王玲 作品数:39 被引量:132 H指数:6 供职机构: 医学部 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家教育部博士点基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 文化科学 生物学 更多>>
猪戊型肝炎病毒株swGX32全基因组序列分析 被引量:3 2008年 目的分析从广西地区分离的1株猪戊型肝炎病毒swGX32全基因组序列并比较其与其他分离株的差异。方法设计PCR引物,用巢式反转录聚合酶链反应法(RT—nPCR)分段扩增戊型肝炎病毒(HEV)株swGX32全基因序列,用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列,对扩增产物进行克隆和测序,并对拼接后的基因组进行序列和进化分析。结果除3’polyA尾巴外,swGX32全长7240nt,ORF1与ORF2重叠4nt,ORF3包含在ORF2序列中。swGX32全基因序列与HEV1—4型核苷酸序列的同源性分别为:73%-74%、73%、74%-75%,83%-94%,其中与中国人源HEV株JKO—ChiSai98C同源性最高,达94%。全基因序列进化分析显示,swGX32位于HEV基因4型分枝上,ORF2部分核苷酸序列进化分析显示,swGX32与JKO—ChiSai98C同在HEV4a亚型分枝上。结论猪HEV swGX32在全基因组结构及分子进化上均与人HEV JKO—ChiSai98C有密切关系,为揭示戊型肝炎是一种人兽共患病提供了分子生物学依据。 吉彦莉 李凌君 韦献飞 王玲 常义斌 唐荣兰 朱永红 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 基因型 人畜共患病 新疆猪戊型肝炎病毒株CHN-XJ-SW33全基因组序列分析 被引量:1 2010年 目的测定从新疆南部地区分离的猪戊型肝炎病毒(HEV)株全基因组序列,并在此基础上分析猪HEV与人源HEV的关系。方法设计HEV基因4型通用PCR引物,用逆转录巢式聚合酶链反应法(RT-nPCR)分段扩增猪HEV株CHN-XJ-SW33的全基因组序列;用cDNA末端快速扩增法(RACE)扩增其末端序列;对扩增的目的片段进行克隆测序,并对拼接后的基因组进行序列比对和进化分析。结果除3′poly(A)尾外,CHN-XJ-SW33基因组全长为7 238 nt,由3个开放读码框(ORF1-3)组成,分别编码1 706、674和114个氨基酸。CHN-XJ-SW33全基因组序列与HEV基因1-3型病毒株同源性仅为72.1%~74.9%,而与HEV基因4型病毒株同源性高达82.8%~95.5%,其中与日本人源中国输入型HEV株JKO-ChiSai98C同源性最高,为95.5%。基因进化分析显示,CHN-XJ-SW33属于HEV4a基因亚型。结论猪HEV与人HEV在全基因组核苷酸序列上高度同源,提示基因4型HEV可能由猪传染给人。 付红伟 杜刚 朱永红 李凌君 王玲 耿家宝 薛城 王晓娟 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 全基因组序列 丙型肝炎病毒实验感染动物模型研究进展 被引量:1 2013年 丙型肝炎(丙肝)病毒(HCV)是单股正链RNA病毒,球形有包膜,属于黄病毒科肝炎病毒属。HCV基因组全长9.6×10^3bp,依次由5’端非编码区(NCR)、1个开放读码框(ORF)和3’端NCR组成。HCV基因组能编码1个多聚蛋白前体,该蛋白前体在宿主细胞和病毒的蛋白酶裂解下,产生至少10种蛋白质, 夏俊珂 王玲 庄辉关键词:丙型肝炎病毒 动物模型 疫苗 受体 与戊型肝炎病毒感染相关的神经系统疾病研究进展 被引量:3 2012年 戊型肝炎病毒(HEV)感染是目前在发展中国家和发达国家引起急性肝炎的主要病原之一。根据核苷酸序列同源性分析,目前公认的HEV基因型有4个,分别为1、2、3和4型。此外,有人认为禽HEV为5型,鼠HEV为6型,但尚未得到公认。 韩建 王玲 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 神经系统疾病 吉兰-巴雷综合征 急性横贯性脊髓炎 189例急性病毒性肝炎患者的血清学调查 被引量:2 2011年 目的研究我国部分地区189例急性病毒性肝炎患者5种病毒性肝炎的分型构成。方法用酶免疫法(EIA)检测2007-2008年吉林(59例)、河北(54例)、山东(28例)、江苏(28例)、新疆(20例)等地急性病毒性肝炎门诊及住院的189例患者抗-HAV IgM、抗-HBc IgM、抗-HCV IgM、抗-HDV IgM和抗-HEV IgM。结果 189例急性病毒性肝炎患者甲型肝炎(HA)7例(3.70%),乙型肝炎(HB)65例(34.39%),丙型肝炎(HC)17例(8.99%),戊型肝炎(HE)71例(37.57%),未分型肝炎11例(5.82%),重叠感染18例(9.53%)。重叠感染以HBV/HEV常见。甲、乙、丙、戊及未分型肝炎患者的平均发病年龄分别为39.43、36.42、45.23、50.24及32.91岁。各型肝炎男女性发病比为1.83∶1-6.00∶1。结论在本研究群体中HBV和HEV是急性散发性病毒性肝炎最主要的病原体。