吴允 作品数:15 被引量:36 H指数:4 供职机构: 扬州大学动物科学与技术学院 更多>> 发文基金: 国家科技支撑计划 江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 农业科学 轻工技术与工程 更多>>
不同品种鸡BTN1基因序列差异分析 被引量:1 2019年 【目的】BTN1基因位于MHC家族的BF/BL核心区域,研究其SNPs和InDels对提高鸡抗病性有重要意义.【方法】以NCBI中Gallus gallus BTN1基因序列为参照,利用MEGA6.06软件对26个品种鸡的BTN1基因序列比较分析,筛选出与抗病性有关的InDels、SNPs和氨基酸变化,并对26个品种鸡的BTN1基因序列进行聚类分析.【结果】在Exon5和Exon17上各有1个SNPs位点,且为错义突变.SNPs位点主要发生在Intron10、Intron13、Intron18、Intron22和Intron23上.‘雪山草鸡’和‘安卡红鸡’等抗病性强、适应性强的品种鸡在Exon17上发生错义突变;与抗病性较强的‘安卡红鸡’相比,‘来航鸡’在Exon5上存在一个错义突变.【结论】BTN1的Exon5和Exon17上SNPs位点对抗病性具有一定的影响,为家禽的抗病育种研究提供参考依据. 陈颖 郑圣晗 孔令琳 朱鹏飞 吴允 郭其新 陈国宏 常国斌关键词:抗病性 SNPS INDELS 中国部分鸡种B-G基因SNP和Indel 被引量:5 2016年 鸡的MHC基因家族中B-G基因与鸡抗病性有关,通过研究与抗病有关的B-G基因的多态性可以从根本上提高鸡抵抗疾病的能力,进而为抗病育种奠定基础。试验对25个鸡种基因组DNA进行目标捕获测序,以NCBI中Gallus gallus的B-G基因序列为参考,利用MEGA6软件进行不同鸡种基因序列比对,分析B-G基因外显子和内含子中的SNPs和Indels以及氨基酸的变化,最后制作进化树。结果表明,25个鸡种中外显子存在8个SNPs、19个Indels,内含子有67个SNPs、327个Indels;同时氨基酸序列也呈现出相应的多态性,中国地方鸡种也表现出丰富的遗传多样性。来航鸡、仙居鸡、隐性白羽鸡的B-G基因存在丰富的多态性;来航鸡在进化树上单独为一类,藏鸡、文昌鸡由于地理位置因素也分别为单独一类;现代肉鸡中罗斯与隐性白羽鸡聚为一类;不同类型的中国地方鸡种间同源性较小。中国地方鸡种B-G基因存在多源性进化以及丰富的遗传多样性,进而产生抗病性差异。 吴允 毕榆林 张扬 郭晓敏 李志腾 万方 朱鹏飞 徐璐 常国斌 徐琪 陈国宏关键词:SNPS INDELS 进化树 不同鸡种DMA基因序列比较分析 2017年 DMA(major histocompatibility complex,classⅡ,DM alpha)基因是鸡MHCⅡ类典型基因座,与免疫反应和抗病性密切相关。试验对25个不同鸡种的DMA基因序列进行目标捕获测序,以NCBI上Gallus gallus的DMA基因序列作为参考序列,通过MEGA6软件进行序列比对分析,筛选出不同鸡种DMA基因序列上的SNPs和Indels(insertion-deletion)位点以及氨基酸的变化,并根据基因序列的差异构建系统进化树,探究不同鸡种间的同源性。结果表明,DMA基因呈现出丰富的多态性,突变和缺失位点集中于外显子上,且多个鸡种在第2外显子发生多位碱基缺失,导致其氨基酸序列发生极大改变,可能是不同鸡种产生抗性差异的主要因素;同时进化树也显示,斗鸡、藏鸡等抗性较好的鸡种间有相近的亲缘关系,同源性较高。