赵娟
- 作品数：5 被引量：4H指数：2
- 供职机构：山东交通学院理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山东省高等学校科技计划项目博士科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 抑制剂8CA与脂肪细胞脂肪酸结合蛋白(A-FABP)结合模式的分子动力学研究被引量：1
- 2016年
- 脂肪细胞脂肪酸结合蛋白A-FABP(Adipocyte fatty-acid binding protein)是治疗脂质调节生物过程相关疾病的重要靶标.采用分子动力学模拟和MM-PBSA方法研究抑制剂8CA与A-FABP结合模式,结果表明静电相互作用和范德华作用驱动了抑制剂8CA与A-FABP的结合.基于残基的能量分解表明抑制剂8CA与R126间的极性相互作用为抑制剂与A-FABP的结合提供了重要贡献,该残基与8CA的相互作用较好地稳定了抑制剂与A-FABP复合物的稳定性.期望该研究可为治疗炎症、动脉硬化和代谢病药物设计提供一定的理论指导.
- 尹妍妍梁志强王伟伊长虹李洪云赵娟张庆刚
- 关键词：分子动力学模拟A-FABP
- 分子动力学研究抗体SPE7与抗原Alizarin red的相互作用机制被引量：2
- 2017年
- 研究抗原与抗体的相互作用机制在治疗与抗体相关疾病药物的研发中起到重要作用.采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)以及溶解相互作用能SIE(solvated interaction energy)方法研究了抗原Alizarin red(AZN)与抗体SPE7的结合模式.研究结果证明范德华作用主导了抗原AZN与抗体SPE7的相互作用.基于残基能量分解的计算表明抗原AZN能与残基H-W35、H-Y105、L-Y34和L-W93产生较强的相互作用,此结果表明AZN与SPE7分离残基间的π-π相互作用驱动了AZN与SPE7的结合.期望这个研究能为治疗与抗体相关疾病药物的研发提供重要的理论指导.
- 刘进庆梁志强王伟伊长虹李洪云赵娟张庆刚
- 关键词：分子动力学抗体
- I50V变异对HIV-1蛋白酶抑制剂Amprenavir抗药机制的分子动力学研究被引量：1
- 2017年
- HIV-1蛋白酶PR(HIV-1 protease)的变异对抑制剂产生抗药性,严重消弱抗艾滋病的治疗效果.I50V变异是HIV-1蛋白酶残基变异中最重要的一个.采用分子动力学模拟和溶解相互作用能方法SIE(solvated interaction energy)研究I50V变异对抑制剂APV(amprenavir)抗药机制.分子动力学分析表明I50V变异诱导HIV-1蛋白酶整体柔性的增加,影响了抑制剂与蛋白酶的相互作用.结合自由能计算表明范德华作用的下降驱动了I50V变异对APV的抗药性.基于残基的能量分解证明V50/V50'与APV的相互作用相对于野生型的I50/I50'明显减弱,诱导了抗药性.本研究能为高效的缓解抗药性抑制剂的研发提供一定的理论指导.
- 吴世亮梁志强王伟伊长虹李洪云赵娟
- 关键词：分子动力学模拟抗药性
- 抑制剂Benzamidine与胰岛素作用机制的分子动力学和结合自由能计算研究被引量：2
- 2016年
- 氢键和极性相互作用在抑制剂-蛋白结合专一性识别过程中起到重要作用.抑制剂Benzamidine(BEN)与胰岛素trypsin相互作用机制的阐明有助于胰岛素高效抑制剂的研发.本文采用分子动力学模拟和MM-PBSA(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area)从原子层次上研究BEN与胰岛素的结合模式.结果表明抑制剂BEN的脒基不仅与Asp189的羰基产生静电相互作用,而且与残基Ser190和Gly214形成氢键相互作用.基于残基能量分解的计算表明抑制剂的苯基与残基His58,Cys191,Gln192,Trp211,Gly212和Cys215形成有利于抑制剂结合的疏水性相互作用.期望当前的研究能为胰岛素有效抑制剂的研发提供重要的理论指导.
- 王青梁志强王伟伊长虹李洪云赵娟
- 关键词：分子动力学
- 基于超快电子衍射的飞秒激光加工汽车用铝材超快超精细晶格动力学过程
- 2022年
- 为提高超短脉冲激光加工汽车铝制零部件的质量,通过超快电子衍射系统分析飞秒激光轰击下铝多晶薄膜的电子衍射时间分辨谱(小于40 ps):在亚毫埃米尺度及ps分辨率内,观测铝多晶声子系统热传导耦合过程,得到晶格温度、晶格结构参数的演化规律。研究原子运动和晶格结构沿各晶向的精细变化,并推断铝薄膜内部晶格结构改变为热致和非热致效应共同作用的结果。研究铝薄膜被飞秒激光加热后内部超快热传递和晶格改变过程,在原子尺度下精细描绘铝晶格动力学图像,可为飞秒激光加工汽车用铝材料技术提供理论依据和数据支持。
- 刘栋王瑄王伟岳大光赵娟张路路张芹高尚
- 关键词：晶格动力学热传导
