冀天娇
- 作品数：41 被引量：252H指数：8
- 供职机构：中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 2017~2018年河北省重症手足口病的主要致病病原体为柯萨奇病毒A组6型被引量：8
- 2020年
- 肠道病毒是引起重症手足口病(Hand,foot,and mouth disease,HFMD)的主要病原体,近年来引起重症手足口病的病原谱正在发生变化,这为病原谱的检测带来了困难,而包括高通量测序(High-throughput sequencing,HTS)在内的新技术为明确重症手足口病的病原谱提供了帮助。为了明确河北省2017~2018年重症手足口病的病原谱,本研究采集2017~2018年河北省重症HFMD病例的50份标本(2017年29份,2018年21份)进行病毒分离,从23份标本中分离到病毒,采用一代测序方法获得其全长VP1区序列,而其余27份标本未能直接分离到病毒,其中17份采用高通量测序的方法获得了部分或者全长基因组序列。序列分析结果显示,近年来河北省重症HFMD的肠道病毒病原谱发生了较大变化,2017年重症HFMD标本中,10份检出肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71),1份检出柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,CV-A16),10份检出柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CV-A6)(其中高通量测序检出5份),还有3份检出其他肠道病毒;2018年重症HFMD标本中,1份检出CV-A16,7份CV-A6通过高通量测序检出,5份检出柯萨奇病毒A组10型(Coxsackievirus A10,CV-A10)(其中高通量测序检出3份),还有3份检出其他肠道病毒。通过高通量测序,可检出病原体的重症标本由原来的23份上升到40份,可检出CV-A6的标本由5份上升到17份,CV-A10由2份上升到5份;重症病例病原谱中CV-A6所占的比例由21.7%(5/23)上升到42.5%(17/40),CV-A10由8.7%(2/23)上升到12.5%(5/40),而EV-A71由于病毒分离比较敏感,含有EV-A71的标本病毒分离全部是阳性,高通量测序并没有多检出,在病原谱中的比例由43.5%(10/23)下降到25.0%(10/40)。RAxML构建的CV-A6和CV-A10的VP1区的系统发育树显示,CV-A6属于中国流行的优势基因亚型D3a,CV-A10属于中国流行的优势基因型C。河北重症HFMD标本检测到的两株CV-A6与其余中国CV-A6序列的3D区的核苷酸相似度为76.4%~98.9%,氨�
- 肖金波于秋丽张勇张勇宋洋路环环韩振志刘莹莹刘莹莹冀天娇严冬梅祝双利许文波
- 关键词：病原谱
- 2016—2017年宁夏手足口病的病原构成及流行的EV-A71和CV-A16基因特征分析被引量：6
- 2019年
- 目的了解引起2016—2017年宁夏自治区(宁夏)手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)的病原构成,分析主要病原体肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)和柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)的基因特征。方法分析2016—2017年宁夏HFMD的核酸检测结果,确定HFMD的病原构成;对2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的肠道病毒毒株利用RT-PCR方法扩增VP1编码区并进行基因序列测定,BLAST分析确定毒株的血清型别,同时选取EV-A71和CV-A16分离株分别构建系统进化树。结果核酸检测结果显示,2016和2017年宁夏HFMD中阳性检出率最高的病原体分别为其他肠道病毒(enterovirus,EV)(397,43.72%)和EV-A71(918,56.18%),且不同月份检测出的优势病原体有差异。2017和2016年相比HFMD的病原构成由其他EV和CV-A16为主转变成EV-A71和其他EV为主。2016—2017年宁夏上送至国家HFMD网络监测实验室的EV-A71均属于C4基因亚型的C4a进化分支,CV-A16均属于B1基因亚型的B1b进化分支。结论宁夏HFMD的病原构成中,2017年EV-A71、CV-A16和其他EV的构成与2016年相比发生了动态变化,持续开展宁夏HFMD的病原构成中EV-A71的动态变化,对指导EV-A71疫苗的使用策略、集中优势医疗资源加强救治重症病例,降低重症HFMD的病死率具有重要意义。
- 李婕马江涛刘俐张勇冀天娇许文波严冬梅武桂珍
- 关键词：手足口病公共卫生分子流行病学
- 一种人肠道病毒C组血清型鉴定引物、检测试剂盒和应用
- 本发明提供了一种人肠道病毒C组血清型鉴定引物、检测试剂盒和应用，属于涉及生物技术领域。一种人肠道病毒C组血清型鉴定引物，包括核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示的正向引物EVCY17和核苷酸序列如SEQ ID NO:2...
