邓建平
- 作品数:30 被引量:78H指数:5
- 供职机构:自贡市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:自贡市重点科技计划项目国家科技重大专项四川省卫生厅科研基金更多>>
- 相关领域:医药卫生环境科学与工程理学水利工程更多>>
- 多位点序列分型(MLST)在艾伯特埃希菌鉴定中的应用被引量:13
- 2015年
- 目的探讨多位点序列分型技术在新病原艾伯特埃希菌发现与鉴定中的应用。方法采用MLST技术对生鲜肉中分离的30株疑似艾伯特埃希菌的7个管家基因进行PCR扩增、测序、DNAstar软件分析,核酸序列上传至大肠杆菌MLST数据库进行比对,确定其等位基因编号及基因序列型(ST型),并利用MEGA6.0软件Neighbor-joining法构建遗传进化树,与大肠埃希菌、志贺氏菌、艾伯特埃希菌和伤寒沙门氏菌参考菌株进行亲缘性分析。结果 30株菌可分为7种新序列型(16株)和4种已知序列型(14株),N-J分析显示与艾伯特埃希菌参考菌株具有高度亲缘性,而与大肠埃希菌、志贺氏菌、弗格森埃希菌和鼠伤寒沙门氏菌存在较大差异。结论 MLST在管家基因水平上准确地确定艾伯特埃希菌的种属关系,首次在国内发现艾伯特埃希菌的存在。
- 刘祥许彦梅王斌邓建平肖波孙松松周阳熊衍文王红
- 自贡市非结核分枝杆菌临床分离株的菌种鉴定结果分析被引量:3
- 2017年
- 目的对自贡市35株疑似非结核分枝杆菌(NTM)临床分离株进行菌种鉴定。方法从自贡市各区(县)及市结核病防治获得的临床分枝杆菌分离株,通过罗氏培养基(L-J)、对硝基苯甲酸(PNB)和噻吩-2-羧酸肼(TCH)鉴别培养基初步鉴定为NTM,再经多位点PCR方法确定为NTM后,对rpo B、hsp64及its基因进行测序及分析鉴定。结果 35株疑似NTM临床分离株,通过初步鉴别,多位点PCR,rpo B、hsp64及its基因测序及分析鉴别出32株NTM,分别为脓肿分枝杆菌(M.abscessus)11株、胞内分枝杆菌(M.intracellulare)7株、堪萨斯分枝杆菌(M.kansasii)5株、鸟分枝杆菌(M.avium)3株、脓毒分枝杆菌(M.septicum)1株、马赛分枝杆菌(M.masseillense)1株、戈登分枝杆菌(M.gordonae)2株、副瘰疬分枝杆菌(M.parascrofulaceum)1株和Mycobacterium peregrinum 1株。结论抗酸染色阳性、PNB/TCH鉴定为NTM的临床分离株中包含不同种类的NTM,自贡市NTM肺病的病原种类较多,以快生长脓肿分枝杆菌为主,其次为慢生长不产色菌的胞内分枝杆菌和缓慢生长光产色菌的堪萨斯分枝杆菌。实验室应开展进一步菌种鉴定,以指导临床正确诊断和合理治疗。
- 邓建平刘海灿王斌张红梅张正东宁柱赵秀芹李群万康林
- 关键词:非结核分枝杆菌菌种鉴定基因测序
- 3种方法检测肺结核患者痰标本结果分析被引量:2
- 2010年
- 目的比较3种检测方法对肺结核患者痰菌检出率,探索噬菌体生物扩增法提高肺结核病患者结核菌阳性检出率的可行性。方法对同1例肺结核患者的痰标本,采用直接厚涂片法、结核分枝杆菌培养法和噬菌体生物扩增法检测结核分枝杆菌。结果在150例肺结核患者痰标本中,直接厚涂片法检出菌阳26例(检出率为17.3%),痰结核分枝杆菌培养阳性33例(检出率为22.0%),噬菌体生物扩增法阳性85例(检出率为56.7%),噬菌体扩增法阳性检出率高于直接厚涂片法和分枝杆菌培养法(χ2=51.8,38.8,P<0.01)。结论噬菌体生物扩增法可提高肺结核病例的痰菌检出率。
- 邓建平肖体权王琳琳
- 关键词:噬菌体生物扩增法肺结核痰标本
- 诺如病毒P2结构域的原核表达及其抗血清制备
- 2024年
