张峰
- 作品数：32 被引量：138H指数：8
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金解放军总医院科技创新苗圃基金解放军总医院科技创新基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学环境科学与工程更多>>
- 重型再生障碍性贫血发病相关T淋巴细胞基因表达谱的生物信息学分析及作为药物筛选新方法的探索
- 本研究初步探索重型再生障碍性贫血(sevre aplapstic anemia SAA)发病相关的T林巴细胞基因表达谱特征、并根据药物与疾病基因表达谱相似性对比的原理，探索SAA治疗药物新的筛选方法.以SAA和T淋巴细胞...
- 卢学春迟小华杨波朱宏丽刘丽宏张峰严江伟
- 关键词：重型再生障碍性贫血T淋巴细胞羟喜树碱盐酸二甲双胍
- 运用全基因组表达谱分析筛选肺腺癌不同TNM分期相关基因的研究
- 2013年
- 目的比较不同TNM分期肺腺癌样本的基因表达谱，筛选中国人肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因。方法采用病例一病例研究。选取第三军医大学西南医院2008年5月至2011年10月经手术切除治疗的240例肺腺癌患者。其中90份患者标本（TNMⅠ期、Ⅱ期、ⅢA期各30例）用于芯片杂交，其余150份患者标本（TNMⅠ期、Ⅱ期、ⅢA期各50例）用于后续验证研究。应用商品化的博奥晶芯@35KOligo基因芯片比较90例不同TNM分期肺腺癌的基因表达谱，筛选与肺腺癌TNM分期相关的差异表达基因。从中挑选Zimp7、GINS2及NAG-1共3个差异表达基因，应用实时荧光定量RT—PCR方法进一步验证它们在肺腺癌组织标本中的表达情况。受检基因在各期中表达水平的比较采用方差分析。结果肺腺癌组织中共筛选到592个显著差异表达基因；其中264个肺腺癌相关高表达基因和328个低表达基因。在这592个基因中，进一步筛选不同TNM分期（Ⅰ期、Ⅱ期、ⅢA期）样本间的差异表达基因，共获得10个显著差异表达基因。实时荧光定量RT—PCR方法验证结果与芯片结果基本一致。结论本研究共筛选到10个中国人肺腺癌TNM分期相关作用基因，预期将为揭示肺腺癌发生发展的内在作用机制，寻找肺腺癌诊断、治疗、预后判断的新靶点提供思路，
- 张晓莉刘铭潘虹张峰张永彪张阳夏涵府伟灵
- 关键词：腺癌肿瘤分期基因表达谱寡核苷酸序列分析
- 30例老年非霍奇金淋巴瘤的临床病理学特征、疗效及预后分析被引量：15
- 2013年
- 本研究探讨老年非霍奇金淋巴瘤(non-Hodgkin's lymphoma,NHL)的临床病理学特征、疗效和预后相关因素。对2003年1月-2012年12月中国人民解放军总医院老年血液科收治的30例老年NHL患者的临床资料进行回顾性分析,包括患者的一般临床特征、病理特点、化疗方案选择及临床反应,并运用Kaplan-Meier曲线进行生存分析,应用COX回归模型对相关预后因素(包括年龄、IPI评分、B组症状、Ann-Arbor分期和LDH水平)进行多变量分析。结果表明,30例患者中位年龄82.5岁;所有患者均有合并症,其中以心血管系统疾病(包括高血压、冠心病、心律失常等)最常见,少数(8/30)合并第二肿瘤;出现B组症状的占63%(19/30);病理分型中仅2例为T细胞淋巴瘤,其余为B细胞淋巴瘤,其中弥漫大B细胞淋巴瘤占所有B细胞淋巴瘤的57%(17/28);Ann-Arbor分期Ⅰ-Ⅱ期占37%(11/30),Ⅲ-Ⅳ期占63%(19/30);IPI评分2分以下10例,3分4例,4-5分16例,3-5分的患者占67%(20/30);初诊时有43%(13/30)患者的LDH高于正常。