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鳜脂蛋白脂酶基因SNP及其与食性驯化相关性分析被引量：5: 2011年; 鳜食性奇特,通常情况下拒食死饵或配合饲料,在长期的养殖过程中发现:通过驯养,能逐步诱导部分鳜以非活饵为食。通过分子标记定向选育易驯化鳜并使用人工饲料大规模养殖,可以有效解决鳜养殖中存在的成本高、污染严重、病害严重等问题。脂蛋白脂酶基因(Lipoprotein lipase LPL)是脂蛋白代谢的关键酶之一,生理功能是将乳糜微粒和极低密度脂蛋白核心的甘油三酯催化分解为甘油和脂肪酸,以供组织氧化供能和贮存。文章采用PCR产物直接测序法对鳜脂蛋白脂酶基因6、7内含子和6、7、8外显子进行了SNPs遗传多态性检测和分析,探寻LPL基因的等位基因及其基因型在两个食性驯化表型群体中的分布情况。结果在第7外显子处共检测到3个SNPs位点(A25T、G26T和C29G),其中A25T、C29G两个为非同义突变。利用卡方检验分析驯化与未驯化组,结果表明LPL基因3个SNPs位点对鳜的食性驯化不具显著差异性(P>0.05)。将3个SNPs位点不同基因型组合成5种双倍型,卡方检验表明双倍型Dip2在两组中存在显著差异(P<0.05)。文章成功完成鳜LPL基因组部分区段多态性分析,因而可以考虑将LPL基因作为影响鳜食性驯化的候选基因,作为遗传标记,为今后的标记辅助选择育种工作奠定基础,具有广泛的应用前景。; 杨宇晖梁旭方方荣彭敏燕黄志东; 关键词：脂蛋白脂酶单核苷酸多态性食性驯化

鳜TRY、AMY基因遗传多态性研究及其与食性驯化的相关分析: 本研究在鳜转录组测序的基础上，采用PCR产物直接测序法（DS）对鳜淀粉酶（AMY）基因和胰蛋白酶（TRY）基因的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms，SNP）以及鳜淀粉酶（AMY...; 方荣; 关键词：胰蛋白酶食性驯化单核苷酸多态; 文献传递

翘嘴鳜淀粉酶基因SNPs和微卫星位点多态性的检测被引量：2: 2013年; 本研究主要检测翘嘴鳜淀粉酶(amylase,AMY)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)和微卫星位点多态性.实验采用PCR产物直接测序法(PCR-direct sequencing,PCR-DS)检测翘嘴鳜AMY基因组序列的SNPs和微卫星位点,并使用创造限制酶切位点PCR法(created restriction sites PCR,CRS-PCR)和PCR-DS法对SNPs进行分型,应用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测AMY基因微卫星位点的多态性.实验结果发现AMY基因第1内含子有一个SNP位点A1,第5内含子有3个SNPs位点(A2、A3和A4);此外,第5内含子中还存在一个微卫星位点B1,共检测到4个等位基因,有9种单倍型.在翘嘴鳜群体中,4个SNP位点呈中度遗传多样性,而微卫星位点表现出高度遗传多样性.; 彭敏燕梁旭方方荣于海静朱滔; 关键词：淀粉酶翘嘴鳜单核苷酸多态性微卫星

鳜胰蛋白酶基因外显子3上SNP G169A位点鉴定和四种不同检测方法的比较被引量：1: 2011年; 采用PCR产物直接测序法(DS)对鳜(Siniperca chuatsi)胰蛋白酶基因(TRY)进行单核苷酸多态性(SNPs)分析,发现外显子3上的G169A多态性。对312个样品进行分析,共发现三种基因型GG、GA、AA,其基因型频率分别为0.26、0.54、0.20,两个等位基因G和A的基因频率分别为0.53和0.47。用创造限制性酶切位点法PCR(CRS-PCR)、单管双向等位基因专一性扩增(SB-ASA)和单链构象多态性分析(PCR-SSCP)对该SNP位点进行验证。结果表明,CRS-PCR法不能对该SNP位点分型,PCR-SSCP和SB-ASA法可以且准确度分别为100%和96.67%。; 于海静梁旭方方荣彭敏燕朱滔; 关键词：单核苷酸多态性直接测序法单链构象多态性分析

鳜胃蛋白酶基因外显子7上SNP检测及其与食性驯化相关分析被引量：6: 2011年; 本研究旨在探寻胃蛋白酶(pepsinogen,PEP)基因的等位基因及其基因型在不同食性驯化表型鳜(Siniperca chuatsi)群体中的分布情况。通过2周食性驯化,挑选出最易驯化和最不易驯化的2组,提取各组鳜鳍条组织DNA,采用PCR产物直接测序法(direct sequencing,DS)、限制性片段长度多态性技术(restriction fragment length poly-morphism,RFLP)和创造限制酶切位点PCR法(created restriction site PCR,CRS-PCR)对鳜胃蛋白酶基因5、6、7、8内含子和6、7、8外显子进行SNPs遗传多态性检测和分析。结果共检测到2个SNPs位点(C1T和C52 T),均为同义突变,利用卡方检验分析,结果表明PEP基因的这2个SNPs位点分别与鳜的食性驯化不具显著相关性(P>0.05)。将2个SNPs位点的不同基因型组合成5种双倍型,卡方检验表明双倍型Dip1与Dip5在两组中存在显著差异(P<0.05)。本研究成功完成鳜PEP基因组多态性分析,因而可以考虑将PEP基因作为影响鳜食性驯化的候选基因。; 方荣梁旭方杨宇晖杜嵇华曹亮叶卫符云; 关键词：胃蛋白酶 SNP 食性驯化

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方荣

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