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许金涛
作品数:
2
被引量:2
H指数:1
供职机构:
南京工业大学理学院
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相关领域:
生物学
医药卫生
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合作作者
赵剑
南京工业大学生物与制药工程学院
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特征提取方法
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频率域
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作者
2篇
赵剑
2篇
许金涛
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1篇
数据采集与处...
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南京工业大学...
年份
2篇
2013
共
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AAindex数据库中傅里叶方法的多重氨基酸指数选择
被引量:1
2013年
波谱学方法研究蛋白质时,蛋白质序列的特征频率与蛋白质的位点、功能、空间结构对应。基于时间序列傅里叶变换的交叉谱原理,本文提出的"一个蛋白质关于多种氨基酸指数的一致谱"能够获取一个或多个蛋白质序列较显著的特征频率,再由特征频率去筛选与之对应的氨基酸指数。该方法与Lazovic'的筛选方法和筛选意义不同。结果显示,筛选出的氨基酸指数对应的性质多数与蛋白质的空间结构性质有关。蛋白质特征频率也许是用于特征提取的好方法,氨基酸指数筛选可被看作蛋白质数字表达的一种优化。
赵剑
许金涛
关键词:
傅里叶变换
信噪比
蛋白质序列在频率域上的一种特征提取方法
被引量:1
2013年
针对不同蛋白质选取不同的氨基酸指数进行蛋白质研究,提取氨基酸序列的位置和排列信息在频率上的特征频谱作为特征向量,通过计算特征向量的距离考察蛋白质的相似性。这是一种非比对相似性的判别方法。蛋白质组的聚类结果表明,蛋白质序列在频率域上的特征提取方法具有一定的应用价值和生物学意义。
赵剑
许金涛
顾凌榕
关键词:
互相关
自相关
特征提取
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