全组病例均采用改良R-CHOP为基础的个体化方案化疗,4个疗程后CR 14例,PR 13例,PD 2例,SD 1例,治疗总反应率为90%;全组病例1年、2年总生存率分别为73.3%、43.3%;半年、1年无进展生存率分别为62.2%、54.9%;COX回归多变量分析显示,B组症状和Ann-Arbor分期是影响老年NHL生存的独立预后因素(P=0.014、0.039;RR=6.678、4.939)。结论:老年NHL患者症状不典型,初诊时分期较晚,合并基础疾病多,由于个体差异大,应根据不同预后采取个体化治疗;以脂质体阿霉素为基础的CHOP方案对心脏的毒性低,对老年NHL可能是一种安全有效的方案;老年NHL患者无B组症状和Ann-Arbor分期≤Ⅱ期是老年NHL患者预后良好的指标。
- 汪海涛杨波蔡力力冉海红张文英朱宏丽杨洋李素霞范辉迟小华于睿莉张峰李宝玲林洁翟冰姚善谦卢学春
- 关键词：非霍奇金淋巴瘤临床病理学预后老年患者
- 含胸腺肽免疫增强的自体CIK细胞联合IL-2方案治疗高龄弥漫大B细胞淋巴瘤被引量：13
- 2012年
- 目的评价含胸腺肽免疫增强的自体CIK细胞联合IL-2(TCIL-2)方案治疗高龄弥漫大B细胞淋巴瘤的有效性和安全性。方法采集预先接受胸腺五肽免疫增强治疗的4例高龄弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者外周血单个核细胞,在体外经干扰素-γ(IFN-γ)、白介素-2(IL-2)、抗CD3单克隆抗体诱导成CIK细胞,回输细胞数为2×109-3×109个,回输后应用IL-2 100mU/d,皮下注射,连续10d。28d为1个周期,共完成24个周期的自体CIK细胞输注。观察治疗前后细胞免疫功能、肿瘤相关生物学指标变化。结果 2例接受8个周期的CIK细胞输注,2例接受4个周期的输注,回输后所有患者未出现不良反应。CIK细胞治疗后CD3+、CD3+CD8+、CD3+CD56+细胞比例明显升高(P<0.05),β2微球蛋白水平显著下降(P<0.05)。3例达完全缓解,1例完成8周期的CIK细胞输注后一度达良好的部分缓解,但最终因急性心肌梗死和淋巴瘤持续进展而死亡。结论自体CIK细胞联合IL-2治疗高龄弥漫大B细胞淋巴瘤安全有效。
- 杨洋杨波脱帅卢学春朱宏丽脱朝伟蔡力力迟小华于睿莉陈云燕张文英刘洋王瑶代汉仁韩为东张峰姚善谦
- 关键词：胸腺肽淋巴瘤弥漫大B细胞
- 自体CIK细胞联合IL-2治疗难治性脾非霍奇金淋巴瘤1例被引量：8
- 2012年
- 目的观察自体细胞因子诱导的杀伤细胞输注联合IL-2治疗老年淋巴瘤的有效性和安全性。方法 1例老年脾脏恶性淋巴瘤患者在经过手术切除脾脏原发肿瘤、8个疗程的R-CHOP方案免疫化疗后出现淋巴瘤肝脏转移,此时采集患者外周血单核细胞,在体外经干扰素-γ(IFN-γ)、白介素-2(IL-2)和抗CD3单克隆抗体诱导成CIK细胞,每次回输细胞数为2-3×109个,回输后应用IL-2 100mU/d,皮下注射,连续10d,28d为1个周期。观察治疗前后患者肝功能、肿瘤相关生物学指标及影像学变化。结果患者共完成8个周期的CIK细胞输注,每次回输后未出现不良反应,肝功能指标、LDH水平均降至正常,PET/CT检查示治疗后肝脏淋巴瘤转移灶消失,达到完全缓解。结论自体CIK细胞输注联合IL-2疗法对于清除治疗后淋巴瘤的微小残留灶和(或)转移灶安全有效。
