管翠萍
- 作品数：16 被引量：47H指数：3
- 供职机构：宁夏大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金宁夏回族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 不同中药提取物对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的抑菌作用和逆转机制被引量：19
- 2015年
- 采用(K-B)药敏纸片扩散法检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的药物敏感性,并用二倍稀释法分别测定10种中药提取物对MRSA的最小抑菌浓度(MIC)和最小杀菌浓度(MBC),选取抑菌效果最好的中药提取物(黄芩)通过棋盘法测定其与5种常用抗生素的联合抑菌效果。观察黄芩不同亚抑菌浓度作用下对MRSA耐药性的逆转效果,并通过荧光实时定量PCR法检测耐药基因mec A在mRNA表达水平上的变化。结果表明,MRSA具有多重耐药性,10种中药提取物里黄芩的抑菌和杀菌效果最为显著,MIC和MBC均为156 mg/L,但其与5种抗生素没有显著的联合抗菌作用,在黄芩亚抑菌浓度130 mg/L作用20 h后,MRSA主要耐药基因mec A的表达量下调并恢复了对药物的相对敏感性。
- 管翠萍冯磊乔霞李雪周学章
- 关键词：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌中药提取物耐药基因
- 枸杞花药发育基因LbMS2的克隆及表达分析被引量：3
- 2017年
- MS2(Male sterily2)类基因编码脂肪酰基还原酶,参与了花药绒毡层中脂类代谢过程。该研究以宁夏枸杞(‘宁杞1号’)为试验材料,采用RACE方法从枸杞花药cDNA中获得枸杞LbMS2基因。结果显示,LbMS2基因开放阅读框为1 782bp,编码593个氨基酸,等电点为8.98;生物信息学分析显示,LbMS2蛋白定位于叶绿体;LbMS2蛋白序列与茄科植物矮牵牛、茸毛烟草、马铃薯、番茄以及甜辣椒中的MS2蛋白表现出较高的序列相似性;实时荧光定量PCR结果显示,LbMS2基因具有器官表达特异性,只在枸杞花器官中表达,并且在枸杞花药发育的四分体时期以及单核花粉时期表达量最高。研究表明,LbMS2基因是枸杞花器官发育过程中的重要基因。
- 石晶管翠萍郑蕊王丽娟尹颖陈亮
- 关键词：枸杞花药发育
- 枸杞LbXEGIP1基因的克隆与生物信息学分析被引量：1
- 2018年
- 内切葡聚糖酶抑制蛋白(XEGIP)在植物防御病原菌侵袭中扮演了重要角色。本研究以宁夏枸杞(Lycium barbarum L.)‘宁杞1号’为试验材料,采用RACE技术从枸杞花药cDNA中成功克隆了枸杞的XEGIP1基因,命名为LbXEGIP1,GenBank登录号为MG744343。结合生物信息学方法对LbXEGIP1基因编码的蛋白质进行理化性质、信号肽、亚细胞定位、蛋白结构以及系统进化等方面的预测分析。结果表明,该基因CDS序列全长1 290 bp,编码429个氨基酸,预测蛋白分子量为47.39 kD,等电点为8.59,是一个含有一个跨膜区和信号肽区域,脂溶性的稳定蛋白,它的亚细胞定位于细胞分泌途径中。LbXEGIP1属于天冬氨酸蛋白酶A1亚家族,在其N端和C端分别具有葡聚糖酶抑制子结构域。在其二级结构中无规则卷曲所占比例最高(35.66%),其次是延伸链(30.77%)。系统进化分析表明LbXEGIP1蛋白与甜椒中的XEGIP亲缘关系最近。枸杞XEGIP1基因的克隆及生物信息学分析,为后续研究该基因的功能以及枸杞病虫害的防治方面提供了依据。
- 管翠萍王俊文王丽娟郑蕊石晶
- 关键词：枸杞基因克隆生物信息学分析
- 不同物种支原体的比较基因组学研究
- 2014年
- 为了研究不同物种支原体在进化关系、结构组成以及致病因子三方面所存在的异同,试验采用比较基因组学的方法,分析了不同物种来源的21株支原体的进化关系,并以肺炎支原体为例,对来自三个不同物种(猪、牛、羊)的代表株在基因组的组成结构以及整体相似程度方面进行了横向比较分析,并进一步利用相似性比较对这三个物种代表株进行潜在的毒力因子挖掘。结果表明:三个不同物种的肺炎支原体差异较大;猪肺炎支原体内毒力因子的保守性和特异性都较高,牛支原体和山羊支原体中存在较多相似的毒力因子。说明以不同宿主寄生的致病型支原体结构组成上变异较大,但羊与牛的肺炎支原体在致病机理上可能更为相近。
- 管翠萍石晶徐惠娟王俊林周学章
- 关键词：支原体比较基因组学进化树毒力因子
