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大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种NPY基因的DNA和cDNA克隆及序列分析被引量：2: 2016年; 神经肽Y(Neuropeptide Y,NPY)在机体的摄食活动中发挥重要作用,是哺乳动物最重要的一种内源性促食欲因子。为了解大口黑鲈(Micropterus salmoide)NPY基因的结构及进一步研究该基因在大口黑鲈中的功能作用,采用RT-PCR和RACE技术,克隆了大口黑鲈北方亚种(M.salmoides salmoides)和佛罗里达亚种(M.salmoides floridanus)NPY基因c DNA序列,结果表明两亚种NPY c DNA均包括一个编码99个氨基酸的ORF框和长度为52 bp的5'非编码区(5'-UTR);采用PCR和基因组步移技术获得了长度分别为3 561 bp和3 565 bp的大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种NPY基因DNA序列。序列分析结果表明,大口黑鲈北方亚种和佛罗里达亚种NPY基因由4个外显子和3个内含子组成。经MATINSPECTOR软件预测,在北方亚种和佛罗里达亚种启动子序列分布有TATA框、CAAT框、CCAAT-Box、GATA-Box等基本转录调控元件。实验在大口黑鲈两亚种NPY DNA序列间发现了6个单个位点碱基差异,与大口黑鲈北方亚种相比佛罗里达亚种启动子区域出现一个4个碱基的插入。不同物种间NPY基因的序列同源性分析表明大口黑鲈与鳜鱼和石斑鱼的NPY基因核苷酸同源性最高,达90%和88%,氨基酸同源性分别为93%和95%。; 刘浩白俊杰李胜杰; 关键词：大口黑鲈亚种食欲 NPY基因

基于转录组测序的大口黑鲈驯食相关SNP开发及其与生长性状的关联分析被引量：3: 2018年; 大口黑鲈为肉食性鱼类,传统养殖过程中使用大量的冰鲜鱼为饵料,冰鲜鱼的使用不仅增加了养殖成本,而且多余的冰鲜鱼残饵还会给环境带来严重的污染。为了保护环境并降低养殖成本必须减少冰鲜鱼的使用量,本实验以选育适合人工配合饲料饲喂大口黑鲈为研究目标,用人工配合饲料作为饵料驯化大口黑鲈幼鱼,在驯食后14和16 d,测定其体质量、全长、体高等生长指标。同时在大口黑鲈转录组测序分析获得的SNP位点中,选择其所在序列的基因功能与能量代谢有相关性的7个SNP位点进行SNaPshot分型,用SPSS 19.0进行卡方分析标记与生长性状的相关性。结果发现,序列Unigene031044中的C1332G位点、Unigene085384中的A741G位点和Unigene022319中的A284G位点在体质量、全长及体高性状上存在显著差异。这3个SNP位点所在的基因经预测分别与雌二醇17β脱氢酶12B (hsd17b12b)基因、长链酰基辅酶A合成酶家族成员1(acsl1)基因和琥珀酸脱氢酶组装因子2(sdhaf2)基因具有很高的同源性,推测上述3个SNP位点的变异可能影响了基因表达产物对脂肪酸代谢或三羧酸循环的调节功能,与大口黑鲈对人工配合饲料的利用能力存在密切的相关性。本研究筛选得到的与驯食相关的SNP位点为大口黑鲈功能基因多态性的进一步研究,及加快大口黑鲈食性改良与驯化育种的遗传研究提供了科学的参考依据。; 马冬梅全迎春樊佳佳胡婕白俊杰刘浩; 关键词：大口黑鲈人工配合饲料驯食生长性状

大口黑鲈NPY基因多态性及与生长的关联分析: 2018年; 神经肽Y （NPY）是鱼类摄食调控网络中具有促进食欲的摄食因子,NPY基因上的多态性可能影响鱼类的摄食进而对生长性状产生影响。本研究通过PCR扩增和直接测序在大口黑鲈NPY基因5＇非编码区筛选获得1个SNP位点S1 （A-85C）。随机选取同塘饲养的12月龄大口黑鲈327尾作为分型群体,采用SNaPshot方法检测每尾鱼中S1位点的基因型,运用Popgene 32软件进行群体遗传结构分析。结果表明,S1位点共有3种基因型：AA、AC和CC,其分布频率分别为0.560、0.416和0.024。该位点在群体中的有效等位基因数（Ne）、观测杂合度（Ho）和期望杂合度（He）分别为1.928、0.450和0.449,处于哈温平衡。采用一般线性模型分析不同基因型与大口黑鲈生长性状之间的相关性,结果显示：AC基因型群体的平均体质量、体宽、全长和体高分别高于AA基因型群体和CC基因型群体,其中AC基因型个体的平均体质量比CC基因型个体的平均体质量增加了15.37%,但在统计上均没有达到显著相关（p〉0.05）。这可能与CC基因型个体明显偏少,只占分型群体的2.4%有关。; 李胜杰刘浩白俊杰吴建开马冬梅马冬梅樊佳佳樊佳佳; 关键词：大口黑鲈摄食 NPY 单核苷酸多态性生长性状