- 杨洋杨波脱帅卢学春朱宏丽脱朝伟蔡力力迟小华于睿莉陈云燕张文英刘洋王瑶代汉仁韩为东张峰姚善谦
- 关键词：脾脏淋巴瘤老年人
- 重型再生障碍性贫血发病相关T淋巴细胞基因表达谱的生物信息学分析及作为药物筛选新方法的探索被引量：13
- 2010年
- 本研究初步探索重型再生障碍性贫血(severe aplastic anemia,SAA)发病相关的T淋巴细胞基因表达谱特征,并根据药物与疾病基因表达谱相似性对比的原理,探索SAA治疗药物新的筛选方法。以SAA和T淋巴细胞为关键词,在人类基因表达数据库和基因芯片数据库中检索与SAA发病相关的基因表达数据库,并对此基因表达数据库进行显著性检验后筛选与SAA发病相关的基因表达谱,并进行聚类分析。然后,在3 000种药物基因表达谱数据库中筛选与SAA发病相关基因表达谱特征相反者。结果表明,在上述数据库中检索到1个满足条件的相关基因表达数据库GSE3807。与SAA发病相关的T淋巴细胞基因一共有515个(表达水平变化超过2倍),其中上调者202个,下调者313个。聚类分析发现,这些基因分别属于核酸代谢、泛素依赖的蛋白降解通路、免疫球蛋白/主要组织相容性复合体、高尔基体蛋白运输以及蛋白质磷酸化等通路。SAA发病相关基因与药物基因表达谱相似性分析发现,羟基喜树碱、盐酸二甲双胍可能具有治疗SAA的作用。结论:采用生物信息学方法,比较疾病发病相关基因表达谱与药物基因表达谱的相似性,有可能成为SAA治疗药物筛选的新方法。
- 卢学春迟小华杨波朱宏丽刘丽宏张峰严江伟
- 关键词：重型再生障碍性贫血T淋巴细胞羟喜树碱盐酸二甲双胍
- 人ID4基因表达调控启动子及其亚克隆荧光素酶报道重组子的构建被引量：2
- 2010年
- 本研究旨在克隆ID4基因启动子及上游调控序列,并构建一系列启动子亚克隆-pGL3Basic荧光素酶报道重组子,以探讨ID4基因表达调控机制。方法与结果:以ID4基因cDNA全长作为探针,在NCBI的人类基因组数据库中搜索并下载ID4基因转录起始位点上游5′侧翼区约2242bp及下游5′非翻译区212bp的基因组序列;利用TESS和Genomax等在线启动子分析软件进行启动子及上游调控元件的特征分析,据此设计PCR引物,采用分段扩增法,获得了2条长度分别为1 829bp和784bp的产物片段,分别插入pGEM-T载体,转化至TOP10感受态大肠杆菌,筛选阳性菌落;继之先后应用KpnI/NheI、KpnI/EcoRI对获得的2个pGEMT重组载体及pGL3Basic荧光素酶报道重组载体进行双酶切,用T4DNA连接酶连接,转化至TOP10感受态大肠杆菌,筛选阳性菌落,成功构建了人ID4基因启动子-pGL3Basic荧光素酶报道重组子;经KpnI/NheI双酶切和测序鉴定,获得了与GenBank相应序列一致、长度为2 459bp的目的片段;以此片段为模板,相隔400bp左右设计了5对3′端平齐、5′端不同的PCR引物,进行半巢式PCR扩增,获得5条长度分别为2 112bp、1 703bp、1 290bp、784bp和496bp片段,回收纯化后分别插入pGEM-T载体,转化至TOP10感受态大肠杆菌,筛选阳性菌落;继之用KpnI/NheI对获得的5个pGEMT重组载体及pGL3Basic荧光素酶报道载体双酶切,T4DNA连接酶连接,转化至TOP10感受态大肠杆菌,筛选阳性菌落,经KpnI/NheI双酶切和测序鉴定。结论:成功克隆了长度为2.5kb的ID4基因启动子及上游表达调控序列,构建了一系列ID4启动子亚克隆-pGL3-Basic荧光素酶报道重组子。