- 甘草渣黄酮回流提取的工艺优化及预处理方法研究被引量：7
- 2015年
- 通过单因素实验考察了乙醇浓度、温度、时间、固液比对甘草渣中黄酮提取的影响,在此基础上采用正交实验设计L9(34)优化黄酮提取工艺,获得了乙醇回流提取甘草渣中黄酮的最佳条件为:乙醇浓度80%、温度80℃、时间105min、固液比1∶20(g/m L),最佳条件下黄酮得率为37.387mg/g。进一步采用酶法和微生物法分别对甘草渣进行预处理,结果表明,酶法预处理能显著提高黄酮得率,纤维素酶与木聚糖酶协同作用效果最佳;黄孢原毛平革菌处理12d的黄酮得率最高,达45.38mg/g。微生物预处理不但显著提高黄酮得率,而且显著(p<0.05)降低了乙醇浓度和提取温度,缩短了提取时间。此研究对于甘草渣的综合开发和利用具有重要的参考价值。
- 徐春燕张娜韩爱荣管翠萍
- 关键词：总黄酮正交实验
- 产膜表皮葡萄球菌LuxS/AI-2型密度感应系统AI-2的活性及苦参碱对其的影响被引量：3
- 2017年
- 【目的】研究产膜表皮葡萄球菌生物被膜菌和液相浮游菌LuxS/AI-2型密度感应系统中AI-2信号分子的活性及苦参碱对其的影响。【方法】绘制产膜表皮葡萄球菌ATCC35984液相浮游菌及生物被膜菌的生长曲线;利用哈维氏弧菌BB170(Vibrio harveyi BB170)作为报告菌株检测表皮葡萄球菌AI-2信号分子的活性;用荧光定量PCR法检测luxS基因的转录水平;用苦参碱对产膜表皮葡萄球菌ATCC35984进行处理,检测其AI-2信号分子活性的变化情况。【结果】在产膜表皮葡萄球菌液相浮游菌生长过程中,AI-2信号分子与luxS基因的相对表达量都是在对数生长期达到最大值,而后逐渐降低,与液相浮游菌生长曲线基本一致。在产膜表皮葡萄球菌生物被膜菌生长过程中,AI-2信号分子活性曲线与其生物被膜生长曲线变化趋势一致,但luxS基因的相对表达量曲线与生物被膜生长曲线变化趋势相反。中药苦参碱对产膜表皮葡萄球菌液相浮游菌和生物被膜菌AI-2信号分子活性有抑制作用,并且对液相浮游菌AI-2信号分子活性的抑制作用强于生物被膜菌。【结论】AI-2信号分子活性和luxS基因的相对表达量与产膜表皮葡萄球菌生物被膜菌及其液相浮游菌的生长相关;苦参碱能够显著下调产膜表皮葡萄球菌生物被膜菌和液相浮游菌的AI-2信号分子活性。
- 李雪何芳卢金霞管翠萍周学章
- 关键词：苦参碱表皮葡萄球菌LUXS基因
- 枸杞WRKY基因片段克隆与表达分析
- 2013年
- 以枸杞为试材,根据已知物种WRKY转录因子保守片段设计引物,采用RT-PCR方法,克隆枸杞WRKY基因片段,并对所得片段进行序列分析,同时利用Real-time PCR鉴定该基因在枸杞各器官的表达,以了解WRKY转录因子在枸杞中的功能。结果表明:从枸杞果实中获得了467bp的cDNA片段,命名为LbWRKY(GenBank:KF181204)。序列分析表明,该序列含有WRKYGQK保守结构域,与番茄WRKY序列相似性是95%,与烟草wizz相似性是91%,表明已经成功克隆了枸杞WRKY基因片段。Real-time PCR表达分析显示,LbWRKY基因在枸杞果实中表达量最高,在叶中表达水平较低,在根中未检测到其表达。
- 王丽娟高蔚锋管翠萍王彦才
- 关键词：枸杞WRKY转录因子克隆
- G蛋白偶联受体及其特异性偶联预测
- G蛋白偶联受体（G-protein coupled receptor, GPCR）是药物开发史上最有价值的药物靶标,同时也是人体内最大的膜受体蛋白家族,并在细胞信号转导过程中承担着重要的角色。目前估计人类基因组上至少有1...
- 管翠萍
- 关键词：G蛋白偶联受体支持向量机
- 文献传递
- 药物靶标G蛋白偶联受体的识别预测
- 2010年
- 综合利用G蛋白偶联受体(GPCR)的蛋白质序列特征和氨基酸性质,结合支持向量机方法构建分类模型对GPCR蛋白序列进行识别预测。交叉验证结果显示,97%以上的GPCR序列可被正确识别。
- 管翠萍
- 关键词：G蛋白偶联受体支持向量机
- 基于压缩氨基酸和支持向量机进行膜蛋白类型识别
- 2013年
- 膜蛋白是一类结构独特的蛋白质,是细胞执行各种功能的物质基础。根据其在细胞膜上的不同存在方式,主要分为六种类型。本文利用压缩的氨基酸对原始膜蛋白序列进行信息压缩,再对压缩序列进行氨基酸组成和顺序特征的提取,最后采用支持向量机构建分类模型。通过五叠交叉验证的结果表明,该方法对于六种膜蛋白的分类预测,准确度最高可达98%以上,平均预测准确度在85%以上,可有效实现膜蛋白六种类型的划分,为进一步分析膜蛋白的结构和功能奠定基础。
- 管翠萍石晶徐惠娟
- 关键词：膜蛋白支持向量机