- 目的应用原核表达系统表达并纯化5种基因型(GⅠ.1、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.17)诺如病毒(norovirus,NV)的P2结构域,并制备其抗血清。方法利用生物信息学方法分析不同基因型NV P2序列保守性,合成P2 DNA序列,亚克隆至pET24a载体,构建重组原核表达质粒,转化大肠埃希菌BL21(DE3)感受态细胞,IPTG诱导表达。表达的重组P2蛋白纯化后免疫30只雌性BALB/c小鼠,制备抗血清。通过ELISA法检测抗血清的滴度和交叉反应,Western blot法检测抗血清的特异性,点杂交法分析抗血清对野生病毒的识别与结合能力。结果表达的重组P2蛋白相对分子质量约15000,纯度均达90%以上,GⅠ.1、GⅡ.2、GⅡ.3、GⅡ.4、GⅡ.17型P2蛋白表达量分别为60、26.4、19.8、16.3和33.3 mg/L。针对5种基因型NV P2抗原的抗血清滴度均达1∶128000以上,均能很好地识别自身相应的P2抗原,但不与不相关P2抗原相互作用,均不与重组人A组轮状病毒VP7抗原和重组幽门螺杆菌尿酶抗原发生交叉反应,且对野生型NV具有较好的识别与结合能力。结论利用原核表达系统成功表达并纯化了我国流行的5种基因型NV P2抗原,制备的抗血清滴度较高,特异性良好,为NV快速、现场诊断技术的建立奠定了基础。
- 陈健伟李浩明雪薇王斌邓建平陆峙金杜云霄蔡璐唐秋阳李再新张智
- 关键词:诺如病毒P2蛋白原核表达抗血清
- 自贡市肺结核分枝杆菌对一线抗结核药物耐药性分析被引量:5
- 2016年
- 目的了解自贡市肺结核分枝杆菌对一线抗结核药物的耐药状况,为结核病防控工作提供参考依据。方法收集2010-2014年自贡市结核病防治所及各区县结核病防治机构肺结核患者样本分离培养获得的结核分枝菌株及其患者背景资料,采用比例法对一线抗结核药物异烟肼(H)、链霉素(S)、利福平(R)、乙胺丁醇(E)进行药物敏感性体外试验,分析耐药结果。结果 2010-2014年共获得结核分枝杆菌临床分离菌株1 239株,药物敏感性试验结果显示总耐药率为27.85%(345/1 239),其中初治患者菌株耐药率为24.98%(283/1 133),复治患者菌株耐药率为58.49%(62/106);历年耐药率分别为21.88%、24.79%、31.31%、29.63%、26.98%。对4种抗结核药物H、S、R、E的耐药率分别为20.34%(252/1 239)、17.27%(214/1 239)、16.55%(205/1 239)、8.96%(111/1 239)。总耐多药率为14.53%(180/1 239),其中初治患者菌株耐多药率为11.92%(135/1 133),复治患者菌株耐多药率为42.45%(45/106)。耐2种药耐药率为6.13%(76/1 239),耐3种及以上耐药率为11.78%(146/1 239)。结论自贡市结核分枝杆菌耐多药率均高于全国平均水平,应加强耐药结核病监测和防治,控制耐药结核病的蔓延。
- 邓建平王斌张正东宁柱白锐罗载全李群
- 关键词:肺结核结核分枝杆菌抗结核药物耐药性
- 2018-2021年四川省自贡市结核病流行病学特征分析被引量:1
- 2023年
- 目的了解2018-2021年四川省自贡市结核病的流行特征,比较新冠疫情前后结核病的流行情况,为结核病防控提供依据。方法从结核病管理信息系统收集2018年1月1日-2021年12月31日自贡市报告的结核病患者资料,对资料进行描述性流行病学分析。结果2018-2021年自贡市累计报告结核病5289例,4年报告发病率49.29/10万~55.19/10万,平均52.54/10万。2018、2019及2021年,每年均有2个报告发病高峰,而2020年报告发病高峰集中在9月。所有登记报告患者中,男女患者比例为3.14:1(4010:1279),农民为患者的主要职业(占56.06%),结核性胸膜炎(占肺外结核的69.17%)和糖尿病(占合并症的74.32%)分别是患者最主要的肺外结核和合并症类型。自流井区是自贡市发病率最低的区县,初治患者是自贡市结核病患者的主要治疗类型,初治患者与复治患者之比为14.60:1(4950:339),就诊延迟率较高的是干部职员(74.29%)、复治(73.75%)、因症就诊(74.95%)/因症推荐(78.57%)人群。新冠疫情后,自贡市结核病报告发病率降低,实验室阳性检出率也降低。结论中老年男性及农民是自贡市结核病防治的重点人群。新冠疫情对结核病患者的性别构成影响不大,但新冠疫情可能使结核病隐匿患者增加,因此新冠疫情期间应有针对性地加大对结核病的宣传、教育及筛查力度。
- 龙莹宁柱汪川王斌邓建平
- 关键词:结核病流行病学特征
- 抗-HCV确证试验中阳性及不确定结果带型分析
- 2023年