- 严冬梅张勇孙强杨倩冀天娇宋洋肖金波
- 海南省2014-2017年手足口病病原构成及柯萨奇病毒A组6型基因特征分析被引量：23
- 2019年
- 目的 分析海南省2014-2017年手足口病(HFMD)流行特征及病原谱构成,阐明海南省流行的柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)基因特征。方法 采用描述性流行病学方法分析手足口病流行特征及病原构成变化,利用Sequencher、Bioedit和MEGA软件,结合GenBank数据库中1949-2017年CV-A6序列和本研究的海南省CV-A6毒株序列,构建亲缘性进化树揭示其基因特征。结果 病原监测结果显示:2014-2017年,海南省HFMD实验室诊断2 520例HFMD病例,其中肠道病毒A组71型(EV-A71)895例(35.52%)、柯萨奇病毒A组16型(CV-A16)463例(18.37%)和其他肠道病毒(EV)1 162例(46.11%)。但不同年份和不同月份的优势病原呈现动态变化,除2014年EV-A71为优势病原(占56.00%)外,其余年份均以其他EV为主,各年占比分别为59.04%、33.69%、67.72%;不同病例类型病原构成有明显差异,轻症病例优势病原除2014年为EV-A71 (58.84%)外,其余年份均为其他EV (分别占59.77%、44.66%和78.81%);重症病例中2014和2016年EV-A71为优势病原(分别占85.92%、48.72%),2015和2017年其他EV为优势病原(分别占51.87%、100.00%);死亡病例病原全部为EV-A71。2014-2016年送检标本中未检出CV-A6,故仅分析2017年CV-A6的基因特征:2017年84株肠道病毒阳性标本,经血清型鉴定CV-A640例(占47.62%),提示CV-A6为海南省2017年HFMD中的主要优势病原;海南省CV-A6序列均属于国内流行的D3a进化分支,并与我国其他省份CV-A6毒株共同进化。结论 本研究揭示了2014-2017年海南省HFMD病原谱构成及流行的CV-A6基因型和基因亚型,为海南省HFMD防控策略制定以及是否研制多价手足口病疫苗提供了科学数据。应继续加强海南省HFMD病原谱动态监测。
- 韩桃利李丹丹冀天娇郭悦马焱潘正帆宋洋陈海云许文波
- 关键词：手足口病基因特征基因型
- 柯萨奇病毒A组9型的基因分型方法的建立被引量：1
- 2022年
- 血清型别鉴定及基因分型分析是开展肠道病毒(Enterovirus,EV)分子进化特征研究的重要内容。目前为止,国内外对柯萨奇病毒A组9型(Coxsackievirus A9,CVA9)的研究主要集中在衣壳蛋白区的细胞受体结合位点及其基因特性分析,而基于全长VP1序列的基因型划分结果尚未明确。本研究依托国家手足口病监测网络,对2010-2019年全国31个省级行政区(省、自治区、直辖市)上送的18 238份手足口病样本中分离出的24株CVA9进行全长VP1区序列测定,并与GenBank中所有全长VP1区序列一起进行基因型划分研究。测序结果显示24株CVA9分离株VP1全长为906bp,编码302个氨基酸,与CVA9原型株(Griggs)核苷酸和氨基酸相似性分别为80.5%~97.6%和92.3%~99.6%。结合系统进化树和同一血清型内不同基因型的核苷酸差异界值为15%~25%,将全球CVA9划分为A-H八个基因型。进化树显示B、C和D基因型在病毒进化过程中已消失,而E、F和G基因型呈现共循环的趋势,其中G基因型包含了亚洲、北美洲、大洋洲和欧洲等9个国家的毒株,是CVA9的优势基因型。大部分中国株属于G基因型,与世界流行趋势一致。但在2018年新疆一例手足口病患儿体内分离到的CVA9毒株却与俄罗斯有很近的亲缘关系,被划分为F基因型,推测该毒株为俄罗斯输入株。CVA9虽具有明显的地理聚性,但G基因型中包含的多国家和多时间段的毒株也提示CVA9病毒可能存在远距离的传播和流行。
