黄丽林 作品数:11 被引量:42 H指数:3 供职机构: 广东省妇幼保健院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 广东省医学科学技术研究基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
白念珠菌Mdr1基因生物信息学分析 2017年 目的:探讨白念珠菌多重耐药基因(Mdr1)DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Mdr1基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:Mdr1 DNA中无内含子,Mdr1 mRNA中含有多个调控元件和腺苷酸化位点、AU富集区,对二级结构分析显示,Mdr1 mRNA全长序列可形成棒状结构。蛋白质的理化性质分析显示MDR1蛋白稳定系数为37.14,提示MDR1蛋白较为稳定。Target P 1.1和Signal P 4.1预测结果显示MDR1蛋白不含有线粒体定位序列和分泌信号肽。SWISS-MODEL 3D建模,MDR1蛋白质的3D结构类似于通道管状形态。Motif Scan分析结果显示,MDR1蛋白第116-557个氨基酸构成主要协同转运蛋白超家族,TMHMM预测在此范围内含有12个跨膜区间,为跨膜蛋白。结论:Mdr1基因的表达可能受其它基因的调控,MDR1蛋白为主要协同转运蛋白超家族成员,其功能域或为潜在的药物靶点。 何泰龙 高文超 孙瑶 黄家敏 黄丽林 张静 张云青 李美荣 尹颂超 黄怀球关键词:白念珠菌 MDR1基因 生物信息学 非侵袭性真菌性鼻窦炎的实验室诊断及致病菌分析 被引量:7 2017年 目的探讨非侵袭性真菌性鼻窦炎的实验室诊断方法,分析其致病菌,为鼻窦炎合并真菌感染的临床诊断、治疗提供依据。方法对我院临床及鼻内镜下所诊断的10例真菌性鼻窦炎患者,鼻内镜手术时直接吸取病变的鼻窦黏膜及窦腔内容物,通过直接镜检、真菌培养、传统鉴定及分子生物学鉴定和组织病理学检查对其进行检查。结果 10例病例中,直接镜检阳性者8例;病理学检查可见真菌菌丝或者孢子者8例;接种培养及基因鉴定阳性者5例(感染菌株包括2例烟曲霉复合体、1例杂色曲霉、1例枝孢样枝孢霉、1例帚霉)。不同方法检测出的阳性病例并非完全重叠。结论真菌镜检、真菌培养、真菌分子生物学鉴定、组织病理学检查在诊断真菌感染时可以互补,有助于明确诊断及发现新菌株。 李美荣 郑瑞 尹颂超 张云青 黄丽林 何泰龙 薛汝增 袁立燕 孙瑶 梅碧琪 杨钦泰 黄怀球关键词:真菌 鼻窦炎 菌种鉴定 申克孢子丝菌TPS基因生物信息学分析 被引量:1 2018年 目的:分析和预测申克孢子丝菌海藻糖磷酸合成酶(TPS)基因及其编码蛋白的生物信息学特征及功能。方法:利用生物信息学软件和网站分析预测申克孢子丝菌TPS基因及其编码蛋白的结构和功能特征。结果:申克孢子丝菌TPS基因全长为2 864 bp,编码905个氨基酸。Target P和MotifScan预测该蛋白定位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点,其中磷酸化位点尤为丰富,包含cAMP依赖性磷酸激酶、蛋白激酶C(PKC)和酪氨酸激酶(CK2)磷酸化位点。TPS蛋白是亲水性蛋白,无跨膜结构,未发现信号肽。结论:预测申克孢子丝菌TPS基因编码蛋白位于胞浆中,具有糖基转移酶、海藻糖磷酸酶两大功能域及丰富的修饰位点的结构功能特点,可行相应小分子抑制剂筛选以开发新型抗真菌药物。 黄家敏 李玉哲 高文超 吴晓雁 孙瑶 黄丽林 张静 李美荣 胡南 旷翠娥 刘佳庆 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 生物信息学 白念珠菌Hog1基因DNA、mRNA、蛋白的生物信息学分析 2016年 目的:探讨白念珠菌Hogl基因DNA、mRNA、蛋白的潜在生物学性质。方法:采用生物信息学方法对白念珠菌Hogl基因DNA、mRNA、蛋白序列进行分析。结果:白念珠菌Hogl基因启动子可能位于其基因编码区起始位点前654~704bp,转录起始位点为编码区起始位点前663bp,Hogl基因并无内含子。