李艳艳
- 作品数：5 被引量：4H指数：1
- 供职机构：中国林业科学研究院林业研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央级公益性科研院所基本科研业务费专项更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学更多>>
- 促进木本植物茎生长基因TcSG及其编码蛋白和用途
- 本发明提供了一种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因TcSG及其编码蛋白，本发明还公开了这种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因的用途，尤其在木本植物改良中用于增加木本植物植株的高度、节间的长度和茎的粗度。本发明...
- 邱德有李艳艳杨艳芳邵芬娟
- 红豆杉TcLBDs基因的克隆与表达分析被引量：1
- 2015年
- 【目的】LBD(LATERAL ORGAN BOUNDARIES DOMAIN)转录因子在植物次生生长中具有潜在的作用。克隆红豆杉LBD基因,研究LBD在红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其调控作用。【方法】在红豆杉剥皮再生组织转录组数据库中搜索LBD基因,根据获得的基因序列设计引物,利用RT-PCR方法克隆得到2个红豆杉TcLBDs基因的cDNA片段,分别命名为TcLBD1和TcLBD6。进一步利用生物信息学工具对其进行分析,最后利用半定量RT-PCR对红豆杉不同组织、利用qRT-PCR技术对其剥皮再生不同时期的TcLBDs的表达进行分析。【结果】TcLBD1的cDNA包含549 bp开放阅读框(ORF),编码182个氨基酸;TcLBD6的cDNA包含687 bp开放阅读框,编码228个氨基酸。TcLBD1和TcLBD6编码的蛋白质分子量分别为19.97,25.13 kDa,序列分析表明二者在N端存在着LBD类转录因子特有的LOB结构域,都属于第1类(ClassⅠ)LBD;二者在核酸序列和氨基酸序列水平上分别有55.2%和57.9%的相似性,且蛋白质二级结构也具有较高的相似性。系统进化树结果显示TcLBD1与北美云杉的蛋白(ABK21479)聚为一簇,亲缘关系最近;TcLBD6与拟南芥的AS2/LBD6聚在一起。组织表达谱分析表明Tc LBD1在茎和木质部(含形成层)中表达量明显高于根、叶片和韧皮部(含形成层)中的表达量;TcLBD6主要在根和茎中表达。2个TcLBDs基因在红豆杉剥皮再生不同时期再生组织间的表达模式结果显示,在其剥皮再生过程中Tc LBD1基因表达量在6天时达到最高,整体呈上调表达;Tc LBD6表达水平在18天后显著上调。【结论】克隆2个红豆杉TcLBDs基因,TcLBD1和TcLBD6,这2个基因在红豆杉剥皮再生过程中均有响应,推测二者在红豆杉剥皮后树皮再生过程中起调控作用。
- 李艳艳杨艳芳王俊青王帅刘洪伟邱德有
- 关键词：红豆杉LBD转录因子生物信息学分析基因表达
- 中国红豆杉TcAPLs基因的克隆及表达分析被引量：2
- 2015年
- 目的克隆中国红豆杉altered phloem development(APL)基因,研究APL在中国红豆杉剥皮后树皮再生过程中的表达状况,以揭示其可能的调控作用机制。方法利用反转录PCR(RT-PCR)方法克隆得到3个中国红豆杉APL(TcAPLs)基因的cDNA全长序列,分别命名为TcAPL1、TcAPL2和TcAPL3,进一步利用生物信息学工具对其进行分析,最后利用半定量RT-PCR对中国红豆杉不同组织和qRT-PCR技术对其剥皮再生不同时期的TcAPLs进行表达分析。结果系统进化树结果显示,TcAPL1与TcAPL2编码的蛋白与川桑的APL蛋白亲缘关系最近,聚为一类;TcAPL3处在APL另一个大的独立分支上。组织表达谱分析表明TcAPL1和TcAPL22个基因主要在根、茎、叶片和韧皮部(含形成层)中均高表达;TcAPL3在叶片中表达量较高,而在根和木质部(含形成层)表达较低。在中国红豆杉剥皮再生过程中,TcAPL1和TcAPL22个基因的表达水平随着时间的延长表现为先上升后下降的趋势,均在36 d下降最明显;TcAPL3的表达则在整个组织再生过程中被抑制。结论克隆了3个TcALs基因,3个基因在中国红豆杉剥皮再生过程中均有响应,推测它们在中国红豆杉植物剥皮后组织再生中起一定的调控作用。
- 李艳艳杨艳芳刘洪伟王帅邱德有
- 关键词：中国红豆杉基因克隆生物信息学分析
- 促进木本植物茎生长基因TcSG及其编码蛋白和用途
- 本发明提供了一种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因TcSG及其编码蛋白，本发明还公开了这种促进木本植物茎生长(纵向和横向生长)基因的用途，尤其在木本植物改良中用于增加木本植物植株的高度、节间的长度和茎的粗度。本发明...
- 邱德有李艳艳杨艳芳邵芬娟
- 文献传递
- 榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因的克隆与表达被引量：1
- 2016年
- 牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合酶是产紫杉醇内生真菌紫杉醇合成下游途径中的关键步骤之一,在榛子产紫杉醇内生真菌中进行紫杉醇生物合成研究时首先要确认GGPP合酶的存在。该研究通过RT-PCR方法克隆得到了榛子产紫杉醇内生真菌Penicillium aurantiogriseum中GGPP合酶基因Pa GGPPS(Gen Bank登录号为KM881430)的c DNA开放阅读框(Open reading frame,ORF)。利用生物信息学方法,我们分析了该基因的序列,并对其编码的氨基酸序列进行了预测。结果发现该基因ORF长度为1 113 bp,预计蛋白分子量为40.98k D,等电点为6.168,表明该蛋白呈酸性。对其进行亲疏水性分析发现肽链整体呈现为亲水性。Pa GGPPS的主要二级结构元件为α-螺旋,并且包含一个异戊二烯类化合物合酶功能域。对榛子产紫杉醇内生真菌与其他物种的GGPPS进行氨基酸同源性分析,发现其与娄地青霉、曲霉菌和费氏新萨托菌的一致性较高,分别为94%、76%和76%。进化树分析表明来自动物、真菌和酵母的GGPPS聚为一类,来自植物的GGPPS聚为一类,其中榛子产紫杉醇内生真菌的GGPPS和青霉菌的进化关系最近,与植物的GGPPS的进化关系最远。对其进行基础生物信息学分析后,我们构建了原核表达载体,成功诱导其表达并得到可溶性蛋白。该研究结果为下一步深入研究GGPPS基因在内生真菌Penicillium aurantiogriseum紫杉醇合成途径中的作用及和构建高产紫杉醇基因工程菌株奠定了一定的基础。
- 刘洪伟杨艳芳李艳艳王帅邱德有
- 关键词：内生真菌紫杉醇
