曹鹏
- 作品数：8 被引量：34H指数：3
- 供职机构：教育部更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生自动化与计算机技术一般工业技术更多>>
- 结合域适应学习的糖尿病视网膜病变分级诊断被引量：1
- 2022年
- 目的 传统的糖尿病视网膜病变(糖网)(diabetic retinopathy, DR)依赖于早期病理特征的精确检测,但由于数据集缺乏病灶标记区域导致无法有效地建立监督性分类模型,引入其他辅助数据集又会出现跨域数据异质性问题;另外,现有的糖网诊断方法大多无法直观地从语义上解释医学模型预测的结果。基于此,本文提出一种端到端式结合域适应学习的糖网自动多分类方法,该方法协同注意力机制和弱监督学习加强优化。方法 首先,利用已标记病灶区域的辅助数据训练病灶检测模型,再将目标域数据集的糖网诊断转化为弱监督学习问题,依靠多分类预测结果指导深度跨域生成对抗网络模型,提升跨域的样本图像质量,用于微调病灶检测模型,进而过滤目标域中一些无关的病灶样本,提升多分类分级诊断性能。最后,在整体模型中融合注意力机制,从医学病理诊断角度提供可解释性支持其分类决策。结果 在公开数据集Messidor上进行糖网多分类评估实验,本文方法获得了71.2%的平均准确率和80.8%的AUC(area under curve)值,相比于其他多种方法具有很大优势,可以辅助医生进行临床眼底筛查。结论 结合域适应学习的糖网分类方法在没有提供像素级病灶标注数据的情况下,只需要图像级监督信息就可以高效自动地对眼底图像实现分级诊断,从而避免医学图像中手工提取病灶特征的局限性和因疲劳可能造成漏诊或误诊问题,另外,为医生提供了与病理学相关的分类依据,获得了较好的分类效果。
- 宋若仙曹鹏赵大哲
- 关键词：眼底图像
- 多核多示例学习的糖尿病视网膜病变诊断被引量：5
- 2018年
- 目的在传统糖尿病视网膜病变(糖网)诊断系统中,微动脉瘤和出血斑病灶检测的精确性决定了最终诊断性能。目前的检测诊断方法为了保证高敏感性而产生了大量假阳性样本,由于数据集没有标注病灶区域导致无法有效地建立监督性分类模型以去除假阳性。为了解决监督性学习在糖网诊断中的问题,提出一种基于多核多示例学习的糖网病变诊断方法。方法首先,检测疑似的微动脉瘤和出血斑病灶区域,并将其视为多示例学习模型中的示例,而将整幅图像视为示例包,从而将糖网诊断转化为多示例学习问题;其次,提取病灶区域的特征对示例进行描述,并通过极限学习机(ELM)分类算法过滤不相关示例以提升后续多示例学习的分类性能;最后,构建多核图的多示例学习模型对健康图像和糖网病变图像进行分类,以实现糖网病变的诊断。结果通过对国际公共数据集MESSIDOR进行糖网病变诊断评估实验,获得的准确率为90.1%,敏感性为92.4%,特异性为91.4%,ROC(receiver operating characteristic)曲线下面积为0.932,相比其他算法具有较大性能优势。结论基于多核多示例学习方法在无需提供病灶标注的情况下,能够高效自动地对糖网病变进行诊断,从而既能避免医学图像中标注病灶的费时费力,又可以免除分类算法中假阳性去除的问题,获得较好的效果。
- 任福龙曹鹏曹鹏万超万超
- 关键词：微动脉瘤眼底图像计算机辅助诊断多示例学习
- 高效液相色谱法测定山楂饮料中有机酸的含量
- 饮料中的有机酸的种类和含量差别很大,并且直接影响着饮料的口感和营养价值.有机酸的分析方法常见的有酸碱滴定法[1]、薄层色谱法、气相色谱法[2]、离子色谱法[3]、液相色谱法[4]等.薄层色谱法一次能测定多种有机酸,但准确...
