杨琼
- 作品数:12 被引量:11H指数:2
- 供职机构:中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制TWIST1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的TWIST1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
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- 一种特异性抑制CTGF基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制CTGF基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的CTGF靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用于CTG...
- 方向东赵华李永君杨琼彭四娥
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- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
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- miRNA调控恶性黑色素瘤细胞上皮-间充质转化的分子网络及机制被引量:9
- 2015年
- 黑色素瘤是一种极易发生转移的恶性皮肤肿瘤,具有高度的致死性。上皮–间充质细胞转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)在胚胎发育过程中起到非常重要的作用,同时在肿瘤的发生和恶化过程中也扮演着重要的角色。mi RNA具有广谱的调节能力,对于肿瘤发生和EMT形成都能产生不同程度的影响。本文整合黑色素瘤细胞系转录组和mi RNA组测序数据,在转录组数据中筛选得到参与肿瘤EMT过程的基因,通过Mirsystem软件预测并从mi RNA组数据中筛选出与之负相关的11个mi RNA,包括mi R-130a-3p、mi R-130b-3p、mi R-125a-5p、mi R-30a-3p、mi R-195-5p、mi R-345-5p、mi R-509-3-5p、mi R-374a-5p、mi R-509-5p、mi R-148a-3p和mi R-330-3p。经过生物信息学分析mi RNA靶基因富集的分子网络和信号途径,发现了两个与细胞发育和细胞间相互作用密切相关的网络,以及多个参与调控EMT过程的信号通路。对11个mi RNA进行分子生物学验证,发现mi R-195-5p、mi R-130a-3p、mi R-509-5p和mi R-509-3-5p共4个可以调节重要肿瘤基因的mi RNA。本研究运用m RNA和mi RNA两种转录组的测序数据筛选EMT相关mi RNA的方法,为肿瘤多组学数据整合分析提供了新的研究思路,并以期能为肿瘤精准基因组学的发展发挥重要的推进作用。
- 王冬李永君丁楠王均云杨琼杨雅冉李艳明方向东赵华
- 关键词:转录组
- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ ID NO.3所示,其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
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- 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制TWIST1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的TWIST1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
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- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
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- 一种特异性抑制TWIST1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制TWIST1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的TWIST1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
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- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ?ID?NO.1-2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ?ID?NO.3所示,其通过作用...
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- MAGEA1通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进恶性黑色素瘤的转移被引量:2
- 2021年
- 背景恶性黑色素瘤是源自黑色素细胞的恶性肿瘤,恶性程度高。其中转移性黑色素瘤患者的5年生存率不足10%,且发病率逐渐增加。黑色素瘤相关抗原家族A1(melanoma associated antigen family A1,MAGEA1)是MAGE-A基因亚家族的成员,在多种恶性肿瘤中均有表达,但其在恶性黑色素瘤中的表达和作用机制尚不明确。目的探讨MAGEA1促进恶性黑色素瘤转移的信号通路,并进行验证。方法通过黑色素瘤细胞系A375与A2058的RNA-Seq数据分析,确定MAGEA1正向调控Wnt/β-catenin信号通路,利用TOP/FOP、免疫荧光染色研究通路活性,利用Western blot和qRT-PCR分别在蛋白水平与转录水平验证通路基因的表达情况。结果MAGEA1通过c-Jun激活Wnt/β-catenin信号通路,促进黑色素瘤细胞上皮-间充质转化,提高黑色素瘤细胞的侵袭与迁移能力。结论MAGEA1作为一种与恶性肿瘤转移相关的基因,在恶性黑色素瘤中可通过激活Wnt/β-catenin信号通路促进细胞的转移。
- 许媛媛王晨贺赞王冬杨琼李永君郝永红胡辉莹方向东赵华
- 关键词:恶性黑素瘤WNT/Β-CATENIN信号通路