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邵芬娟: 作品数：12 被引量：33H指数：4; 供职机构：中国林业科学研究院林业研究所更多>>; 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目更多>>; 相关领域：生物学农业科学化学工程医药卫生更多>>

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白木香氧甲基转移酶基因AsOMT11及编码产物的应用: 本发明提供了一种白木香(Aquilaria sinensis)的氧甲基转移酶基因AsOMT11及编码产物的应用。本发明提供的AsOMT11基因具有催化沉香6位氧甲基化色酮类化合物的合成。本发明还公开了AsOMT11基因在...; 邱德有邵芬娟吴文丽

一种沉香色酮合成相关的AsCYP82G1基因及编码产物的应用: 本发明公开的AsCYP82G1基因具有催化6羟基‑2‑(2‑苯乙基)色酮合成的能力。本发明还公开了AsCYP82G1基因在选育白木香或奇楠新品种中的应用和调控沉香的品质应用。本发明对沉香2‑(2‑苯乙基)色酮类化合物生物...; 邵芬娟邱德有吴文丽

促进木本植物茎生长基因TcSG及其编码蛋白和用途: 本发明提供了一种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因TcSG及其编码蛋白，本发明还公开了这种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因的用途，尤其在木本植物改良中用于增加木本植物植株的高度、节间的长度和茎的粗度。本发明...; 邱德有李艳艳杨艳芳邵芬娟

穗花杉的转录组测序及其转录组特性分析被引量：5: 2017年; [目的]通过对红豆杉科穗花杉属的穗花杉进行转录组测序,为穗花杉的萜类合成途径和分类学研究提供支持。[方法]利用Hi Seq2500技术对穗花杉的茎叶进行转录组测序。[结果]穗花杉转录组测序共得到8.14 Gb的clean data。从头组装共获得82 884条unigene,其中有27 495条unigene被注释。此外,在82 884条unigene中共搜索到2 827个SSR位点,单核苷酸重复SSR出现频率最高(60.1%),其次为三核苷酸重复SSR(25.4%)。在穗花杉unigene中挖掘出了1个牦牛儿基焦磷酸合成酶(GPS)、1个法尼烯基焦磷酸合成酶(FPS)和5个牦牛儿基牦牛儿基焦磷酸合成酶(GGPS)的同源基因,同时得到紫杉二烯合成酶(TS)同源基因13个。[结论]发现了20个与萜类合成有关的unigene和2 827个SSR位点,为今后穗花杉萜类生物合成研究,特别是紫杉二烯合成酶编码基因的研究打下了基础,也为该物种系统分类地位及遗传多样性研究提供了新的遗传信息。; 王帅邵芬娟李论芦强邱德有; 关键词：穗花杉转录组 SSR

丹参不同愈伤组织诱导及遗传转化体系优化被引量：5: 2017年; 为了获得满足不同目的组织培养材料和稳定高效的遗传转化体系,该研究以丹参叶片和茎段为外植体,采用含不同浓度的植物激素(植物生长物质)的Murashige Skoog(MS)培养基,探索诱导丹参产生不同愈伤的条件;采用正交法考察浸染时间、共培养时间、筛选压等对农杆菌介导的丹参遗传转化体系的影响,并根据出芽率及转化阳性率优化丹参遗传转化体系。结果表明:(1)能较快诱导丹参叶片产生愈伤的是MS+0.5mg·L^(-1)6-BA+0.5 mg·L^(-1)2,4-D;诱导茎较快产生愈伤的是MS+0.1mg·L^(-1)NAA+0.5 mg·L^(-1)6-BA;1 mg·L^(-1)反式玉米素(ZR)可能有利于诱导产生含有丹参酮的愈伤组织;1.0 mg·L^(-1)2,4-D较易诱导丹参愈伤组织生根。(2)以卡那霉素为筛选剂时农杆菌GV3101介导的丹参遗传转化的条件为浸染5 min、共培养1 d、卡那霉素30 mg·L^(-1)筛选,经PCR鉴定转基因阳性率为60%;而用10 mg·L^(-1)链霉素筛选阳性率达70%。该研究结果确定了丹参不同愈伤组织诱导条件,明确了以卡那霉素为筛选剂时农杆菌GV3101介导的丹参遗传转化的条件,换用10 mg·L^(-1)链霉素筛选时体系更加稳定、更易操作、更易重复。; 张林甦邵芬娟秦利军; 关键词：丹参愈伤

