方向东
- 作品数：55 被引量：378H指数：9
- 供职机构：中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重大科学仪器设备开发专项更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术政治法律更多>>
- 表观遗传学在法医学中的应用研究进展被引量：3
- 2012年
- 表观遗传学指DNA序列无变化的、可遗传的基因表达改变,主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重塑、基因组印记、X染色体失活以及非编码RNA调控等方面。随着研究的深入,表观遗传学逐渐在法医学实践常遇到的特殊问题中发挥作用,如妊娠期胎儿父权的认定、单亲鉴定中亲代必需等位基因的确定、同卵双生子的区分、微量组织来源确定及伪造DNA的鉴定等。本文介绍了表观遗传学的基本概念、研究内容,并对表观遗传学在亲权鉴定、年龄推断、双生子鉴别及组织来源鉴定和死亡时间推断等方面的最新进展进行综述。
- 杨雅冉王鹏翔方向东严江伟
- 关键词：法医遗传学表观遗传学
- 人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA及其应用
- 本发明提供了人脐带血间充质干细胞基因组稳定性相关的miRNA标志物及其检测方法。本发明利用新一代高通量测序技术，结合系统的生物信息学分析方法，筛选获得了与人脐带血间充质干细胞基因组稳定性密切相关的miRNA，其RNA序列...
- 方向东张昭军张倩韩忠朝
- 文献传递
- 牛碱性成纤维细胞生长因子在酵母系统中的表达被引量：2
- 1996年
- 牛碱性成纤维细胞生长因子在酵母系统中的表达方向东陈淳谢志伟耿解萍王小宁戚正武（中国科学院上海生物化学研究所国家分子生物学实验室上海２０００３１）碱性成纤维细胞生长因子（ｂａｓｉｃｆｉｂｒｏｂｌａｓｔｇｒｏｗｔｈｆａｃｔｏｒ，ｂＦＧＦ）是ＦＧＦ家族...
- 方向东陈淳谢志伟耿解萍王小宁戚正武
- 关键词：BOVINEFIBROBLASTFACTORSYEASTGENE
- 基因编辑技术及其在基因治疗中的应用被引量：29
- 2019年
- 基因编辑技术是以特异性改变遗传物质靶向序列为目标的技术。近年来,锌指核酸酶(zinc finger nuclease,ZFN)、类转录激活因子效应核酸酶(transcription activator-like effector nuclease, TALEN)、规律成簇的间隔短回文重复(regular clustering of short palindrome repeats, CRISPR)和单碱基编辑(base editing, BE)技术的相继出现,不仅为基因功能研究提供了有力的工具,还为生命医学提供了新的治疗方案。基因编辑技术已经大范围应用于动物细胞模型的构建、药物靶点的筛查和基因功能研究等,在基因治疗领域也展现出广阔的应用前景。本文就基因编辑技术的研究进展及其在基因治疗中的应用进行了概述,并对基因编辑技术的的原理、发展史、优缺点以及在基因治疗中的应用前景和机遇挑战进行了讨论,以期为基因编辑技术的临床转化提供参考。
- 任云晓肖茹丹娄晓敏方向东
- 关键词：基因治疗
- 转化生物信息学研究前沿及挑战被引量：7
- 2015年
- 得益于高通量测序技术的长足发展,基因组、表观组和转录组等组学数据呈现出了爆炸式的增长,并且这一趋势将随着技术的发展而进一步延续。目前,全世界每年的生物数据产生总量已经高达EB级。如此海量的数据为我们深入了解生物学过程、疾病机理等多方面提供了前所未有的机遇。与此同时,生命科学研究领域的数据分析的挑战也日益严峻,多种不同维度数据的整合分析又使得这一挑战的形势更加急迫和严峻。
- 赵方庆方向东李亦学
- 关键词：生物信息学生物数据测序技术通信工程计算机科学基因组学
- 一种特异性抑制MAGEA1基因表达的小干扰RNA及其应用
- 本发明提供了一种特异性抑制MAGEA1基因的小干扰RNA及其应用。本发明小干扰RNA的正义链和反义链序列分别如SEQ ID NO.1‑2所示。该小干扰RNA干扰的MAGEA1靶序列如SEQ ID NO.3所示，其通过作用...
