邓建平 作品数:28 被引量:75 H指数:5 供职机构: 自贡市疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 自贡市重点科技计划项目 国家科技重大专项 四川省卫生厅科研基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 理学 更多>>
多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用 被引量:13 2015年 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。 刘祥 许彦梅 王斌 邓建平 肖波 孙松松 周阳 熊衍文 王红自贡市非结核分枝杆菌临床分离株的菌种鉴定结果分析 被引量:3 2017年 目的对自贡市35株疑似非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株进行菌种鉴定。方法从自贡市各区(县)及市结核病防治获得的临床分枝杆菌分离株,通过罗氏培养基(L-J)、对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)鉴别培养基初步鉴定为NTM,再经多位点PCR方法确定为NTM后,对rpo B、hsp64及its基因进行测序及分析鉴定。结果 35株疑似NTM临床分离株,通过初步鉴别,多位点PCR,rpo B、hsp64及its基因测序及分析鉴别出32株NTM,分别为脓肿分枝杆菌(M.abscessus)11株、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)7株、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)5株、鸟分枝杆菌(M.avium)3株、脓毒分枝杆菌(M.septicum)1株、马赛分枝杆菌(M.masseillense)1株、戈登分枝杆菌(M.gordonae)2株、副瘰疬分枝杆菌(M.parascrofulaceum)1株和Mycobacterium peregrinum 1株。结论抗酸染色阳性、PNB/TCH鉴定为NTM的临床分离株中包含不同种类的NTM,自贡市NTM肺病的病原种类较多,以快生长脓肿分枝杆菌为主,其次为慢生长不产色菌的胞内分枝杆菌和缓慢生长光产色菌的堪萨斯分枝杆菌。实验室应开展进一步菌种鉴定,以指导临床正确诊断和合理治疗。 邓建平 刘海灿 王斌 张红梅 张正东 宁柱 赵秀芹 李群 万康林关键词:非结核分枝杆菌 菌种鉴定 基因测序 3种方法检测肺结核患者痰标本结果分析 被引量:2 2010年 目的比较3种检测方法对肺结核患者痰菌检出率,探索噬菌体生物扩增法提高肺结核病患者结核菌阳性检出率的可行性。方法对同1例肺结核患者的痰标本,采用直接厚涂片法、结核分枝杆菌培养法和噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌。结果在150例肺结核患者痰标本中,直接厚涂片法检出菌阳26例(检出率为17.3%),痰结核分枝杆菌培养阳性33例(检出率为22.0%),噬菌体生物扩增法阳性85例(检出率为56.7%),噬菌体扩增法阳性检出率高于直接厚涂片法和分枝杆菌培养法(χ2=51.8,38.8,P<0.01)。结论噬菌体生物扩增法可提高肺结核病例的痰菌检出率。 邓建平 肖体权 王琳琳关键词:噬菌体生物扩增法 肺结核 痰标本 自贡市肺结核分枝杆菌对一线抗结核药物耐药性分析 被引量:5 2016年 目的了解自贡市肺结核分枝杆菌对一线抗结核药物的耐药状况,为结核病防控工作提供参考依据。方法收集2010-2014年自贡市结核病防治所及各区县结核病防治机构肺结核患者样本分离培养获得的结核分枝菌株及其患者背景资料,采用比例法对一线抗结核药物异烟肼(H)、链霉素(S)、利福平(R)、乙胺丁醇(E)进行药物敏感性体外试验,分析耐药结果。