驯食饲料的大口黑鲈SNPs筛选及其与生长性状的关联分析: 以人工饵料代替冰鲜杂鱼培育肉食性经济鱼类一直是研究者探索的热点之一,而从转录组水平对大口黑鲈的食性适应性研究仍未开展,本研究以食用冰鲜和配合饲料的同批大口黑鲈为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)...; 全迎春马冬梅白俊杰刘浩李胜杰刘海涌; 关键词：RNA-SEQ 大口黑鲈 SNPS; 文献传递

Research Advances in Gene Regulation and Genetic Improvement of Fish Feeding被引量：1: 2015年; Feeding habit which is regulated by many factors including the intrinsic and external factors, such as appetite, structure of the digestive tract and feed palatability, is an important content in the study of genetic improvement. The genetic regulation is one of the major parts among the researches. This research reported the progress of the polymorphism of genes associated with appetite and its correla- tion with feeding habits, and summarized the studies on improvements of fish feed- ing and protein sources of the artificial feeding in order to provide theoretic basis for cultivating the improved varieties in feeding habit.; 刘浩李胜杰白俊杰; 关键词：APPETITE POLYMORPHISM

大口黑鲈ghrelin基因SNPs的筛选及与生长性状关联性分析被引量：5: 2016年; ghrelin是脊椎动物的一种脑肠肽,有促进摄食的功能,并能促进生长激素(GH)释放,参与能量平衡调控和糖类代谢。为探索ghrelin基因多态性与大口黑鲈生长性状的相关性,针对大口黑鲈ghrelin基因的启动子序列,实验采用直接测序法获得了2个SNPs位点:S1(A-642C)和S2(A-639C)。随机选取同批繁殖、同塘养殖的大口黑鲈采用Sna Pshot方法进行SNPs位点检测和分型。结果显示,实验群体在ghrelin基因2个SNPs位点上基本处于哈温平衡,S1和S2共组成5种双倍型(D1、D2、D3、D4和D5)。基因型与生长性状的相关性分析结果表明,S1位点AC型个体在体高与全长上显著高于CC型个体,S2位点AA型个体在头长上显著高于AC型个体。双倍型D1在体质量、全长和体高方面显著高于双倍型D3,在体质量、体宽和体高方面显著高于双倍型D4。本研究在大口黑鲈ghrelin基因启动子区域获得的与生长性状相关的SNPs标记,可为大口黑鲈分子标记辅助育种提供帮助。; 刘浩白俊杰李胜杰樊佳佳全迎春; 关键词：大口黑鲈 GHRELIN基因 SNPS

大口黑鲈转录组SNPs筛选及其与生长的关联分析被引量：17: 2016年; 为开发人工饲料代替冰鲜杂鱼养殖大口黑鲈的分子标记,以食用冰鲜鱼和配合饲料的同批大口黑鲈为研究材料,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术挖掘SNPs(Single nucleotide polymorphisms)标记,并以关联分析筛选可用于育种的候选标记。转录组进行测序共获得174 M数据,8681个SNPs位点。挑选其中具有表达差异的50个SNPs位点进行SNa Pshot分型,结果39个分型成功,其中有4个为假阳性,通过转录组技术开发出SNPs标记35个,成功率为70.0%。为进一步检验这些标记是否可用于评估驯食饲料的大口黑鲈选育研究,研究以327尾摄食人工配合饲料的大口黑鲈为试验材料,SPSS软件进行一般线性模型分析SNPs的不同基因型与生长性状的相关性,结果显示有2个SNPs位点与体质量、全长和体高等生长性状存在显著相关性(P<0.05),可作为候选标记用于大口黑鲈的分子辅助育种。由于转录组数据直接反应基因的表达情况,从中挖掘与性状相关的优势基因型与分子标记的成功率高,效果较好。同时也为解决大口黑鲈选育研究中标记缺乏提供了有效途径,为选育提供遗传依据、加速育种进程。; 全迎春马冬梅白俊杰刘浩李胜杰刘海涌; 关键词：大口黑鲈生长性状

大口黑鲈驯食相关SNP筛选及其与幼鱼生长的关联分析: 大口黑鲈(Micropterus salmoides)为肉食性鱼类，传统养殖过程中使用大量的冰鲜鱼为饵料，冰鲜鱼的使用不仅增加了养殖成本，而且多余的冰鲜鱼残饵还污染了环境。; 马冬梅全迎春胡婕樊佳佳白俊杰刘浩; 关键词：大口黑鲈人工配合饲料驯食

鱼类食性的基因调控与遗传改良研究进展被引量：3: 2015年; 鱼类食性受多种因素包括内在的遗传和生理因素如食欲、消化道结构以及外在的饵料性质如蛋白来源、饲料适口性等的影响,是遗传改良研究中的一个重要内容。其中功能基因的遗传调控是食性的主要决定因素之一。笔者概述了鱼类食欲调控相关基因的多态性及其与食性的相关性研究进展,并对鱼类食性改良和人工饲料蛋白源等方面进行了综述,以期为培育食性改良品种提供科学参考。; 刘浩李胜杰白俊杰; 关键词：食性食欲多态性

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刘浩

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