张武
- 作品数：150 被引量：341H指数：10
- 供职机构：上海大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金国家教育部博士点基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术理学医药卫生建筑科学更多>>
- Navier-Stokes方程的混合刚度有限元方法
- 张武
- 图形聚类算法的代谢网络模块化分析被引量：7
- 2006年
- 代谢网络的研究是当今生物学研究中的新热点,使用图形聚类算法对代谢网络进行分析研究是一个有力的手段.文中提出了用图形聚类方法挖掘复杂代谢网络中蕴含的功能信息并进行模块相似性分析的方法,从系统生物学角度揭示光合作用的进化.介绍了马尔可夫聚类算法和模拟退火聚类算法两种图形聚类方法;给出了两种方法对叶绿体和蓝细菌的代谢网络进行聚类的结果;定义了模块相似度评价指标,挖掘叶绿体和蓝细菌间保守的功能模块,并对其网络结构进行了比较分析.
- 侯静宋安平王卓张武李园园李亦学
- 关键词：代谢网络
- 蛋白质相互作用预测算法在帕金森病中的应用被引量：1
- 2008年
- 对蛋白质相互作用的研究不仅能够理解生命的过程,也能为疾病治疗提供线索。通过对现有蛋白质相互作用预测计算方法的分析,将计算方法和生命科学相结合,在利用现有的知名生物数据库获得大量蛋白质相互作用关系数据的基础上,建立人类蛋白质相互作用网络,通过计算来预测可能导致帕金森病的蛋白质。在总结前人算法的基础上,利用改进的APM[1]算法,实现了对蛋白质一级网络以及二级网络的预测工作。
- 吴继宗宋安平张武李辉
- 关键词：帕金森病致病蛋白计算方法蛋白质相互作用网络
- 流面上Navier－Stokes方程和惯性形式
- 1996年
- 本文推导场流面上Ｎａｖｉｅｒ－Ｓｔｏｋｅｓ方程，并且证明存在惯性形式．
- 李开泰张武
- 关键词：N-S方程流面
- 应用LBM方法对列车空气动力制动的数值研究被引量：1
- 2010年
- 本文应用LBM(Lattice Boltzmann Method)数值计算方法对列车空气动力制动在不同速度下风翼提供的制动力和在相同列车速度下风翼的形状选择、位置安装以及不同安装数量等情况进行了研究、计算和分析。计算结果为工程设计人员提供了有力的参考依据。
- 武频王洋方攸同晏子峰张武
- 关键词：列车空气动力制动
- 自适应SW-ADI方法解反应扩散方程的并行实现
- 2004年
- 根据解反应扩散方程的自适应样条小波-交替方向(SW-ADI)方法,使用MPI、OpenMP两种并行编程模式,对串行程序进行了直接并行化,并在上海大学的高性能计算机自强2000上分别用MPI和OpenMP实现了对方程的求解。对运算结果进行了分析并给出了与串行程序相比较的并行加速比。
- 程海英张武
- 关键词：串行程序并行编程自适应SW反应扩散方程样条小波
- 基于MRT-LBM方法的大规模可扩展并行计算研究被引量：3
- 2016年
- 在大规模三维复杂流动的数值模拟中,针对具有良好数值稳定性的多弛豫时间模型格子Boltzmann方法(MRT-LBM),并结合大涡模拟湍流模型和曲面边界插值格式,分析了在D3Q19离散速度模型下的网格生成、流场信息初始化和迭代计算3部分的可并行性.采用MPI编程模型,从分布式集群的特点和计算量负载均衡的角度出发,分别提出了适合于大规模分布式集群的网格生成、流场信息初始化和迭代计算的并行算法.该并行算法也能有效适用于D3Q15和D3Q27离散速度模型.通过在国产神威蓝光超级计算机上的测试,分别针对求解问题总体计算规模固定和保持每个计算核中计算量一致的2种情况的并行性能分析,验证了该并行算法在十万计算核的量级下仍具有良好的加速比和可扩展性.
- 刘智翔方勇宋安平徐磊王晓伟周丽萍张武
- 关键词：可扩展负载均衡BOLTZMANN大涡模拟
- 基于最大熵模型与投票法的汉语动词与动词搭配识别被引量：5
- 2007年
- 提出一种基于最大熵模型和投票法的汉语动词与动词搭配识别方法.该方法通过组合目标动词与候选搭配词的上下文词性信息以及关联程度的统计信息构成5种复合特征模板,然后利用最大熵方法获得它们对应搭配识别器,最后采用最好搭配识别器占优的投票法构造组合识别器.实验结果表明,同时包含上下文词性信息和统计信息的识别器优于单纯包含上下文词性信息或统计信息的识别器,但最好搭配识别器占优的组合识别器效果更佳.
- 王素格杨军玲张武
- 关键词：搭配最大熵模型特征函数投票法
- 对于网格计算工具包NetSolve的分析与研究被引量：4
- 2005年
- 系统地研究了高性能计算的网格应用中间件NetSolve 系统的结构和工作原理,并对服务器端进行了深入探讨,指出了现有实现存在的缺陷,对改进方案进行了分析。
- 程海英张武沈云付代文超
- 关键词：工具包网格计算网格应用服务器端中间件E系统
- 单基因扰动实验的自适应灰关联聚类算法
- 2009年
- 为克服单基因扰动实验必须遍历所有实验基因所导致的周期长和成本高的缺点,提出了一个自适应参数的灰关联聚类算法,每次基因扰动实验后通过自适应参数灰关联聚类算法选择下一个实验基因,从而省略不必要的基因扰动实验,得到满意的基因扰动顺序并建立基因调控网络。实验结果表明,该算法能有效地甄别对构建基因调控网络基本没有影响的基因,算法结果令人满意。
- 李辉宋安平张律文赵志康张武
- 关键词：自适应参数基因基因调控网络
