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不同条件下诱导甘薯开花的比较转录组分析: 已有研究发现，甘薯在北纬35度以北的大部分地区常常不能自然开花，需要借助干旱胁迫或嫁接近缘物种等方法来诱导其开花.成功诱导开花以后，就更容易培育出高产、抗病和高淀粉含量的甘薯品种.本研究利用甘薯嫁接牵牛诱导其开花，诱导开...; 魏昌赫贺斌颜朗谭雪梅张义正; 关键词：甘薯转录组嫁接基因表达功能注释

甘薯‘徐薯18’转录组分析被引量：4: 2017年; ‘徐薯18’是我国种植时间长和区域广的甘薯品种,该品种的转录组数据库构建及其重要基因的挖掘,对于甘薯遗传多样性分析和分子育种都具有重要意义。本文综述了我们近年来对‘徐薯18’转录组的研究进展,包括利用第2代和第3代测序技术构建‘徐薯18’全长转录组数据库,从转录组数据库中挖掘重要的功能基因以及分析它们的表达等,并展望了未来甘薯转录组研究的发展方向。; 颜朗魏昌赫张义正; 关键词：甘薯转录组基因挖掘基因表达

甘薯非生物胁迫抗性相关基因组织间差异表达分析: 甘薯是世界上第七大粮食作物，产量高、营养丰富、环境适应性极强，能在干旱贫瘠的土地上种植。随着土壤及环境的恶化，大量非生物胁迫因素如干旱、盐、重金属、氧化压力等对植物生长和发育带来了不良影响。然而，甘薯自身表现出的抗逆特性...; 吴燕颜朗李雪丹张义正; 关键词：甘薯非生物胁迫抗性基因

甘薯基因组概览分析及重要功能基因挖掘: 甘薯[Ipomoea batatas(L.) Lam]是世界第7大粮食作物,它高产稳产、营养丰富且环境适应性极强,能够种植于干旱贫瘠土壤,投入产出比高且用途广泛,是一种重要的粮食、饲料和工业原料作物.甘薯栽培品种是6倍体...; 颜朗李雪丹吴燕张义正; 关键词：甘薯基因组功能注释

甘薯基因共表达网络的构建及诱导开花基因表达分析: 甘薯(Ipomoea batatas)种内有性杂交是培育甘薯高产优质新品种的有效途径,然而甘薯在北纬35℃以北的大部分地区自然条件下不能开花或存在花朵易脱落、花而不实等现象,严重限制了甘薯杂交制种的效率。本研究借助干旱胁...; 颜朗魏昌赫清源尹福强张义正; 关键词：甘薯诱导开花干旱

皇竹草转录组分析揭示其抗冻特性被引量：5: 2017年; 皇竹草是一种高产、优质牧草,但因耐寒性较差而极大限制了其在我国大面积种植和推广.选择在冬季平均温度接近皇竹草耐寒极限温度的四川地区进行了5年自然驯化,筛选在最低温度-5℃下能够自然过冬的样本,并在冬季最低温度下和夏季最高温度下分别取样进行转录组测序,挖掘皇竹草本身具有的耐寒、抗冻基因.结果显示:皇竹草转录组共有转录本125 467条,注释转录本65 633条,注释信息及邻近分析显示皇竹草与小米、玉米高度同源.冬夏两季皇竹草比较转录组分析共计筛选差异表达基因11 443个,其中冬季相对于夏季表达量上调基因6 943个,下调基因4 500个,差异显著.在以上差异表达基因中,共计挖掘在冬季低温条件下高度表达的抗冻基因112个,且有17个抗冻基因在冬季样品中特异表达.随机选取6个差异表达的抗冻基因进行荧光定量PCR实验验证,结果显示与预测转录本表达量一致.本研究对皇竹草进行了转录组测序并通过比较转录组的方法挖掘其在自然驯化条件下成功越冬样本中的抗冻基因,有利于揭示皇竹草冷适应下的抗性机制,同时也有助于热带引种植物分子育种的开展.; 颜朗吴燕陈鼎谭雪梅张义正; 关键词：皇竹草抗冻基因基因差异表达

甘薯耐旱和耐盐基因的挖掘和表达分析被引量：8: 2016年; 甘薯是世界第7大粮食作物,具有产量高、营养丰富、耐干旱和盐碱等优点.通过转录组学方法,基于国内3个甘薯品种的综合转录组数据库中进行耐旱和耐盐相关转录本序列的挖掘,共获得238个转录本,随机选取9条具有全长编码序列的转录本进行PCR扩增、克隆和测序后,测定序列与组装序列相似度均高于98%,表明转录本序列是可靠的.分析这些转录本在不同甘薯品种间的表达水平时发现,耐旱基因在京薯6号中表达量普遍较高,而在徐薯18中则普遍偏低,而耐盐相关基因的差异表达模式却与之相反.利用数字基因表达谱数据进一步分析耐旱和耐盐基因在徐薯18的6个组织或生长发育阶段中的差异和特异表达,结果显示:耐旱和耐盐基因在成熟叶和膨大期块根中相对于其他组织具有高表达且差异显著.采用荧光定量PCR方法验证结果表明,耐旱和耐盐基因在徐薯18不同组织器官或发育阶段表达情况与数字基因表达谱分析结果基本一致.; 吴燕颜朗李雪丹谭雪梅张义正; 关键词：甘薯转录组耐旱基因耐盐基因基因表达

基于转录组的甘薯转座元件搜寻及转座酶基因表达分析: 甘薯是旋花科番薯属的6倍体植物，主要进行无性繁殖。因其基因组大和遗传结构复杂，它是如何在无性繁殖过程中产生适应环境变化的后代的遗传机制还有待研究。转座子是真核生物基因组的重要组成部分，它的转座导致的基因组改变，提高了物种...; 颜朗曹庆华张义正王海燕; 关键词：甘薯转座子表达活性

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颜朗