各型急性病毒性肝炎男女性发病性别比均为男性多于女性,平均发病年龄与以往相比有后移现象,其中HE最为明显,集中在中老年人群。 王晓娟 王玲 卜秋宁 刘鹏 耿家宝 付红伟 朱永红关键词:急性病毒性肝炎 肝炎病毒 血清学 戊型肝炎病毒兔分离株相关研究进展 被引量:1 2014年 戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)是引起急性病毒性肝炎的病原体之一。HEV主要经粪-口途经传播,也有经输血传播的报道[1]。在发展中国家多因水源被HEV污染而发生戊型肝炎大规模流行,在发达国家主要是因摄入未煮熟的污染食物引起散发病例[2]。通常HEV感染后引起急性自限性肝炎,但是免疫功能低下的患者,合并HEV感染后可发生慢性化,甚至发展成肝硬化[3-5],孕妇感染HEV后病死率可高达20%[6]。最近还有报道,HEV感染后可引起一些严重的神[7-8] 刘琳 王玲 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 戊型肝炎病毒基因型与致病性研究进展 被引量:1 2016年 戊型肝炎病毒(hepatitis E Virus,HEV)为直径27~34nm、球型且无包膜的单股正链RNA病毒[1]。HEV基因组全长约7.2×103 bp,包含3个开放读码框(open reading frame,ORF 1~3),分别编码不同的蛋白,在病毒入侵、组装与释放等过程中起重要作用[2]。HEV主要经粪-口途径传播,也有报道经血液或母婴垂直传播[3-5]。核酸序列分析表明,HEV至少可分为4个基因型,基因1型和2型只感染人,基因3型和4型为人畜共患病原体,既能感染人,也能感染猪、 郭瑞廷 曾航 王玲关键词:戊型肝炎病毒 人畜共患 基因型 实时荧光定量PCR对兔戊型肝炎病毒(HEV)的检测及评估 被引量:4 2015年 目的兔戊型肝炎病毒(HEV)是近年来新发现的,根据其分子生物学特征可能成为HEV的新基因型。为提高对兔HEV的检出率,本研究设计了针对兔HEV RNA的特异性引物和TaqMan探针并对其进行考评。方法 1)从GenBank中下载14条兔HEV全长序列,分别在其ORF1、ORF3片段的保守区域设计一条TaqMan探针和一对上、下游特异性引物,其中ORF1片段的探针及引物为C组,ORF3片段的为B组;A组的探针及引物为Jothikumar N等所报道的通用引物;2)制备相应的质粒标准品来构建定量标准曲线,并利用上述3套引物、探针对49份兔粪便及44份兔血液样品进行检测,将B、C组检测结果与A组的检测结果进行比较。结果新建立了两套兔HEV定量PCR的TaqMan探针及引物(B、C组),其标准曲线的斜率分别为-3.455和-3.469;使用上述3套引物及探针(A、B、C组)对49份粪便标本进行荧光定量PCR检测,其HEV RNA阳性率分别为67.35%(33/49)、67.35%(33/49)、57.14%(28/49),平均HEV RNA(log copies/g)拷贝数为6.18、5.90、6.11;44份血液标本的HEV RNA阳性检出率分别为65.90%(29/44)、56.82%(25/44)、50.00%(22/44),平均HEV RNA(log copies/mL)拷贝数为3.62、3.43、3.03;结果显示以上3组探针及引物均可用于粪便和血液标本的定量检测。结论兔HEV虽然有其独特的基因结构,但使用HEV通用引物检测不影响检出率。 曾航 张玉林 王麟 刘鹏 王玲关键词:TAQMAN探针 引物 实时荧光定量PCR 沙门菌细聚合菌毛作为新型载体表达外源基因片段 被引量:4 2006年 目的用减毒Salmonella typhimurium ST14028-3b菌株的细聚合菌毛(thin aggregative fim- briae)构建表达HIV-1 2F5抗原表位的载体。方法通过两步重叠PCR法(two step overlap extension PCR)构建重组体agfA::2F5,将重组体克隆至具有分离缺陷的温度敏感性低拷贝质粒pHSG415中,构成重组质粒pHSGAgfA2F5,然后经电穿孔法转化入ST14028-3b菌株中,经温度和抗生素选择压力进行等位基因置换,通过PCR筛选出含有外源基因的突变株,测序验证其序列的正确性。最后,用Western blot法检测菌毛蛋白的表达,黏附试验来证明含有外源基因的菌株Bu96的黏附能力。结果序列分析表明基因置换后的突变株在菌毛基因上含有外源基因2F5,且不含有质粒pHSG415的复制子序列。Western blot结果显示菌毛蛋白表达,黏附试验表明了菌株Bu96的黏附能力。结论利用具有分离缺陷的温度敏感性低拷贝质粒pHSG415,在ST14028-3b的细聚合菌毛编码基因agfA上插入表达2F5或其他外源基因的方法可行。本方法的最大优点在于不需要使用专门的菌株或抗生素抗性标记重组基因来进行位点特异性基因置换,同时也避免了在染色体上非目的DNA的出现。 部小霞 Aaron White 王玲 刘树林关键词:基因置换 沙门菌 实验感染戊型肝炎病毒动物模型的研究进展 被引量:1 2010年 根据国内外文献报道,多种动物(马、猪、牛、羊、鼠等)体内抗戊型肝炎病毒(HEV)抗体阳性,提示HEV是人兽共患病。为进一步探明HEV的动物宿主、传播方式及致病机制,本文对实验感染HEV动物模型的研究进展进行了综述。 耿家宝 王玲 朱永红 庄辉关键词:戊型肝炎病毒 动物模型 人兽共患病