过程中,可将这类种质资源作为优良基础材料。
- 裴艳婷朱金英魏龙雪白静李文姣李娜娜
- 关键词：茄子果实性状主成分分析聚类分析
- 豌豆苗收割组件及使用方法
- 豌豆苗收割组件及使用方法，用于解决现有手持剪刀对豌豆苗进行收割时存在的，效率低下、豌豆苗排列不整齐的问题。包括配套使用的分拨切割装置和捆扎装置，分拨切割装置包括机架、分拨单元和切割单元，机架为“U”形结构，分拨单元包括第...
- 白静李冠谢坤李润芳杨永义
- 萝卜叶绿体及线粒体基因组测序与组装被引量：9
- 2015年
- 为从分子水平上探讨萝卜雄性不育机理及育性恢复关系,本研究对4个萝卜雄性不育系及1个雄性不育保持系材料进行了线粒体及叶绿体的基因组测序、组装。测序采用PE90策略,获得Cleandata 1.2 G。通过数据过滤、计算测序深度及Kmer频度分析,确定了组装的mer值及覆盖度参数。我们先用Cleandata组装叶绿体基因组,再用过滤的数据组装线粒体基因组,最后利用Sanger测序填补Gap得到各基因组全长。结果表明参试样品萝卜叶绿体基因组长度在153 352~153 445 bp之间,线粒体基因组长度在239 696~258 853 bp之间,均包括1个LSC,1个SSC及1对反向重复序列。基因注释结果表明叶绿体基因组编码了87个蛋白基因、20个t RNA基因及4个r RNA基因,线粒体基因组则编码了82个蛋白基因,17个t RNA基因及3个r RNA基因。
- 段乃彬王俊峰白静谢坤王效睦
- 关键词：萝卜线粒体叶绿体基因组
- 山东地方辣椒种质资源品质性状聚类分析
- 2024年
- 为充分了解山东地区辣椒种质资源的品质状况,对所收集的36份山东地方辣椒种质资源的品质性状进行了方差分析、变异系数分析和聚类分析。结果表明,不同辣椒种质资源材料间品质性状变异系数为14.37%~110.26%,辣椒素含量变异系数最大(110.26%);欧氏距离98.3处,可将36份辣椒种质资源聚为三大类群:第Ⅰ类群占5.56%;第Ⅱ类群占8.33%;第Ⅲ类群(TT)占比最大,高达86.11%。聚类分析表明,抗坏血酸和辣椒素在聚类间差异达极显著水平,聚类第Ⅰ类和第Ⅲ类,辣椒素变异系数均最大,第Ⅱ类粗蛋白变异系数最大。综上,第Ⅰ类群除鲜食、制酱外,可加工用作食品、化妆品、药品等产业中的重要添加剂;第Ⅱ类群经提取加工可用于医学药用和家禽畜牧饲用,可作为工业辣椒品种选育的优异材料;第Ⅲ类群利用度广泛,可普遍适用于鲜食、制酱、火锅和调料等食品加工产业等。
- 魏龙雪朱金英裴艳婷白静李娜娜
- 关键词：辣椒种质资源聚类品质性状