- 赵鹤鹤冀天娇杨倩肖金波祝双利王东艳王建醒陈建华路环环韩振志张勇张勇许文波
- 关键词：基因分型分子进化
- 基于长短时记忆神经网络的手足口病发病趋势预测被引量：8
- 2021年
- 针对传统手足口病(HFMD)发病趋势预测算法预测精度不高、未结合其他影响因素、预测时间较短等问题,提出结合气象因素使用长短时记忆(LSTM)网络进行长期预测的方法。首先,将发病序列通过滑动窗口的方式转化为网络的输入和输出;然后采用LSTM网络进行数据建模和预测,并使用迭代预测的方式获得较长期的预测结果;最后在网络中增加温度和湿度变量,比较这些变量对预测结果的影响。实验结果表明,加入气象因素能够提高模型的预测精度,所提模型在济南市数据集上的平均绝对误差(MAE)为74.9,在广州市数据集上的MAE为427.7,相较于常用的季节性差分自回归移动平均(SARIMA)模型和支持向量回归(SVR)模型,该模型的预测准确率更高。可见所提模型是HFMD发病趋势预测的一种有效的实验方法。
- 马停停冀天娇杨冠羽陈阳许文波刘宏图
- 关键词：手足口病时间序列传染病预测
- 2017-2018重庆市手足口病病原谱及主要病原体基因特征分析
- 2023年
- 目的分析2017—2018年重庆地区手足口病病原谱及其主要病原体的基因特征。方法选择重庆市儿童医院作为研究对象,收集并整理该院区2017—2018年1071例诊断为手足口病患者的核酸检测信息,其中810份已明确了肠道病毒血清型,剩余175份血清型待鉴定,另有86份肠道病毒为阴性。通过病毒分离、核酸浓缩及基因测序等方法对上述261份样本进行鉴定,获得该地区手足口病完整的病原谱。使用MEGA 7.0软件构建四种主要病原体的系统进化树,进行基因特征的研究。结果通过改良的鉴定方法,261份标本中,除3份被鉴定为人副肠孤病毒(Human parechovirus,HPeV)外,其余258份样本均为肠道病毒阳性。其中CVA6(coxsackievirus A6)血清型占比最多,其次为EV-A71(enterovirus A71)另有CVA16(coxsackievirus A16)和CVA10(coxsackievirus A10)以及其他肠道病毒共计13种血清型。系统进化结果显示,重庆市CVA6血清型均为D3a基因亚型,EV-A71、CVA10和CVA16的优势基因亚型分别为C4a,C2b和B1b,这四种优势基因型与全国其他地区的基因型共同循环进化。结论本研究通过优化鉴定方法,提高了肠道病毒的检出率,进一步明确了重庆地区手足口病病原谱构成,CVA6是该地区2017—2018年手足口病的主要病原体,其次是EV-A71,同时这两种血清型也是导致重庆地区重症手足口病主要的病原体。
- 王雯慧王江峡许红梅张勇孙强何云郭琴王晓艺路环环肖金波赵鹤鹤韩振志严冬梅许文波冀天娇张乐
- 关键词：手足口病病原谱VP1基因
- 新型冠状病毒Omicron BA.4/5变异株RBD-Fc蛋白的表达及其免疫效果的评价被引量：1
- 2023年
- 本研究针对新冠病毒Omicron BA.4/5的受体结合域(Receptor binding domain, RBD)构建一个连接Fc受体的二聚体蛋白BA.4/5-RBD-Fc(BRF)并评价其免疫原性。结果显示,两种佐剂组小鼠的二免后血清均可产生高滴度的IgG抗体且显著高于一免后血清(P<0.0001),BRF+AlOH/CpG组小鼠血清产生较为平衡的IgG1和IgG2a抗体应答,而BRF+BFA03组小鼠血清能产生更多的偏向Th2应答的IgG1抗体,且IgG1/IgG2a比值显著高于BRF+AlOH/CpG组(P<0.0001)。