谭洁
- 作品数：8 被引量：0H指数：0
- 供职机构：北京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：文化科学自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 噬菌体宿主属预测方法、装置、设备及存储介质
- 本申请提供了一种噬菌体宿主属预测方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。能够根据噬菌体的短序列片段，直接预测噬菌体的宿主属。本申请构建了第一预设模型和第二预设模型，第一预设模型针对待检测噬菌体片段与每个候选宿主...
- 朱怀球谭洁方臻成吴姝芳郭倩江小青
- 文献传递
- 病毒分类方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质
- 本发明实施例提供了一种病毒分类方法、装置、电子设备及计算机可读存储介质，本发明实施例中，以3‑mer的形式从目标DNA序列中按照顺序提取三联体核苷酸集合，再利用距离依赖函数确定该三联体核苷酸集合对应的距离依赖矩阵。从而利...
- 朱怀球尹衡闯吴姝芳谭洁江小青郭倩
- 噬菌体宿主属预测方法、装置、设备及存储介质
- 本申请提供了一种噬菌体宿主属预测方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。能够根据噬菌体的短序列片段，直接预测噬菌体的宿主属。本申请构建了第一预设模型和第二预设模型，第一预设模型针对待检测噬菌体片段与每个候选宿主...
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- 肠道病毒组学数据挖掘与分析方法的进展及挑战
- 2023年
- 肠道病毒对肠道微生物群系的种群结构、细菌性状乃至人体健康都有十分重要的影响,但相比肠道细菌,人们对其的研究和了解仍然很缺乏.高通量测序技术以及机器学习、深度学习等方法的快速发展,为从组学途径深入研究肠道病毒提供了契机.本文针对当前肠道病毒组学领域以噬菌体、真核病毒等为对象的高通量数据,总结并分析了近年来数据挖掘和分析的共性方法和技术的发展,梳理了一系列相关的生物信息学方法和技术,其中大多适用于基于宏基因组或宏病毒组两种策略的病毒组学分析.同时,针对目前实际生物学问题和临床问题的复杂性,人工智能方法在生物信息学领域的广泛运用,以及未来三代测序技术可能的广泛使用,讨论了病毒组学数据挖掘与数据分析方法面临的问题和挑战.
- 江小青李墨尹衡闯郭倩谭洁吴姝芳王春晖朱怀球
- 关键词：宏基因组数据挖掘
- 一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质
- 本申请提供了一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。本申请将从噬菌体全基因组数据提取出的短序列样本进行独热编码，直接使用碱基信息训练预先构建的深度神经网络，得到能够基于短序列信息，鉴定噬菌体属于温...
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- 文献传递
- 基于深度学习的宏基因组噬菌体与质粒序列片段识别算法
- 目的:实现第一个能在宏基因组高通量测序数据中同时鉴定源于噬菌体和质粒DNA片段的算法PPR-Meta,有助于人们对微生物复杂群落结构的理解以及可移动遗传原件和水平基因转移的研究。方法:首先运用"独热"编码方式作为数学模型...
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- 关键词：宏基因组水平基因转移噬菌体质粒
- 文献传递
- 地铁事故人身损害赔偿责任初探
- 地铁担负着城市化发展的重任，面临着发展与安全、成本与效益、救济与预防的冲突。其安全性、公共性和现阶段发展的不成熟状况，使得地铁不适宜作为“高度危险”适用无过错责任。“高速运输工具”的无过错责任很可能对新技术发展造成阻碍。...
- 谭洁
- 关键词：地铁事故人身损害赔偿经济责任法律适用
- 一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质
- 本申请提供了一种噬菌体分类方法、装置、设备及存储介质，涉及生物测序技术领域。本申请将从噬菌体全基因组数据提取出的短序列样本进行独热编码，直接使用碱基信息训练预先构建的深度神经网络，得到能够基于短序列信息，鉴定噬菌体属于温...
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