袁媛
- 作品数：6 被引量：19H指数：3
- 供职机构：嘉兴学院数理与信息工程学院更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：理学经济管理医药卫生更多>>
- 基于线性微分方程模型和k-means聚类研究乳腺癌转移相关基因调控通路被引量：3
- 2006年
- 目的通过线性微分方程模型和k-means聚类方法初步探索性研究乳腺癌转移相关基因表达调控通路和预测其生物学意义。方法选择30例伴有淋巴结转移的乳腺癌组织及其相应淋巴结转移癌组织的基因表达谱芯片的比较结果,通过线性微分方程模型和k-means聚类分析乳腺癌转移相关基因表达调控通路。结果比较伴有淋巴结转移的乳腺癌组织和其相应淋巴结转移癌组织,分析筛选了27个表达差异基因,提出GRP基因、BPAG1基因、SFRP2基因间的乳腺癌转移相关调控通路存在的假设。结论初步表明乳腺癌转移的形成是与多基因异常引起基因调控通路异常致使细胞恶性转化相关,利用多种生物信息学手段分析乳腺癌转移相关基因表达调控通路及其生物学意义具有一定的应用价值。
- 孙保存倪春生冯玉梅李晓青沈世镒董骝焕袁媛张亮郝希山
- 关键词：基因表达调控K-MEANS聚类
- 使用线性微分方程构建初步的乳腺癌转移相关基因网络模型被引量：4
- 2007年
- 随着基因芯片的技术的推广,越来越多的表达数据需要被处理和分析．利用这些表达数据提取基因调控矩阵从而构建基因网络是一个重要的问题．通过线性微分方程模型可以初步构建基因网络,了解网络结构,提取最显著的信息．然而由于分子生物学的条件限制或者数据来源的限制,导致实验数据不充分,使方程组无解．本文使用三次样条方法,对26例临床、病理资料完备的具有淋巴结转移的乳腺癌基因表达数据进行插值处理,使表达数据满秩,从而使用最小二乘法解出加权矩阵,构建初步的表达基因调控网络．通过对构建的基因网络的初步分析表明:乳腺癌转移的形成是由多基因异常引起多条传导通路异常,致使细胞恶性转化的结果,这与生物学上公认的看法是相一致的．因此,利用此线性模型方法对基因表达谱进行分析兵有一定可行性,在认识乳腺癌转移机制,乳腺癌诊断和治疗方面具有一定的理论和应用价值．
- 董骝焕袁媛沈世镒孙保存倪春生
- 关键词：基因网络三次样条插值
- 基因芯片表达在乳腺癌转移过程中的聚类分析被引量：1
- 2007年
- 利用基因芯片可以得到不同基因在不同生命过程中的表达,因此在医学诊断与病变分析中受到重视,并开始大量应用.经测定发现,不同基因在病变过程的不同阶段中的表达是不相同的,由此可以得到在病变过程的不同基因的表达特征.在本文中,我们给出了乳腺癌在转移过程中的基因表达特征的聚类分析法分析,并改进了k-means聚类算法,使之具有自动搜索聚类数的功能,并且有助于改善k-means算法的聚类结果陷入局部最小值的状况.通过对平均聚类误差指标的比较,kr-means要优于k-means算法.本文所得到的结果可供乳腺癌诊断与病变分析参考,同时可以应用于小型基因检测芯片的制备,也可以用于构建基因网络调控图.
- 董骝焕袁媛沈世镒孙保存冯玉梅尼春生李晓青
- 关键词：聚类分析
- 工作生活质量对员工绩效的影响被引量：13
- 2006年
- 袁媛王乃苗
- 关键词：工作生活质量员工绩效实证分析人力资源
- 生物序列局部比对的快速算法
- 2006年
- 给出了一个可适用于大规模的、非同源的两两生物基因组序列局部比对的快速比对算法SLA,该算法在运算时间上优于已有的局部比对软件包:chaos．
- 袁媛
- 关键词：基因组
- 基于观测方差的加权Stein估计
- 2007年
- Whittemore(1989)针对在各观测点等误差的情形提出了一种参数估计的方法,其基本思想是:当观测误差来自方差已知的高斯分布时,用带有观测误差的观测样本的Stein估计代替不可观测的协变量的真实值.对于各观测误差的方差不相等的情况,提出了基于观测方差的加权估计方程的概念,并通过数据模拟证明了由加权估计方程解出的估计(记为加权的Stein估计)的优越性.
- 袁媛
- 关键词：EV模型STEIN估计
