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李永香

作品数：4 被引量：7H指数：2
供职机构：内蒙古大学物理科学与技术学院物理学系更多>>
发文基金：内蒙古自治区自然科学基金国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 4篇生物学

主题

  • 4篇密码子
  • 3篇基因
  • 3篇基因组
  • 2篇同义密码子
  • 2篇基因表达
  • 2篇杆菌
  • 2篇大肠杆菌
  • 1篇生物基因
  • 1篇生物基因组
  • 1篇偏好
  • 1篇酵母
  • 1篇酵母基因
  • 1篇酵母基因组
  • 1篇基因表达水平
  • 1篇氨基酸
  • 1篇大肠杆菌基因
  • 1篇大肠杆菌基因...

机构

  • 4篇内蒙古大学

作者

  • 4篇李永香
  • 2篇王芳平

传媒

  • 2篇内蒙古大学学...
  • 1篇内蒙古工业大...

年份

  • 3篇2006
  • 1篇2005
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
大肠杆菌同义密码子重复序列中密码子的使用被引量：3
2006年
以大肠杆菌基因组为样本,研究同义密码子重复序列与ORF全序列中各密码子相对使用频率的差异,分析同义密码子重复序列中密码子重复的偏好.结果表明部分密码子的使用与ORF全序列中的使用不同,并非所有密码子的使用与基因表达水平正相关;同义密码子重复序列中密码子重复具有偏好性,部分密码子重复在四联体中有位置偏好.同义密码子重复的最大长度与所编码的氨基酸亲疏水性质、简并度及构成密码子的碱基性质有关.
李永香李宏王芳平
关键词：大肠杆菌基因组偏好
不同基因组中同义密码子重复序列的分析与比较
2006年
以闪烁古生球菌、枯草杆菌、大肠杆菌、酵母、线虫和拟南芥基因组中所有ORF序列为样本,对编码序列中同义密码子重复序列和对应氨基酸重复序列的有关性质进行了分析.结果显示同义密码子重复序列中密码子的使用与全部编码序列的密码子使用有明显的差别,部分密码子的使用随着重复长度的增加,偏置增大.相同密码子2联体在同义密码子4和5联体中的位置明显偏好两端.同时给出了各密码子的联体能力,讨论了联体能力的大小与密码子碱基构成的关系.对于氨基酸重复序列,氨基酸重复片段数的对数随重复长度分布呈对数下降.重复序列中氨基酸的含量与全序列氨基酸的含量有显著差别,有些氨基酸随着重复长度的增加其含量偏置增大.亲水、小体积和非极性氨基酸容易形成长的联体,疏水、极性和大体积氨基酸形成的最大联体长度较短.最后,对6种模式生物进行了比较,讨论了上述结果与生物进化的关系.
李永香李宏
关键词：氨基酸同义密码子
大肠杆菌与酵母基因组中密码对使用的比较被引量：4
2006年
研究了大肠杆菌和酿酒酵母两类生物全基因组的密码对,通过密码对的观察值与期望值的比较,发现密码对的使用有很强的偏好性;此外,按照Boycheva定义的标准(ΔREG)研究了密码对的使用与基因表达水平的关系,发现酵母与大肠杆菌两类生物的密码对使用与基因表达水平的关系是相似的;高表达基因偏好ΔREG为正值的密码对,而低表达基因偏好ΔREG为负值的密码对.通过曲线的相似性分析,可以推测,真核生物(S accharomy ces cerev isiae)与原核生物(E scherich ia coli)在密码对的使用上,其机理是相似的.
王芳平李宏李永香
关键词：密码子基因组基因表达水平
同义密码子重复序列中密码子的使用与比较
本论文共分三部分: 第一部分通过对大肠杆菌编码序列中同义密码子重复序列的研究,分析了同义密码子重复序列与全部编码序列中密码子使用的差异:发现部分密码子在同义密码子重复序列中的使用与在全序列中的使用存在很大的差异...
李永香
关键词：同义密码子生物基因组基因表达
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