李雪丹
- 作品数：5 被引量：8H指数：1
- 供职机构：四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析（英文）
- 2016年
- 非特异脂质转移蛋白(ns LTP)是植物界普遍存在的一类涉及多种胁迫反应的可溶性蛋白。为了阐明甘薯中非特异性脂质转移蛋白基因IbLTP1和IbLTP2在盐胁迫反应中的功能,本研究运用PCR技术,对IbLTP1和IbLTP2基因进行了克隆,并通过生物信息学方法分析了序列结构、蛋白质保守结构域和系统进化关系;利用q RT-PCR方法检测了这两个基因在不同组织中的表达模式以及盐胁迫条件下的表达差异;将IbLTP1和IbLTP2基因克隆到大肠杆菌的原核表达载体p ET32a中,对重组菌BL21(p ET32a-LTP)的耐盐性进行分析。序列分析表明:IbLTP1和IbLTP2编码区均不含内含子并都具有等位基因。IbLTP1和IbLTP2基因的蛋白质序列分别包括114和94个氨基酸残基并且不含色氨酸残基,蛋白序列N端含有信号肽序列。保守结构域和系统进化分析结果表明:IbLTP1和IbLTP2均含有ns LTP蛋白的保守结构域,IbLTP1属于TypeⅠ而IbLTP2属于TypeⅡ。实时荧光定量PCR分析表明:IbLTP1在幼叶中表达量最高,根中表达量最低;而IbLTP2在茎中表达量最高,成熟叶中表达量最低。在Na Cl胁迫条件下,IbLTP1和IbLTP2表达量在根中基本无变化而在茎和叶中上调。大肠杆菌BL21(DE3)中异源表达IbLTP1和IbLTP2基因能够提高转基因菌株对Na Cl的耐受性。因此,本研究推测IbLTP1和IbLTP2基因可能在甘薯盐胁迫反应中发挥了作用。
- 李雪丹魏昌赫邵欢欢吴燕张义正王海燕
- 关键词：甘薯非特异性脂质转移蛋白氯化钠胁迫基因克隆实时荧光定量PCR
- 甘薯非生物胁迫抗性相关基因组织间差异表达分析
- 甘薯是世界上第七大粮食作物，产量高、营养丰富、环境适应性极强，能在干旱贫瘠的土地上种植。随着土壤及环境的恶化，大量非生物胁迫因素如干旱、盐、重金属、氧化压力等对植物生长和发育带来了不良影响。然而，甘薯自身表现出的抗逆特性...
- 吴燕颜朗李雪丹张义正
- 关键词：甘薯非生物胁迫抗性基因
- 甘薯基因组概览分析及重要功能基因挖掘
- 甘薯[Ipomoea batatas(L.) Lam]是世界第7大粮食作物,它高产稳产、营养丰富且环境适应性极强,能够种植于干旱贫瘠土壤,投入产出比高且用途广泛,是一种重要的粮食、饲料和工业原料作物.甘薯栽培品种是6倍体...
- 颜朗李雪丹吴燕张义正
- 关键词：甘薯基因组功能注释
- 甘薯耐旱和耐盐基因的挖掘和表达分析被引量：8
- 2016年
- 甘薯是世界第7大粮食作物,具有产量高、营养丰富、耐干旱和盐碱等优点.通过转录组学方法,基于国内3个甘薯品种的综合转录组数据库中进行耐旱和耐盐相关转录本序列的挖掘,共获得238个转录本,随机选取9条具有全长编码序列的转录本进行PCR扩增、克隆和测序后,测定序列与组装序列相似度均高于98%,表明转录本序列是可靠的.分析这些转录本在不同甘薯品种间的表达水平时发现,耐旱基因在京薯6号中表达量普遍较高,而在徐薯18中则普遍偏低,而耐盐相关基因的差异表达模式却与之相反.利用数字基因表达谱数据进一步分析耐旱和耐盐基因在徐薯18的6个组织或生长发育阶段中的差异和特异表达,结果显示:耐旱和耐盐基因在成熟叶和膨大期块根中相对于其他组织具有高表达且差异显著.采用荧光定量PCR方法验证结果表明,耐旱和耐盐基因在徐薯18不同组织器官或发育阶段表达情况与数字基因表达谱分析结果基本一致.
- 吴燕颜朗李雪丹谭雪梅张义正
- 关键词：甘薯转录组耐旱基因耐盐基因基因表达
- 甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆与表达分析
- 非特异性脂质转移蛋白(nonspecific lipid transfer protein,nsLTP)是植物体普遍存在的一类分子量小(通常6.5-10.5 kDa)、碱性(pI通常为8.5-12)、表达量高、涉及多种胁...
- 李雪丹吴燕张义正
- 关键词：甘薯非特异性脂质转移蛋白基因克隆基因表达
