肖玉梅
- 作品数:2 被引量:7H指数:2
- 供职机构:苏州大学更多>>
- 发文基金:苏州市科技计划项目(应用基础研究计划)更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 基因芯片法对苏州市结核临床分离株RFP耐药性快速检测价值的研究被引量:3
- 2013年
- 目的通过基因芯片法检测结核分离株RFP的耐药性,为在临床诊断中利用该法快速鉴别苏州市结核RFP耐药菌株的可靠性奠定基础。方法收集痰液标本45例,利用罗氏固体培养法(金标准)对结核分枝杆菌进行传统药敏试验;利用晶芯结核分枝杆菌耐药检测试剂盒及相关仪器通过核酸提取、PCR扩增、芯片杂交和芯片扫描,对结核分枝杆菌RFP耐药相关基因rpoB的rpoB-RRDR 511,513,516,526,531和533位点进行检测,将基因芯片检测获得的RFP药敏判读结果与金标准法获得的结果进行比较分析;将17例经基因芯片检测过的菌株用PCR法扩增包含rpoB-RRDR的基因片段,经纯化后进行DNA直接测序,将基因芯片对rpoB-RRDR 526,531位点的检测结果与DNA测序获得的结果进行比较分析。结果与金标准法相比,基因芯片法对菌株RFP药敏检测的准确率为93.3%(42/45);与DNA测序法相比,基因芯片法对rpoB-RRDR 526,531位点突变型检测的准确率为82.4%(14/17)。结论 rpoB-RRDR 526,531位点突变是导致苏州市结核病RFP耐药的主要因素,通过基因芯片法对rpoB基因相关位点的检测可为临床对RFP耐药结核鉴定提供一种快速、准确和批量性的检测手段,具有极大的应用价值。
- 叶志坚唐佩军沈兴华吴妹英肖玉梅
- 关键词:基因芯片利福平耐药DNA测序
- 基因芯片法对苏州市结核临床分离株INH耐药性快速检测的价值被引量:4
- 2013年
- 目的 评价基因芯片法检测INH耐药结核分离株的临床价值,为利用该法快速鉴别苏州市结核INH耐药菌株的可靠性奠定基础.方法 从苏州大学附属传染病医院肺结核科就诊的患者收集痰液标本,罗氏固体培养法(金标准)对结核分枝杆菌进行传统药敏试验;根据药敏试验结果采用数字表法随机抽取INH耐药和敏感菌株各21例,利用晶芯( )结核分枝杆菌耐药检测试剂盒及相关仪器,通过核酸提取、PCR扩增、芯片杂交和芯片扫描,分别对结核分枝杆菌INH耐药相关基因katG315、inhA-15位点进行检测,将获得的INH药敏判读结果与金标准法进行比较分析;从经基因芯片检测过的菌株中采用数字表法随机抽取18例,用PCR法扩增包含315位点在内的katG基因片段,经纯化后进行DNA直接测序,将基因芯片对katG315位点的检测结果与此法进行比较分析.结果 以罗氏固体培养法获得的INH耐药结果为标准,基因芯片法对菌株INH药敏检测的准确率为73.8%(31/42);以DNA测序结果为标准,基因芯片法对katG315突变型(AGC→ACC)检测的准确率为88.9%(16/18).结论 大多数结核分枝杆菌耐INH是由于katG315、inhA-15基因突变所致,采用基因芯片技术可以快速、准确、大规模地确定结核分枝杆菌INH耐药突变的部位和性质,其在苏州市地区对结核分枝杆菌的快速和灵敏检测具有极大的应用价值.
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- 关键词:寡核苷酸序列分析异烟肼