Hogl基因mRNA中未发现核糖体结合位点等功能性RNA序列,RNA二级结构分析显示,HoglmRNA形成稳定的回文结构。蛋白质的理化性质分析显示,Hogl蛋白稳定系数为35.67。TargetP1.1和SignalP4.1预测结果显示,Hogl基因不存在线粒体定位序列、分泌信号肽及跨膜区域。Motif分析显示Hogl具有MAPK活性,其活性位点可能为第189—181个氨基酸(TRY)。Hogl蛋白序列在各物种间呈渐进式进化、较为保守,尤其在MAPK功能域附近。结论:白念珠菌Hogl基因的DNA和mRNA序列无常见功能域,可能主通过其蛋白质发挥作用。Hogl蛋白是MAPK家族成员,其MAPK活性位点(第189—181个氨基酸TRY)或为潜在的药物靶点。 梅碧琪 张静 乐秀 高文超 黄丽林 何泰龙 孙瑶 陈垦 黄怀球关键词:白念珠菌 生物信息 申克孢子丝菌SPDS基因的生物信息学分析及分子克隆 被引量:1 2013年 [目的]分析预测申克孢子丝菌cDNA中编号为Locus_ 168_Contig_1序列编码的基因及蛋白质结构、功能特征,并进行分子克隆.[方法]利用NCBI及Expasy网站提供的BLASTx、SignalIP、InterPro Scan等生物信息学软件分析其序列,判断其是否为全长编码序列、同源序列名称,并分析其结构、定位及功能等;将其中的全长编码区利用PCR方法进行扩增后克隆到pET-30a(+)载体,测序验证.[结果]该序列是亚精胺合成酶(SPDS)的同源基因,全长序列为1062 bp,包含完整的编码区190 ~1 062 bp,编码291个氨基酸,在GenBank中,其与粗糙脉孢菌的SPDS基因同源性最高,达88%.理化性质预测其编码蛋白疏水性高;无质体、线粒体等定位序列,不存在跨膜螺旋结构,为非分泌型蛋白.进化树分析结果显示与粗糙脉孢菌同源性最高;PCR扩增及测序结果证实目的基因成功克隆进入pET-30a(+)质粒.[结论]获得申克孢子丝菌SPDS的基因及蛋白结构、功能特点,构建了其重组表达质粒,将为进一步明确其在孢子丝菌病中的致病作用奠定理论基础. 袁立燕 黄怀球 张静 冯佩英 高文超 李玉哲 张晓辉 黄丽林关键词:申克孢子丝菌 生物信息学 分子克隆 支气管肺泡灌洗液YKL-40与肺炎支原体肺炎患儿气道损害的相关性 被引量:16 2019年 目的探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)YKL-40与肺炎支原体肺炎(MPP)患儿气道损害之间的相关性。方法选取60例MPP患儿为MPP组,12例支气管异物患儿作为对照组。根据影像学表现将MPP组分为3个亚组:斑片状影(n=34)、肺实变(n=19)、毛玻璃样变(n=7);根据支气管镜下表现分为3个亚组:黏膜充血水肿(n=38)、黏液性分泌物(n=18)、塑型性支气管炎(n=4)。分析MPP患儿的临床表现、实验室检查特点,检测MPP患儿BALF的YKL-40表达水平。结果 MPP组血清乳酸脱氢酶、BALF YKL-40水平高于对照组(P<0.05)。肺实变亚组血清C-反应蛋白及乳酸脱氢酶水平高于斑片状影亚组(P<0.05),肺实变亚组和毛玻璃样变亚组BALF YKL-40高于斑片状影亚组(P<0.05);塑型性支气管炎亚组BALF YKL-40均高于黏膜充血水肿亚组、黏液性分泌物亚组(P<0.05);黏液性分泌物亚组、塑型性支气管炎亚组气促比例高于黏膜充血水肿亚组(P<0.05);塑型性支气管炎亚组血清C-反应蛋白、乳酸脱氢酶水平高于黏膜充血水肿亚组(P<0.05)。结论 BALF YKL-40与MPP患儿气道损害相关,且与疾病严重程度有关。 黄丽林 李容汉 黎静 陈华佳 彭淑梅关键词:肺炎支原体肺炎 YKL-40 支气管肺泡灌洗液 Toll样受体2和4在抗孢子丝菌早期免疫阶段小鼠皮肤中的表达 被引量:1 2015年 目的探讨小鼠皮肤Toll样受体(TLR)2和TLR4在抗孢子丝菌早期免疫阶段的表达。方法实时荧光定量PCR检测BALB/c小鼠皮肤早期免疫阶段的TLR2和TLR4mRNA表达水平,同时通过免疫组化检测两者蛋白表达水平。