BRF+AlOH/CpG组产生的Th1应答的细胞因子干扰素γ(Interferon-γ,IFN-γ)高于BRF+BFA03组(P<0.01),而产生的Th2应答细胞因子白介素4(Interleukin-4,IL-4)IL-4显著低于BRF+BFA03组(P<0.01)。BRF蛋白结合不同佐剂两次免疫小鼠后的血清均可以有效中和目前Omicron主要的流行亚型BA.2与BA.4活病毒,产生高达19 334 598和17 224 096的中和抗体滴度。因此,BRF蛋白诱导小鼠血清产生的中和抗体针对Omicron系列变异株具有一定的广谱性,AlOH/CpG佐剂可以使BRF蛋白产生偏向Th1的免疫应答反应,而BFA03佐剂产生明显偏向Th2的免疫应答反应。本研究为新冠Omicron变异株亚单位疫苗的研发提供有效的科学依据。
- 时雨晴李海宋洋任虎祝双利冀天娇胡宏俏曹蕾赵建楠郭宏黄星湖江洁张燕李栋许文波
- 关键词：新型冠状病毒FC受体免疫效果
- 2012～2016年新疆柯萨奇病毒A6的分子流行病学特征分析被引量：4
- 2018年
- 分析新疆手足口病相关的柯萨奇病毒A6(Coxsackievirus A6,CV-A6)毒株VP1区基因特征。2012～2016年从新疆手足口病病例标本中分离到75株CV-A6,对75株CV-A6采用RT-PCR方法扩增VP1区基因片段并进行核苷酸序列测定,应用MEGA5.05和BioEdit7.1.9软件进行核苷酸序列比对分析,构建系统进化树。75株新疆CV-A6毒株VP1区核苷酸序列同源性为86.9%～100%,与原型株(Gdula)同源性为81.4%～82.5%;71株D3亚型株与D3代表株之间核苷酸序列同源性为93.1%～99.6%;4株D2亚型株与D2代表株之间核苷酸序列同源性为92.6%～96.5%。进化树图分析显示,新疆CV-A6毒株均属于D基因型,其中绝大多数(71/75)处于D3分支,属于D3亚型,2012～2016年具有分布;少数(4/75)处于D2分支,属于D2亚型,只分离于2013～2014年。新疆CV-A6在系统进化树上形成多个不同的小分支,不同年份不同地区的CV-A6毒株分别与国内一些地区的毒株有着较近的亲缘关系,说明新疆CV-A6毒株的传播链和基因型分布与内地CV-A6相同,与内地的CV-A6共进化的。加强手足口病的病原学监测及相关病原的分子特征研究对手足口病的防控至关重要。
- 邓红冀天娇黄永迪韩桃利张璇宋欣欣赵俊阿依古丽·伊尔哈力王凤英岳锡宏
- 疫苗接种人群和安慰剂人群肠道病毒A71型基因特征分析被引量：1
- 2016年
- 目的 分析比较健康人群接种肠道病毒A71型（Enterovirus A71,EV-A71）灭活疫苗和安慰剂后EV-A71感染的基因特征。方法 按照1∶1配对的病例对照研究,统计比较接种组和安慰剂组人群中EV-A71导致相关疾病流行病学差异;利用Sequencher 5.0和MEG5.0等生物信息学软件分析不同组别的EV-A71的VP1区核苷酸和氨基酸差异,获得不同人群中EV-A71的分子流行病学特征。结果 本研究共有接种组病例13例（0.3%）,安慰剂组106例（2.1%）;EV-A71相关疾病发生呈现夏季和冬季两个高峰,主高峰集中在夏季（4~7月）,次高峰集中在冬季（11~12月）,以安慰剂组人群为主。所有EV-A71毒株与中国2007年以来其他省代表毒株相同,属于C4a亚型;各序列同源性较高,其核苷酸同源性为95.16%~100%,氨基酸同源性为96.94%~100%,与周边省市近3年序列亲缘关系较相近。结论 本研究安慰剂组人群中EV-A71除夏季流行外,在冬季仍有少量EV-A71的循环传播;EV-A71仍为C4a亚型且同源性较高,与周边省市的C4a亚型序列存在共同进化关系。
- 冀天娇胡雅灵祝双利檀晓娟张宝敏郑鹏王二强孔凡胜陈江婷宋俐霏许文波
- 关键词：安慰剂基因型