- 目的分析本实验室以免疫印迹法(western blotting,WB)测定的丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)抗体阳性、不确定结果带型及不确定者抗体变化情况。方法将筛查试验酶联免疫吸附测定(enzyme linked immunosorbent assay,ELISA)为阳性的176例标本进行确证试验(WB)并分析。结果176例阳性标本经确证试验结果为阳性156例,不确定8例,阴性12例。156例WB阳性带型结果中全带型43例,出现率为27.6%,4条带型(核抗原、NS3-1、NS3-2、NS5)31例,出现率为19.9%,4条带型(核抗原、NS3-1、NS3-2、NS4)19例,出现率为12.2%,3条带型(核抗原、NS3-2、NS5)、2条带型(核抗原、NS3-1)和仅有核抗原1条带型的各11例,出现率均为7.1%。8例不确定者其WB带型结果中NS3-1、NS4(±)的不确定带型组3例(出现率为37.5%),其余带型组合均为不同的1例存在[核抗原(+);核抗原(+)、NS4(±);核抗原(+)、NS5(±);核抗原(+)、NS3-1(±)、NS4(±);NS3-1(±)、NS3-2(±)、NS4(±)];从带型分布看NS3-2、NS4(±)的结果为5例(出现率为62.5%),其次为核抗原(+)4例(出现率为50.0%),NS5(±)为1例(出现率为12.5%)。结论2015—2020年四川省自贡市抗-HCV阳性标本WB带型以核抗原为主,NS3-1次之。抗-HCV不确定标本以NS3-2、NS4带型为主,出现此带型时应加强随访以避免漏检。
- 袁宗智邓建平张斌李群李科王红
- 关键词:免疫印迹法HCV带型
- 3例单增李斯特菌感染的病原学、临床及流行病学特征分析被引量:12
- 2015年
- 目的分析四川省自贡市2014年3例单增李斯特菌感染的临床特征及其病原学特征。方法搜集临床病例信息;采用血清分型,脉冲场凝胶电泳技术和多位点序列分型方法对单增李斯特菌进行分子分型。结果 3例患者均为免疫力低下人群,有发热和败血症症状;3株单增李斯特菌中2株为1/2a血清型、ST8型,1株为1/2b血清型、ST778型,3株PFGE带型均不同。结论免疫力低下人群易受单增李斯特菌侵袭性感染。通过与国内外食品及病人单增李斯特菌相关流行学资料比较,提示国外流行克隆群以及国内某些流行型菌株可引起国内李斯特菌病散发,甚至成为将来暴发的隐患。
- 王红王艳张正东陈曦邓建平肖波刘祥王斌文海范晖叶长芸李群
- 关键词:单增李斯特菌流行病学特征
- 四川省川南地区结核分枝杆菌Spoligotyping分型研究被引量:1
- 2015年
- 目的了解四川省川南地区结核分枝杆菌基因型构成情况,为结核病防控提供分子流行病学依据。方法采用间隔区寡核苷酸分型(Spacer Oligonucletide typing,Spoligotyping)方法对四川省川南地区267株临床分离菌株进行基因分型,结果采用BioNumerics(Version 5.10)软件进行分析,并将Spoligotyping分型结果与SpolDB4.0数据库中的菌株进行比对分析。结果 267株结核分枝杆菌表现出66种基因型,其中51株表现为独特基因型,其余216株可聚为10个基因簇。与SpolDB4数据库比对分析发现,267株结核分枝杆菌中,144株为北京家族菌株(53.93%),79株为T家族菌株(29.59%),9株为H家族菌株,3株为U家族菌株,2株为MANU家族菌株,其余30株表现的基因型为数据库中不存在的基因型。结论四川省川南地区结核分枝杆菌存在较高的基因多态性,北京家族菌株和T家族菌株为主要的流行菌株,应加强对这两类菌株的流行趋势的监测及生物学特性研究。
- 邓建平刘海灿王斌董海燕张正东赵秀芹李群万康林
- 关键词:结核分枝杆菌间隔区寡核苷酸分型北京家族
- 自贡市1963株分枝杆菌临床分离株菌种鉴定结果分析1
- 目的 了解自贡市肺结核患者分枝杆菌菌型特征,为临床分枝杆菌病的诊断和治疗,以及为制定有效的结核病控制策略提供理论依据.方法 收集2011-2016年从临床结核病患者分离到的抗酸染色阳性的培养物,经罗氏培养基(L-J)、对...
- 邓建平王斌肖波张正东宁柱李群
- 关键词:分枝杆菌基因测序菌种鉴定