- 方向东赵华李永君杨琼
- 文献传递
- M5型急性髓系白血病相关的特异miRNA及其应用
- 本发明提供了M5型急性髓系白血病相关的特异miRNA及其应用。本发明利用新一代高通量测序技术，结合系统的生物信息学分析方法，筛选得到与M5型急性髓系白血病相关的特异miRNA，其RNA序列分别如SEQ ID NO.1‑3...
- 方向东张昭军刘金立陈晓娟刘淑阁熊倩王万恒
- 文献传递
- 整合分析多组学数据筛选疾病靶点的精准医学策略被引量：16
- 2015年
- 随着高通量测序技术的不断发展与完善,对于不同层次和类型的生物组学数据的获取及分析方法也日趋成熟与完善。基于单组学数据的疾病研究已经发现了诸多新的疾病相关因子,而整合多组学数据研究疾病靶点的工作方兴未艾。生命体是一个复杂的调控系统,疾病的发生与发展涉及基因变异、表观遗传改变、基因表达异常以及信号通路紊乱等诸多层次的复杂调控机制,利用单一组学数据分析致病因子的局限性愈发显著。通过对多种层次和来源的高通量组学数据的整合分析,系统地研究临床发病机理、确定最佳疾病靶点已经成为精准医学研究的重要发展方向,将为疾病研究提供新的思路,并对疾病的早期诊断、个体化治疗和指导用药等提供新的理论依据。本文详细介绍了基因组、转录组和表观组等系统组学研究在疾病靶点筛选方面出现的新技术手段和研究进展,并对它们之间的整合分析新策略和优势进行了讨论。
- 谢兵兵杨亚东丁楠方向东
- 关键词：基因组转录组
- 精准医疗大数据规范研究与实践
- 精准医疗是以多组学大数据为基础，结合患者临床医疗与健康数据，开展精准的疾病分类及诊断、实现个性化的疾病预防和治疗的全新医学模式。其核心是根据个体的基因和表型特征，早期快速诊断、适时个性化干预、精准有效治疗。目前精准医学研...
- 方向东
- miRNA调控恶性黑色素瘤细胞上皮-间充质转化的分子网络及机制被引量：9
- 2015年
- 黑色素瘤是一种极易发生转移的恶性皮肤肿瘤,具有高度的致死性。上皮–间充质细胞转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)在胚胎发育过程中起到非常重要的作用,同时在肿瘤的发生和恶化过程中也扮演着重要的角色。mi RNA具有广谱的调节能力,对于肿瘤发生和EMT形成都能产生不同程度的影响。本文整合黑色素瘤细胞系转录组和mi RNA组测序数据,在转录组数据中筛选得到参与肿瘤EMT过程的基因,通过Mirsystem软件预测并从mi RNA组数据中筛选出与之负相关的11个mi RNA,包括mi R-130a-3p、mi R-130b-3p、mi R-125a-5p、mi R-30a-3p、mi R-195-5p、mi R-345-5p、mi R-509-3-5p、mi R-374a-5p、mi R-509-5p、mi R-148a-3p和mi R-330-3p。经过生物信息学分析mi RNA靶基因富集的分子网络和信号途径,发现了两个与细胞发育和细胞间相互作用密切相关的网络,以及多个参与调控EMT过程的信号通路。对11个mi RNA进行分子生物学验证,发现mi R-195-5p、mi R-130a-3p、mi R-509-5p和mi R-509-3-5p共4个可以调节重要肿瘤基因的mi RNA。本研究运用m RNA和mi RNA两种转录组的测序数据筛选EMT相关mi RNA的方法,为肿瘤多组学数据整合分析提供了新的研究思路,并以期能为肿瘤精准基因组学的发展发挥重要的推进作用。
- 王冬李永君丁楠王均云杨琼杨雅冉李艳明方向东赵华
- 关键词：转录组