- 李薇黄玉杨波迟小华刘丽宏张峰严江伟卢学春
- 关键词：ID4基因启动子聚合酶链式反应
- 1例X连锁型视网膜色素变性家系的分子遗传学研究被引量：2
- 2008年
- 目的对1例来自云南省的X连锁型视网膜色素变性家系进行相关分子遗传学研究。方法在本研究小组前期工作中对该家系已初步确定的X连锁型遗传位点——RP2和RF3处选取具有高信息量的9个微卫星位标进行精细单倍型分析。在定位的候选基因RF3基因即RPGR基因上，使用构象敏感凝胶电泳（conformation sensitive gelelectro-phoresis，CSGE）的方法对其1～14号外显子进行突变筛选的同时对已有报道的突变热点区——外显子ORF15进行直接测序以寻找致病突变。结果通过精细定位扫描及相关单倍型分析，将该例家系的致病基因定位在RF3位点。RPGR基因1～14号外显子经CSGE的方法进行突变筛选，未发现有异常电泳条带；通过直接对突变热点区外显子ORF15的测序，在该例家系中检测到1个在国内外均有报道的热点突变：g．ORF15＋483_484delGA。结论g．ORF15＋483_84delGA移码突变导致了该家系产生X连锁型视网膜色素变性。
- 朱静张晓莉府伟灵赵红霞张峰贾若愚李新
- 关键词：视网膜色素变性微卫星DNA单倍型
- 家族性发作性运动诱发性运动障碍家系的遗传早现现象研究被引量：2
- 2009年
- 目的探讨家族性发作性运动诱发性运动障碍(PKD)的遗传早现现象。方法将本研究采集的家系及通过文献检索到资源完整的家系分为中国单纯型PKD组、中国复杂型PKD组、国外单纯型PKD组及国外复杂型PKD组,分别对4组PKD家系进行临床分析和发病年龄的配对t检验和Wilcoxon符号秩和统计学分析。结果临床表型上,中国单纯型PKD家系均存在发病年龄逐代提前和(或)严重程度加重的现象,国内外其他PKD家系在临床上未发现明显的遗传早现。统计学上,中国单纯型PKD家系代与代之间的平均年龄差为5.2岁,有显著的统计学差异(配对t检验和Wilcoxon符号秩检验P<0.0001);而复杂型PKD组和国外单纯型PKD组父-子代发病年龄并无显著差异(P>0.01)。结论家族性PKD可分为单纯型和复杂型两种类型,与种族和遗传背景有关。中国单纯型PKD家系存在遗传早现现象,而伴发其他疾病的复杂型PKD在临床和统计学上均未发现遗传早现。
- 刘鼎李国良陈婵娟张峰章蓓严江伟肖波
- 地西他滨联合自体CIK细胞治疗2例高龄急性髓系白血病的疗效观察被引量：14
- 2013年
- 本研究旨在观察低甲基化药物地西他滨联合自体细胞因子诱导的杀伤细胞(CIK)治疗老年急性髓系白血病(AML)的安全性及有效性。本科于2006-2012年收治2例80岁以上老年AML患者(M4型和M6型),均继发于骨髓增生异常综合征。对这2例患者先后采取单用自体CIK细胞输注、地西他滨或(和)自体CIK细胞方案治疗,系统观察了2例CIK治疗前后淋巴细胞亚群、临床相关指标(血液学反应、输血频率、白血病相关基因表达、缓解情况、生活质量)及生存期的变化。结果表明,与单用自体CIK细胞输注和单用地西他滨治疗相比,地西他滨联合自体CIK细胞治疗方案可减轻骨髓抑制程度,降低输血频率及输血量,延长部分缓解持续时间,同时表达的白血病相关基因减少,生存期显著延长,患者生活质量得到明显改善。结论:地西他滨联合自体CIK细胞治疗老年AML患者安全有效。
- 常城杨波张琳朱宏丽卢学春郭搏蔡力力韩为东王瑶范辉李素霞刘洋杨洋翟冰冉海红林洁张峰
- 关键词：急性髓系白血病地西他滨老年人