南方红豆杉转录组SSR位点分析及其分子标记开发: 2024年; 目的基于赤霉素(gibberellin A3,GA3)处理下的南方红豆杉Taxus chinensis var.mairei转录组数据鉴定和分析SSR位点,开发可用于南方红豆杉种质资源鉴定和遗传多样性分析的SSR标记。方法使用MISA软件对南方红豆杉转录组数据进行SSR分析,搜索SSR位点。可搜索单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸,最小重复数分别设置为10、6、5、5、5、5次。采用Primer 3(2.3.5版,默认参数)进行SSR引物设计。通过毛细管荧光电泳检测,最终选定多态性好,扩增成功率高的SSR引物用于后续数据分析;通过MEGA进行UPGMA聚类分析,构建聚类树。结果转录组测序共获得202361条Unigene,采用MISA软件搜索出12008个SSR位点,分布在10894条Unigenes上,发生频率为5.38%,平均距离为1/7.64 kb。单核苷酸重复类型最丰富,占总SSR位点的51.74%,其次为三核苷酸(20.92%)和二核苷酸重复类型(20.88%)。A/T、AG/CT是优势重复基序,分别占总SSR重复类型的49.60%和10.93%。随机抽选96对SSR引物,以4个地区12份南方红豆杉种质进行引物有效性和多态性验证,筛选出13对具多态性的SSR引物,多态性引物比率为13.54%。13对引物在东北红豆杉Taxus cuspidata扩增效率高达100%,但在曼地亚红豆杉Taxus×media扩增效率仅为23.08%。聚类分析表明太行山地区南方红豆杉聚为一类,浙江、福建和湖南等南方来源的南方红豆杉聚为一类,后三者彼此之间遗传距离更近。结论南方红豆杉转录组测序产生的Unigene信息可以用来开发SSR分子标记,开发的13个标记将有助于南方红豆杉物种遗传多样性、分子育种、资源保护等方面的研究。; 蒋路园吴文丽张恺恺张林凤邵芬娟陈段芬邱德有杨艳芳; 关键词：南方红豆杉转录组 SSR 曼地亚红豆杉

紫杉醇生物合成研究历史、现状及展望被引量：8: 2015年; 紫杉醇是从红豆杉中分离出来的一种二萜类化合物,是目前临床上使用最广泛的抗癌药物之一。回顾了紫杉醇生物合成的研究历史,主要包括参与红豆杉紫杉醇生物合成的结构基因、调控基因、红豆杉代谢组、内生真菌紫杉醇生物合成研究历史以及国际上紫杉醇生物合成专利情况等。介绍了近年来红豆杉和内生真菌紫杉醇生物合成研究的现状。最后探讨了本领域未来的研究方向并对其前景进行展望。; 邱德有张彬杨艳芳邵芬娟滕文静; 关键词：紫杉醇生物合成

促进木本植物茎生长基因TcSG及其编码蛋白和用途: 本发明提供了一种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因TcSG及其编码蛋白，本发明还公开了这种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因的用途，尤其在木本植物改良中用于增加木本植物植株的高度、节间的长度和茎的粗度。本发明...; 邱德有李艳艳杨艳芳邵芬娟; 文献传递

香榧中不存在紫杉醇的化学及分子生物学证据被引量：4: 2016年; 香榧(Torreya grandis Fort.ex Lindl.cv.Merrillii)是红豆杉科榧树属的一个种。由于香榧与红豆杉属植物具有较近的亲缘关系,研究者认为香榧也可以合成紫杉醇,并利用HPLC法验证其中含有紫杉醇。但他们仅仅依靠HPLC中出峰时间来判断,并没有质谱的分析结果。本研究利用LC-MS对香榧茎叶的化学提取物进行分析发现香榧并不能合成紫杉醇。为了进一步证明香榧不能合成紫杉醇,我们利用欧洲红豆杉(Taxus baccata L.)紫杉醇生物合成关键基因-紫杉二烯合成酶基因(Taxadiene synthase gene,Tb TS)TBLASTN比对香榧本地转录组,从中找出并克隆得到与Tb TS同源性最高的Tgr TSL1基因。利用原核表达对Tgr TSL1基因进行功能分析,发现该基因不具有紫杉二烯合成酶编码基因的功能。这样,我们从化学和生物学两个方面对香榧无法合成紫杉醇这个结论进行了证明。这为以后通过植物学和化学分类学等研究穗花杉的分类学地位提供了新的有用信息。; 王帅赵中槐董清华邵芬娟芦强邱德有; 关键词：香榧紫杉醇原核表达

雷蒙德氏棉LBD基因家族的鉴定及进化表达分析被引量：3: 2017年; 家族转录因子是后基因组时代的研究热点。植物中的家族转录因子参与调控了许多重要的生物学过程,包括形态建成、信号转导、环境应激反应。植物特有的(lateral organ boundaries domain,LBD)/ASL(ASYMMETRIC LEAVES2-LIKE)家族转录因子包含保守的类似锌指结构CX2CX6CX3C基序,在调控拟南芥、水稻、玉米等模式植物生长发育过程中起到至关重要的作用。然而,对于棉花LBD基因的功能目前我们还知之甚少。本研究从雷蒙德氏棉基因组中鉴定出66个LBD基因,不均匀的分布在13条染色体上。这些基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅱa和Ⅱb等6个亚类。该家族基因结构简单,外显子数目不超过3个。从雷蒙德氏棉LBD家族成员中共找出15段保守基序,并对(lateral organ boundaries,LOB)结构域的保守性进行了分析。基因表达模式分析揭示出雷蒙德氏棉LBD基因家族的表达具有一定时空特异性。本研究为今后雷蒙德氏棉LBD基因功能的验证奠定了基础。; 芦强邵芬娟邱德有; 关键词：系统进化分析基因表达

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