以上结果表明,DMA基因有丰富的遗传多样性,且与不同鸡种的先天免疫与抗病特性差异相关,第2外显子中94 496~94552的Indels可以作为鸡免疫特性的候选标记。 孔令琳 郑圣晗 陈颖 朱鹏飞 吴允 郭其新 陈国宏 常国斌关键词:MHC SNPS INDELS 进化树 鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析 被引量:1 2016年 为了研究鸡TGF-β2基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用PCR-SSCP方法对16个鸡种的TGF-β2启动子区的554~824 bp(即3号染色体的19 433 476~19 433 746 bp)进行基因分型,经测序,共检测到3个有效的SNPs位点,分别是679位点的C/G,699位点的G/A,774位点的T/C。其中大骨鸡和太湖鸡在3个位点均检测到SNP存在,AA鸡在3个位点都没有发现SNPs。分别利用生物信息学软件JASPAR和Meth Primer预测TGF-β2基因启动子区转录因子结合位点和Cp G岛,发现SNP位点可改变转录因子结合位点且位于Cp G岛上,表明TGF-β2启动子区SNPs可能通过不同方式影响基因表达调控。 鲁伟 吴允 徐璐 徐琪 常国斌 陈国宏关键词:TGF-Β2 启动子 SNP 不同鸡品种BNK基因序列比较分析 BNK(C-type lectin-like receptor2)基因为C型凝结素受体基因中的抑制性基因,与禽类先天免疫性能关系密切.本研究以NCBI中Gallus gallus BNK基因序列为参考,利用MEGA6软件... 陈颖 郑圣晗 孔令琳 朱鹏飞 吴允 郭其新 陈国宏 常国斌关键词:品种资源 鸭PMEL17基因多态性与羽色性状相关性研究 被引量:6 2018年 为了探讨PMEL17基因对鸭羽色遗传性状的影响,试验以樱桃谷鸭(父本)和凤头白羽鸭(母本)的杂交F1代个体为样本,对PMEL17基因外显子进行PCR扩增并直接测序,利用生物信息学软件进行多态性分析,并与羽色进行关联。结果表明:在PMEL17基因编码区发现5个多态位点1904(C/G)、1961(T/C)、2102(C/T)、2110(G/A)和2143(A/G)的碱基突变引起了氨基酸的变化。群体遗传学分析显示,1904(C/G)、2102(C/T)、2110(G/A)和2143(A/G)位点表现为中度多态(0.250.05)。关联分析表明,PMEL17基因1904(C/G)、1961(T/C)和2143(A/G)位点基因型分布与鸭羽色具有显著或极显著差异(P<0.05或P<0.01),由此推测PMEL17基因与鸭羽色性状具有一定的关联性。研究结果为后期的育种工作提供了一定的理论基础。 姚文成 王统苗 吴允 张扬 常国斌 陈国宏关键词:多态性 羽色 不同鸡种BF2基因序列比较分析 被引量:3 2018年 利用目标区域捕获测序技术对BF2(Major histocompatibility complex class I antigen BF2)基因进行序列测定,找出不同鸡种BF2基因序列上的差异。以NCBI网站上Gallus_gallus-5.0的BF2基因序列为参照标准。利用MEGA6.06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和Indel位点,并构建系统进化树进行分析。结果表明:在BF2第2、3外显子上分别存在22和31个有义突变,占BF2基因全部有义突变的78%,表明BF2基因的第2、3外显子起重要作用且拥有丰富的多态性。