结果孢子丝菌分生孢子接种小鼠皮肤后,TLR2mRNA转录水平在6h后逐渐升高至对照组的18.8倍,24h达高峰,为对照组的34倍;TLR4mRNA转录水平在6h内达高峰,为对照组的56.7倍,此后逐渐下降。免疫组化结果显示,孢子丝菌处理组小鼠皮肤角质形成细胞及巨噬细胞均可表达TLR2和TLR4蛋白,对照组不表达。血清中白细胞介素12及肿瘤坏死因子α在实验组和对照组的表达差异无统计学意义。结论TLR2和TLR4参与了小鼠皮肤角质形成细胞和巨噬细胞对孢子丝菌的识别,有助于免疫防御作用。 张静 黄丽林 张晓辉 钟毅 何泰龙 袁立燕 黄怀球关键词:TOLL样受体2 TOLL样受体4 支气管肺泡灌洗液中几丁质酶样蛋白YKL-40对儿童难治性肺炎支原体肺炎的预测价值 被引量:14 2021年 目的探讨支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid,BALF)中几丁质酶样蛋白YKL-40对儿童难治性肺炎支原体肺炎(refractory Mycoplasma pneumoniae pneumonia,RMPP)的预测价值。方法50例普通型肺炎支原体肺炎(Mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)和22例RMPP患儿纳入研究。比较两组患儿的临床特征、实验室检查结果、影像学表现及BALF中YKL-40水平的差异;采用受试者工作特征曲线分析BALF YKL-40对RMPP的预测价值。结果RMPP组发热、气促、肺实变及胸腔积液的发生率明显高于普通型MPP组(P<0.05),血清C-反应蛋白和乳酸脱氢酶水平明显高于普通型MPP组(P<0.05)。RMPP组BALF YKL-40水平明显高于普通型MPP组(P<0.05)。以BALF YKL-40水平绘制受试者工作特征曲线,其曲线下面积为0.750,预测RMPP的灵敏度为72.7%,特异度为64.0%。结论RMPP患儿BALF YKL-40表达水平增高;BALF YKL-40对RMPP具有一定的预测价值。 黄丽林 黄冬平 鲁灵龙 黎静 彭淑梅关键词:难治性肺炎支原体肺炎 YKL-40 支气管肺泡灌洗液 儿童 须癣毛癣菌感染致女童眼周面癣1例 2014年 患儿,女,7岁,右眼睑周围皮肤红斑丘疹伴瘙痒2周,外用糖皮质激素药膏后加重,皮疹扩大。取患者皮疹边缘皮屑行真菌学检查,直接镜检可见透明有隔真菌菌丝,真菌培养结果鉴定为须癣毛癣菌生长;取患儿家庭所饲养宠物兔耳部皮损皮屑及毛发行真菌学检查,直接镜检可见发内链状孢子,真菌培养结果为须癣毛癣菌。提取病原菌DNA,利用引物ITS4和ITS5进行r DNA ITS区序列的PCR扩增,扩增产物测序后在Genbank核酸数据库中进行同源性比对。证实患者面癣病原菌与家兔被毛所携带的须癣毛癣菌同源性达99%。患者经抗真菌治疗后痊愈。 李美荣 张云青 尹颂超 黄丽林 周俊杰 叶聪秀 谢淑霞 赖维 黄怀球关键词:须癣毛癣菌 面癣 人兽共患病 类几丁质酶3蛋白1在申克孢子丝菌刺激巨噬细胞的表达和作用研究 被引量:3 2015年 目的探讨巨噬细胞类几丁质酶3蛋白1在申克孢子丝菌刺激后的表达和作用研究。方法通过测定巨噬细胞与申克孢子丝菌共孵育时杀菌率,使用实时荧光定量PCR检测不同时间点巨噬细胞的类几丁质酶3蛋白1mRNA表达水平,同时体外实验检测类几丁质酶3蛋白1对申克孢子丝菌的抑菌作用,同时采用空白对照和白念珠菌阳性对照比较两者的差异。结果巨噬细胞可吞噬杀灭申克孢子丝菌分生孢子,也可吞噬阳性对照白念珠菌酵母相细胞。巨噬细胞类几丁质酶3蛋白1mRNA表达水平在申克孢子丝菌组和空白对照组无明显差别,作用于阳性对照的白念珠菌组的巨噬细胞类几丁质酶3蛋白1mRNA表达水平明显上调。体外实验显示类几丁质酶3蛋白1对申克孢子丝菌分生孢子的无明显抑制作用,对白念珠菌繁殖却有较强的抑制作用。结论申克孢子丝菌未能诱导巨噬细胞表达类几丁质酶3蛋白1抑制其增殖从而逃逸清除,而白念珠菌感染可上调巨噬细胞类几丁质酶3蛋白1表达从而抑制其增殖减轻感染,这可能是申克孢子丝菌特有的致病作用机制之一。 黄丽林 张静 高文超 李玉哲 袁立燕 何泰龙 黄怀球关键词:申克孢子丝菌 白念珠菌 分生孢子