- 张朝正曹鹏石秀峰
- 关键词：山楂饮料有机酸高效液相色谱
- 基于GC-MS的阿维链霉菌代谢物组学研究方法的建立被引量：3
- 2015年
- 基于GC-MS分析平台,建立了阿维链霉菌代谢物组样品制备过程中的菌体分离、细胞清洗、细胞淬灭及代谢物提取条件,并对阿维菌素高产菌株和野生菌株胞内代谢物组进行了初步分析。采用"冷冻离心-细胞清洗(3次)-液氮淬灭(5min)-珠磨破壁(3个循环,每个循环48 s)-提取(氯仿∶乙醇∶水=2∶2∶1)"的方法,可以定性和定量检测阿维链霉菌胞内包括氨基酸、有机酸、脂肪酸、糖类等59种差异化合物。建立的方法能够有效地用于阿维链霉菌胞内代谢物的分析。
- 郭刚唐丹田萍萍石秀峰曹鹏高强
- 关键词：阿维链霉菌破壁GC-MS
- 揭秘环内过氧桥键生物合成新机制
- 2016年
- 含过氧桥键的化合物包括环内过氧化合物、链过氧化物和过氧氢基化合物,其中环内过氧化合物具有多种生物活性.高效抗疟疾的青蒿素是最具有代表性的化合物,其发现者屠呦呦教授也因此荣获2015年诺贝尔生理学或医学奖.
- 高强赵树欣纪增春曹鹏胡栋
- 关键词：氧化合物生物合成青蒿酸吲哚生物碱
- 基于比较代谢组学的理性优化方法提高阿维菌素产量被引量：6
- 2017年
- 【目的】利用比较代谢组学的分析方法,研究不同发酵培养基中阿维链霉菌的胞内代谢差异,揭示合成阿维菌素的关键代谢物和代谢途径,再通过理性优化添加主要关键代谢物,提高阿维菌素产量。【方法】对M1和M2培养基中生长的菌体进行基于GC-MS的胞内代谢组学分析,通过理性添加强化前体代谢物,确定阿维菌素高产培养基。【结果】GC-MS共检测到232种物质,能够精确匹配70种胞内代谢物,通过PCA和PLS分析,最终确定了21种已知的胞内代谢物与阿维菌素的生物合成密切相关。其中乳酸、丙酮酸、琥珀酸、苏氨酸、异亮氨酸、缬氨酸和油脂类物质对阿维菌素的产量影响较为显著。通过单独或组合优化添加这些前体,阿维菌素的产量从5.36 g/L提高到了5.92 g/L,增加了10.4%。【结论】基于比较代谢组学分析的理性优化培养基的方法可有效提高阿维菌素的产量,并为提高当下生物基产品的产量提供了新思路。
- 曹鹏胡栋张君张变强高强
- 关键词：阿维链霉菌阿维菌素代谢组学
- 阿维菌素生产菌的常压室温等离子体诱变育种及培养基优化被引量：19
- 2017年
- 【目的】通过诱变筛选技术选育阿维菌素高产突变株,对其发酵培养基进行响应面优化,提高阿维菌素产量。【方法】采用常压室温等离子体(ARTP)诱变技术,结合链霉抗性和卡那霉素抗性筛选法及96深孔板高通量筛选法,筛选阿维菌素高产株。在单因素实验的基础上,应用响应面分析法对其发酵培养基进行优化,最后确定最佳培养基配方。【结果】获得一株遗传性状稳定的阿维菌素高产株K-1A6,其阿维菌素产量达到4.22 g/L,比出发菌株9-39提高了23.4%,在最佳培养基中阿维菌素产量达到5.36 g/L,较优化前提高了27.01%。【结论】通过对阿维链霉菌9-39菌株进行ARTP诱变筛选及发酵培养基优化研究能显著提高阿维菌素的产量。
- 田萍萍曹鹏常传友胡栋张健高强
- 关键词：阿维菌素抗性筛选响应面分析法
- 晶粒尺寸对γ-TiAl合金力学性能影响的纳米压痕研究被引量：1
- 2021年
- 为研究纳米压痕过程中晶粒尺寸对γ-Ti Al合金力学性能及变形行为的影响,利用Voronoi方法建立多晶γ-Ti Al模型,采用分子动力学方法模拟压头压入不同晶粒尺寸模型的压痕过程,得到相应尺寸下的载荷-深度曲线,并计算了7种晶粒尺寸下γ-Ti Al的硬度。结果表明:当晶粒尺寸小于9.9 nm时,晶粒尺寸与硬度表现出反Hall-Petch关系,位错和晶界活动共同促使材料发生塑性变形,晶界活动起主导作用。当晶粒尺寸大于9.9 nm时,晶粒尺寸与硬度符合Hall-Petch关系,晶界对材料变形影响较小,位错主导基体发生塑性变形。另外,分析了γ-Ti Al在压痕过程中的应力传递和形变恢复过程,发现致密晶界网格结构能够有效抑制压痕缺陷及内应力向材料内部传递;晶粒尺寸越小,压头下方的内应力分布越均匀,沿压痕方向的弹性恢复比越小。
- 曹鹏曹鹏芮执元付蓉剡昌锋曹卉
- 关键词：晶粒尺寸Γ-TIAL纳米压痕力学性能分子动力学模拟