结果 2010-2014年共获得结核分枝杆菌临床分离菌株1 239株,药物敏感性试验结果显示总耐药率为27.85%(345/1 239),其中初治患者菌株耐药率为24.98%(283/1 133),复治患者菌株耐药率为58.49%(62/106);历年耐药率分别为21.88%、24.79%、31.31%、29.63%、26.98%。对4种抗结核药物H、S、R、E的耐药率分别为20.34%(252/1 239)、17.27%(214/1 239)、16.55%(205/1 239)、8.96%(111/1 239)。总耐多药率为14.53%(180/1 239),其中初治患者菌株耐多药率为11.92%(135/1 133),复治患者菌株耐多药率为42.45%(45/106)。耐2种药耐药率为6.13%(76/1 239),耐3种及以上耐药率为11.78%(146/1 239)。结论自贡市结核分枝杆菌耐多药率均高于全国平均水平,应加强耐药结核病监测和防治,控制耐药结核病的蔓延。 邓建平 王斌 张正东 宁柱 白锐 罗载全 李群关键词:肺结核 结核分枝杆菌 抗结核药物 耐药性 2018-2021年四川省自贡市结核病流行病学特征分析 2023年 目的了解2018-2021年四川省自贡市结核病的流行特征,比较新冠疫情前后结核病的流行情况,为结核病防控提供依据。方法从结核病管理信息系统收集2018年1月1日-2021年12月31日自贡市报告的结核病患者资料,对资料进行描述性流行病学分析。结果2018-2021年自贡市累计报告结核病5289例,4年报告发病率49.29/10万~55.19/10万,平均52.54/10万。2018、2019及2021年,每年均有2个报告发病高峰,而2020年报告发病高峰集中在9月。所有登记报告患者中,男女患者比例为3.14:1(4010:1279),农民为患者的主要职业(占56.06%),结核性胸膜炎(占肺外结核的69.17%)和糖尿病(占合并症的74.32%)分别是患者最主要的肺外结核和合并症类型。自流井区是自贡市发病率最低的区县,初治患者是自贡市结核病患者的主要治疗类型,初治患者与复治患者之比为14.60:1(4950:339),就诊延迟率较高的是干部职员(74.29%)、复治(73.75%)、因症就诊(74.95%)/因症推荐(78.57%)人群。新冠疫情后,自贡市结核病报告发病率降低,实验室阳性检出率也降低。结论中老年男性及农民是自贡市结核病防治的重点人群。新冠疫情对结核病患者的性别构成影响不大,但新冠疫情可能使结核病隐匿患者增加,因此新冠疫情期间应有针对性地加大对结核病的宣传、教育及筛查力度。 龙莹 宁柱 汪川 王斌 邓建平关键词:结核病 流行病学特征 抗-HCV确证试验中阳性及不确定结果带型分析 2023年 目的分析本实验室以免疫印迹法(western blotting,WB)测定的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)抗体阳性、不确定结果带型及不确定者抗体变化情况。方法将筛查试验酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)为阳性的176例标本进行确证试验(WB)并分析。结果176例阳性标本经确证试验结果为阳性156例,不确定8例,阴性12例。156例WB阳性带型结果中全带型43例,出现率为27.6%,4条带型(核抗原、NS3-1、NS3-2、NS5)31例,出现率为19.9%,4条带型(核抗原、NS3-1、NS3-2、NS4)19例,出现率为12.2%,3条带型(核抗原、NS3-2、NS5)、2条带型(核抗原、NS3-1)和仅有核抗原1条带型的各11例,出现率均为7.1%。8例不确定者其WB带型结果中NS3-1、NS4(±)的不确定带型组3例(出现率为37.5%),其余带型组合均为不同的1例存在[核抗原(+);核抗原(+)、NS4(±);核抗原(+)、NS5(±);核抗原(+)、NS3-1(±)、NS4(±);NS3-1(±)、NS3-2(±)、NS4(±)];从带型分布看NS3-2、NS4(±)的结果为5例(出现率为62.5%),其次为核抗原(+)4例(出现率为50.0%),NS5(±)为1例(出现率为12.5%)。