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陈奇: 作品数：14 被引量：1H指数：1; 供职机构：中国科学院南海海洋研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金中国科学院知识创新工程青年人才领域前沿项目国家高技术研究发展计划更多>>; 相关领域：生物学医药卫生环境科学与工程经济管理更多>>

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一种Pictet-Spengler酶及其编码基因与应用: 本发明公开了一种Pictet‑Spengler酶及其编码基因与应用。本发明提供的Pictet‑Spengler酶的编码基因nfcbB的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，Pictet‑Spengler酶NfcbB的氨...; 陈奇谢运昌刘晓颖滕衍斌刘刚张少飞; 文献传递

一种海洋咔啉生物碱的生物合成基因簇及其应用: 本发明公开了一种海洋咔啉生物碱（marincarbolines，MCBs）的生物合成基因簇及其应用。其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第1-4222位所示，包含3个基因：负责MCBs酰胺键合成的基因，即mcbA；负责...; 鞠建华陈奇纪昌涛; 文献传递

2株海洋来源产浅蓝霉素A的异壁放线菌的分离和鉴定被引量：1: 2015年; 利用抗菌及卤虫致死活性模型,从中国南海海底沉积物来源的微生物中筛选到2株放线菌SCSIO WJ01和SCSIO ZJ63,其发酵产物具有较强活性,经16S rRNA基因序列分析这2株放线菌均为异壁放线菌Actinoalloteichus sp.。HPLC-DAD分析显示2株放线菌能产生同一个主要的次级代谢产物,通过正相硅胶柱色谱、反相中压柱色谱、半制备高效液相色谱等手段,从SCSIO WJ01的发酵产物中分离获得了该化合物,运用ESI-MS、1H及13C NMR波谱分析鉴定为浅蓝霉素A(Caerulomycin A)。此外,还从SCSIO WJ01的发酵产物中分离鉴定了浅蓝霉素D。; 纪昌涛周潇陈奇宋永相黄洪波王博鞠建华; 关键词：海洋放线菌联吡啶

一种海洋咔啉生物碱的生物合成基因簇及其应用: 本发明公开了一种海洋咔啉生物碱（marincarbolines，MCBs）的生物合成基因簇及其应用。其核苷酸序列如SEQ ID NO.1的第1-4222位所示，包含3个基因：负责MCBs酰胺键合成的基因，即mcbA；负责...; 鞠建华陈奇纪昌涛; 文献传递

一种海洋异壁放线菌及其在制备浅蓝霉素A中的应用: 本发明公开了一种海洋异壁放线菌及其在制备浅蓝霉素A中的应用。所述的海洋异壁放线菌(Actinoalloteichus sp.)AHMU CJ 021的保藏编号为：CCTCC NO:M 2018157。本发明的海洋异壁放线...; 陈奇刘晓颖谢运昌张园张少飞; 文献传递

深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652抗感染、抗肿瘤药物先导化合物的发现及其生物合成: 深海放线菌生活在高压、高盐、寡营养和低温等极端条件下,具备产生新结构药物先导化合物的巨大潜能。在放线菌5-10Mb的基因组遗传信息中,大约5%-10%的DNA序列编码次级代谢产物的生物合成。因此,对深海放线菌进行发酵和筛...; 陈奇马俊英朱清华纪昌涛鞠建华; 关键词：抗感染抗肿瘤生物合成生物碱

深海放线菌Actinoalloteichus sp. SCSIO ZJ63中β-咔啉生物碱类化合物的挖掘: 利用生物信息学分析,从一株深海来源的异壁放线菌Actinoalloteichus sp.SCSIO ZJ63基因组序列中挖掘到一个Pictet-Spengler反应酶编码基因acwB,将其在异源宿主E.coli BL21...; 陈奇纪昌涛张云宋永相黄洪波马俊英王博李青莲鞠建华

海洋放线菌基因组及其次级代谢产物生物合成的研究进展: 本文以近几年海洋放线菌的研究概况为主线，阐述了海洋放线菌基因组和海洋放线菌次级代谢产物生物合成方面的研究进展。自第一例海洋放线菌天然产物enterocin生物合成机制被阐明到2013年12月止，人们已经完成了127株海洋...; 陈奇李青连鞠建华; 关键词：海洋放线菌次级代谢产物基因组生物合成

Marinacarbolines甲基化基因mcbD的筛选及其功能: 2017年; 【目的】定位Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652基因组中负责marinacarbolines甲基化修饰的基因mcbD并鉴定其功能。【方法】游离M.thermotolerans SCSIO 00652的基因组序列中功能注释为甲基转移酶的蛋白,使用MEGA 6自带的ClustalW与来自于marformycins生物合成途径中的Mfn G(D/L-酪氨酸甲基化酶)进行多序列比对,用邻接法(Neighbor-Joining)构建系统进化树,筛选到与MfnG进化关系最近的Orf03255(Mcb D);扩增mcbD后克隆至pET28a(+)并在E.coli BL21(DE3)中表达,结合Ni-NTA亲和层析法纯化获取较高纯度的McbD活性蛋白;以marinacarboline B为底物,利用高效液相色谱检测McbD的体外酶活;利用基于PCR-targeting的遗传操作体系构建mcb D插入失活突变株((35)mcbD)并分析其与野生型菌株的发酵产物差异。【结果】N-末端融合组氨酸标签的McbD蛋白在E.coli BL21(DE3)中可溶性表达,亲和层析纯化的McbD能够以marinacarboline B为底物催化形成marinacarboline C;mcbD基因阻断突变株ΔmcbD与野生型相比不产生化合物marinacarboline C,同时累积marinacarboline B。【结论】McbD为marinacarbolines生物合成中必需的O-甲基转移酶。; 陈奇秦湘静李青连鞠建华; 关键词：甲基化生物合成酶反应