第5、6、7外显子属于保守区域。25个鸡种大致可被分为3大类:鹿苑鸡、如皋黄鸡、溧阳鸡和太湖鸡等聚为一类;罗斯鸡和隐性白羽肉鸡等聚为一类;雪山鸡和广西黄鸡等聚为一类。表明中国地方鸡品种间的同源性较小,BF2基因在不同鸡种上具有丰富的遗传多样性,在第2外显子上C/T突变和第3外显子上A/C突变可作为BF2基因有关抗病的候选SNPs位点。 郑圣晗 陈颖 孔令琳 吴允 郭其新 陈国宏 常国斌关键词:进化树 基于生物发光法检测冰鲜鸡新鲜度的初步研究 被引量:2 2016年 为了对市场上出售的冰鲜鸡进行新鲜度等级划分,研究利用生物发光法,快速检测屠宰后4、8、12、24、48、72 h的鸡胸、腿肉中ATP含量,并以此为标准将肉品新鲜度划分成不同等级。结果表明,鸡肉中ATP含量随屠宰后时间延长而不断下降,直至为零。其中,屠宰后12和24 h有小幅波动,基本符合生物体ATP降解规律。根据屠宰后不同时间鸡肉中ATP含量,将1~4 h(ATP含量大于1.00×10^(-8)mol/g)上市的鸡肉定为一级鲜品,4~24 h(ATP含量为1.00×10^(-11)~9.99×10^(-8)mol/g)内的鸡肉定义为二级鲜品,24~72 h(ATP含量为1.00×10^(-12)~9.99×10^(-11)mol/g)内的鸡肉定为三级鲜品,72 h以后(ATP含量小于1.00×10^(-12)mol/g)的鸡肉定为冻品。 鲁伟 吴允 任立辰 郭其新 朱鹏飞 张扬 张康宁 袁青妍 许盛海 徐琪 赵文明 常国斌 陈国宏关键词:冰鲜鸡 ATP 新鲜度 不同品种与产蛋日龄对鸡蛋品质的影响分析 被引量:7 2018年 为研究品种和产蛋日龄对蛋品质的影响,随机抽取苏禽绿壳蛋鸡(160日龄)、苏禽绿壳蛋鸡(300日龄)、东台花凤鸡(300日龄)、农大3号(300日龄)、海兰褐壳蛋鸡(300日龄)的蛋各30个,进行蛋品质测定。结果显示:在不同日龄中,苏禽绿壳蛋鸡(300日龄)蛋壳强度和胆固醇含量显著高于苏禽绿壳蛋鸡(160日龄)(P<0.05),其他指标无显著性差异(P>0.05);不同品种间蛋白比率、蛋黄比率、蛋壳强度、蛋壳厚度、哈氏单位存在一定差异,其中海兰褐壳蛋鸡(300日龄)的蛋白比率和蛋壳强度高于其他三种鸡;苏禽绿壳蛋鸡(300日龄)的蛋壳强度显著高于苏禽绿壳蛋鸡(160日龄)(P<0.05),而蛋黄比率无显著性差异(P>0.05),且在不同品种间含量最高,海兰褐壳蛋鸡含量最低;海兰褐壳蛋鸡和东台花凤鸡的哈氏单位以及蛋白高度显著高于其他两个品种(P<0.05)。 王伟 陈博雯 仲黎 吴允 张莘 刘本帅 王统苗 常国斌 陈国宏关键词:产蛋日龄 蛋品质 胆固醇 雪山黄鸡屠宰性能与肉品质测定及相关分析 被引量:7 2016年 以雪山黄鸡为研究对象,测定其屠宰性能、皮肤厚度、毛孔密度、直径和肉品质相关指标。结果显示:背部与腹部在毛孔密度、直径与皮肤厚度存在显著差异(P<0.05),不同性别之间相同部位的毛孔密度、直径也存在显著差异(P<0.05)。公鸡和母鸡的屠宰率差异不显著(P>0.05),但母鸡体重和胸肌率显著高于公鸡(P<0.05),而全净膛率和腿肌率显著低于公鸡(P<0.05)。公、母鸡腿肌的剪切力、pH和脂肪含量显著高于胸肌(P<0.05),但同一部位仅有pH在公母之间存在显著差异(P<0.05)。公、母鸡胸肌的失水率、蛋白含量显著高于腿肌(P<0.05),但相同部位在公母之间没有显著差异(P>0.05)。表明雪山黄鸡羽毛密度紧凑、屠宰性能与肌肉品质良好,适于冰鲜鸡加工,有利于其在市场的推广。 鲁伟 吴允 郭其新 朱鹏飞 常国斌 张康宁 袁青妍 许盛海 武玮 陈国宏关键词:屠宰性能 肉品质