结论2015—2020年四川省自贡市抗-HCV阳性标本WB带型以核抗原为主,NS3-1次之。抗-HCV不确定标本以NS3-2、NS4带型为主,出现此带型时应加强随访以避免漏检。 袁宗智 邓建平 张斌 李群 李科 王红关键词:免疫印迹法 HCV 带型 3例单增李斯特菌感染的病原学、临床及流行病学特征分析 被引量:12 2015年 目的分析四川省自贡市2014年3例单增李斯特菌感染的临床特征及其病原学特征。方法搜集临床病例信息;采用血清分型,脉冲场凝胶电泳技术和多位点序列分型方法对单增李斯特菌进行分子分型。结果 3例患者均为免疫力低下人群,有发热和败血症症状;3株单增李斯特菌中2株为1/2a血清型、ST8型,1株为1/2b血清型、ST778型,3株PFGE带型均不同。结论免疫力低下人群易受单增李斯特菌侵袭性感染。通过与国内外食品及病人单增李斯特菌相关流行学资料比较,提示国外流行克隆群以及国内某些流行型菌株可引起国内李斯特菌病散发,甚至成为将来暴发的隐患。 王红 王艳 张正东 陈曦 邓建平 肖波 刘祥 王斌 文海 范晖 叶长芸 李群关键词:单增李斯特菌 流行病学特征 四川省川南地区结核分枝杆菌Spoligotyping分型研究 被引量:1 2015年 目的了解四川省川南地区结核分枝杆菌基因型构成情况,为结核病防控提供分子流行病学依据。方法采用间隔区寡核苷酸分型(Spacer Oligonucletide typing,Spoligotyping)方法对四川省川南地区267株临床分离菌株进行基因分型,结果采用BioNumerics(Version 5.10)软件进行分析,并将Spoligotyping分型结果与SpolDB4.0数据库中的菌株进行比对分析。结果 267株结核分枝杆菌表现出66种基因型,其中51株表现为独特基因型,其余216株可聚为10个基因簇。与SpolDB4数据库比对分析发现,267株结核分枝杆菌中,144株为北京家族菌株(53.93%),79株为T家族菌株(29.59%),9株为H家族菌株,3株为U家族菌株,2株为MANU家族菌株,其余30株表现的基因型为数据库中不存在的基因型。结论四川省川南地区结核分枝杆菌存在较高的基因多态性,北京家族菌株和T家族菌株为主要的流行菌株,应加强对这两类菌株的流行趋势的监测及生物学特性研究。 邓建平 刘海灿 王斌 董海燕 张正东 赵秀芹 李群 万康林关键词:结核分枝杆菌 间隔区寡核苷酸分型 北京家族 一起副溶血性弧菌引起食物中毒的病原学鉴定及分型 2018年 目的对食物中毒事件中所采集样本进行副溶血性弧菌的分离鉴定,快速查明食物中毒原因并进行同源性分析。方法采用现行标准检验方法及实时荧光定量PCR对样本进行副溶血性弧菌分离鉴定;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对分离到的副溶血性弧菌进行分子分型。结果运用标准检验方法在22份食物样本中分离到副溶血性弧菌1株,7份粪便样本中分离到5株;实时荧光定量PCR在食物样本中检出核酸阳性1份,粪便样本中检出6份;所分离到的6株副溶血性弧菌经PFGE聚类分析得到4种PFGE带型,指纹图谱相似度为93.48%~97.44%。结论此次食物中毒由同一克隆副溶血性弧菌污染所致,PFGE可有效用于食物中毒的分型研究及溯源分析,实时荧光PCR可作为现行标准检验方法的有效补充。 肖波 孙松松 周阳 王斌 邓建平关键词:副溶血性弧菌 病原学鉴定 脉冲场凝胶电泳质控考核的实验条件优化 2016年 目的针对脉冲场凝胶电泳(PFGE)操作规范(Pulse Net China)为指导的质控考核,优化实验条件,从而得到高质量的实验结果。方法在充分了解实验原理的基础上,以脉冲场凝胶电泳操作规范(Pulse Net China)为指导,对部分实验条件进行优化和效果评价,总结出一套稳定、科学、准确的实验方法。结果通过反复实验,对一系列的实验条件优化后,得到了高质量的实验结果并顺利通过质控考核。结论黄金琼脂糖(SKG)凝胶浓度,酶切时间、电泳时间、胶块脱色时间的选择对结果图谱影响较大,是沙门菌PFGE实验的关键环节。 肖波 孙松松 邓建平 王红 周阳关键词:脉冲场凝胶电泳 质控考核